Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 OR1A1-202ENST00000641322 3743 ntAPPRIS P1 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CHRNEQ04844 LINC01733-201ENST00000449316 4604 ntTSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
CHRNEQ04844 PPP2R5A-205ENST00000537030 1719 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
CHRNEQ04844 SERPINA7-201ENST00000327674 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
CHRNEQ04844 NOL8P1-201ENST00000508336 3529 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CHRNEQ04844 LINC02232-201ENST00000509932 4079 ntTSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
CHRNEQ04844 ZNF594-201ENST00000399604 4862 ntAPPRIS P1 BASIC3.92□□□□□ -1.78
CHRNEQ04844 AL139811.1-201ENST00000424779 2299 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CHRNEQ04844 ZNF962P-201ENST00000443465 3140 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CHRNEQ04844 LINC01902-202ENST00000636983 4607 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
CHRNEQ04844 RNU6-879P-201ENST00000364328 108 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CHRNEQ04844 RNU6-740P-201ENST00000364734 105 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CHRNEQ04844 SNORA62-201ENST00000365493 153 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CHRNEQ04844 RNU6-72P-201ENST00000384285 79 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CHRNEQ04844 AL033519.2-201ENST00000403958 392 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CHRNEQ04844 RN7SKP51-201ENST00000410781 304 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CHRNEQ04844 RPL23AP26-201ENST00000412728 464 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CHRNEQ04844 AC093382.1-201ENST00000413311 379 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
CHRNEQ04844 NDUFB4P7-201ENST00000423198 363 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CHRNEQ04844 AL732292.1-201ENST00000426692 226 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CHRNEQ04844 AC011742.1-201ENST00000431448 434 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CHRNEQ04844 CYCSP32-201ENST00000440548 321 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CHRNEQ04844 AL139383.1-203ENST00000445227 420 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
CHRNEQ04844 TPT1P12-201ENST00000448968 492 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CHRNEQ04844 AC114501.3-201ENST00000453648 164 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
CHRNEQ04844 RNU7-170P-201ENST00000459303 61 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CHRNEQ04844 AC011276.1-201ENST00000469688 323 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CHRNEQ04844 RN7SL585P-201ENST00000470538 280 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CHRNEQ04844 RPL23AP75-201ENST00000491601 451 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CHRNEQ04844 LINC02233-201ENST00000513718 358 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
CHRNEQ04844 RNA5SP73-201ENST00000516744 108 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CHRNEQ04844 TRAV8-5-201ENST00000537369 341 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CHRNEQ04844 LINC01479-202ENST00000546170 444 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
CHRNEQ04844 LINC02386-202ENST00000551287 564 ntTSL 4 BASIC3.92□□□□□ -1.78
CHRNEQ04844 UBE2Q2P8-201ENST00000560644 102 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CHRNEQ04844 AC005696.2-201ENST00000610120 626 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
CHRNEQ04844 MIR6798-201ENST00000612887 67 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CHRNEQ04844 AC099506.2-201ENST00000623074 221 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CHRNEQ04844 U6.99-201ENST00000637524 83 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CHRNEQ04844 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
CHRNEQ04844 WDR17-204ENST00000507824 4119 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
CHRNEQ04844 BRCA2-201ENST00000380152 11986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
CHRNEQ04844 RTKN2-201ENST00000315289 2383 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
CHRNEQ04844 CCNYL2-202ENST00000637719 3311 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
CHRNEQ04844 HDX-202ENST00000373177 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
CHRNEQ04844 TNPO1P3-201ENST00000436471 2662 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CHRNEQ04844 TUG1-201ENST00000519077 5673 ntTSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
CHRNEQ04844 DDX60L-201ENST00000260184 6754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
CHRNEQ04844 AC126755.2-208ENST00000327792 462 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CHRNEQ04844 AC138969.1-213ENST00000331436 462 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CHRNEQ04844 RNA5SP361-201ENST00000362686 118 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CHRNEQ04844 RNU1-14P-201ENST00000362759 152 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CHRNEQ04844 RNU6-105P-201ENST00000363909 104 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CHRNEQ04844 Y_RNA.291-201ENST00000364886 113 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CHRNEQ04844 RNA5SP240-201ENST00000365355 128 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CHRNEQ04844 RNU6-968P-201ENST00000384076 107 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CHRNEQ04844 RNU6-843P-201ENST00000384454 104 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CHRNEQ04844 MIR32-201ENST00000384965 70 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CHRNEQ04844 UBA52P6-201ENST00000399822 382 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CHRNEQ04844 MIR1179-201ENST00000408703 91 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CHRNEQ04844 RNU2-68P-201ENST00000410878 191 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CHRNEQ04844 ELOCP19-201ENST00000411919 318 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CHRNEQ04844 RPS29P17-201ENST00000430795 166 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CHRNEQ04844 AC005002.2-201ENST00000438228 269 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CHRNEQ04844 AL353705.4-201ENST00000449661 238 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CHRNEQ04844 LINC01810-201ENST00000450397 411 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
CHRNEQ04844 SNRPGP5-201ENST00000456003 220 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CHRNEQ04844 RPS29P19-201ENST00000479709 171 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CHRNEQ04844 RNU6-1278P-201ENST00000516130 107 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CHRNEQ04844 RNA5SP519-201ENST00000516480 119 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CHRNEQ04844 RNU6-1231P-201ENST00000517185 103 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CHRNEQ04844 SAMD15-202ENST00000533095 412 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
CHRNEQ04844 ZFP30-209ENST00000589018 444 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
CHRNEQ04844 LINC02532-209ENST00000602934 2464 ntTSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
CHRNEQ04844 AC016747.2-202ENST00000607743 332 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
CHRNEQ04844 AC008785.1-201ENST00000624475 456 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CHRNEQ04844 LINC01359-207ENST00000634799 487 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
CHRNEQ04844 AP003481.1-201ENST00000637808 351 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
CHRNEQ04844 AC241585.2-209ENST00000638217 143 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CHRNEQ04844 DTWD1-201ENST00000251250 13776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
CHRNEQ04844 MRPL42-206ENST00000549982 15582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
CHRNEQ04844 YWHAZ-201ENST00000353245 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
CHRNEQ04844 CLIC2-202ENST00000369449 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
CHRNEQ04844 ABCD2-201ENST00000308666 6238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
CHRNEQ04844 POSTN-202ENST00000379743 3196 ntTSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
CHRNEQ04844 RFX7-201ENST00000559447 10426 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
CHRNEQ04844 STXBP4-201ENST00000376352 15590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.78
CHRNEQ04844 RC3H2-203ENST00000373670 9248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.78
CHRNEQ04844 OTUD4P1-201ENST00000237841 3067 ntBASIC3.9□□□□□ -1.78
CHRNEQ04844 AC016687.3-202ENST00000505018 2404 ntTSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.78
CHRNEQ04844 RNU6-335P-201ENST00000364563 113 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 DEFB130A-201ENST00000400079 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 LINC01349-201ENST00000416343 497 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 AC098614.2-201ENST00000426040 255 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 DEFB130B-201ENST00000437818 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 AL356535.1-201ENST00000440335 398 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 AC016700.2-201ENST00000446011 156 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 AP000844.1-201ENST00000446631 577 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 RN7SL860P-201ENST00000473738 223 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CHRNEQ04844 AC109925.1-201ENST00000478069 331 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.9 ms