Protein–RNA interactions for Protein: O43310

CTIF, CBP80/20-dependent translation initiation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 598 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIFO43310 RNU6-266P-201ENST00000364225 107 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CTIFO43310 Y_RNA.387-201ENST00000383918 102 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CTIFO43310 MIR888-201ENST00000401186 77 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CTIFO43310 NDUFB4P4-201ENST00000404822 243 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CTIFO43310 Y_RNA.623-201ENST00000411128 95 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CTIFO43310 AL357500.1-201ENST00000413004 279 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CTIFO43310 AC023051.1-201ENST00000414098 876 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CTIFO43310 HMGN2P30-201ENST00000423237 256 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CTIFO43310 AL109947.1-201ENST00000423747 382 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CTIFO43310 C1orf195-201ENST00000424792 255 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CTIFO43310 AC098614.2-201ENST00000426040 255 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CTIFO43310 NDUFB1P2-201ENST00000449477 176 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CTIFO43310 AL353148.1-201ENST00000449761 463 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CTIFO43310 AL583843.1-201ENST00000456070 346 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CTIFO43310 SNORD19B-201ENST00000459623 84 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CTIFO43310 AC106707.2-201ENST00000484182 374 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CTIFO43310 AC104619.4-201ENST00000510773 249 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CTIFO43310 BMPR1B-AS1-201ENST00000510795 511 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CTIFO43310 RN7SKP18-201ENST00000516005 275 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CTIFO43310 Y_RNA.682-201ENST00000516457 100 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CTIFO43310 RNU6-1069P-201ENST00000516612 133 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CTIFO43310 AP003072.1-201ENST00000531740 145 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CTIFO43310 AC090592.1-203ENST00000533942 575 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CTIFO43310 AP001825.1-201ENST00000534275 351 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CTIFO43310 CASC1-205ENST00000545133 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CTIFO43310 AC099518.4-202ENST00000576433 455 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CTIFO43310 RMST_4.1-201ENST00000616886 107 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CTIFO43310 AC073308.1-201ENST00000623696 305 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CTIFO43310 ZNF415-207ENST00000595193 2479 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
CTIFO43310 AC114316.2-202ENST00000502934 2957 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CTIFO43310 ZNF680-202ENST00000447137 2159 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CTIFO43310 LIPI-203ENST00000536861 1529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
CTIFO43310 AL136164.4-201ENST00000625013 2135 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CTIFO43310 AF165147.1-201ENST00000433310 6103 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CTIFO43310 SNORD3E-201ENST00000362899 217 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CTIFO43310 Y_RNA.132-201ENST00000363421 102 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CTIFO43310 SNORA63-201ENST00000363450 132 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CTIFO43310 Y_RNA.339-201ENST00000365325 102 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CTIFO43310 Y_RNA.431-201ENST00000384086 102 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CTIFO43310 MIR34B-201ENST00000385076 84 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CTIFO43310 SNORA40C-201ENST00000391285 128 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CTIFO43310 MIR450B-201ENST00000401182 78 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CTIFO43310 RNU2-3P-201ENST00000410144 191 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CTIFO43310 RNA5SP274-201ENST00000410484 108 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CTIFO43310 Z92545.1-201ENST00000411782 234 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CTIFO43310 AC062039.1-201ENST00000414394 565 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CTIFO43310 TOMM20P4-201ENST00000427861 435 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CTIFO43310 UBE2E2-AS1-202ENST00000430018 499 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CTIFO43310 AL627311.1-201ENST00000431514 115 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CTIFO43310 RPS3AP52-201ENST00000435639 297 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CTIFO43310 AC005019.1-201ENST00000436455 431 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CTIFO43310 AL078601.1-201ENST00000444542 271 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CTIFO43310 AL109763.1-201ENST00000455391 461 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CTIFO43310 FCF1P8-201ENST00000510322 597 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CTIFO43310 RNU1-86P-201ENST00000516108 154 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CTIFO43310 RNU1-103P-201ENST00000516502 125 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CTIFO43310 RNU1-107P-201ENST00000516617 154 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CTIFO43310 SNORA25.17-201ENST00000517184 124 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CTIFO43310 RNU6-323P-201ENST00000521915 107 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CTIFO43310 AP000889.2-201ENST00000532684 490 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CTIFO43310 LINC00508-201ENST00000538901 194 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CTIFO43310 PSMA4-205ENST00000558281 773 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CTIFO43310 FRG2DP-202ENST00000566967 323 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CTIFO43310 AC087463.1-201ENST00000568541 556 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CTIFO43310 AP006219.1-201ENST00000580258 472 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CTIFO43310 MIR5692C1-201ENST00000585309 91 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CTIFO43310 AL645944.1-201ENST00000603857 493 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CTIFO43310 UBE2E2-206ENST00000613545 282 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CTIFO43310 AC126177.8-201ENST00000618339 1015 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CTIFO43310 AL359757.2-201ENST00000624309 274 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CTIFO43310 LINC01002-215ENST00000632203 314 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CTIFO43310 IL6ST-205ENST00000381294 2574 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
CTIFO43310 AC073346.2-201ENST00000624724 2058 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CTIFO43310 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
CTIFO43310 AGTR1-206ENST00000474935 1795 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CTIFO43310 RNU6-884P-201ENST00000363889 107 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CTIFO43310 RNU6-270P-201ENST00000364131 105 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CTIFO43310 Y_RNA.259-201ENST00000364619 101 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CTIFO43310 Y_RNA.324-201ENST00000365165 102 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CTIFO43310 Y_RNA.326-201ENST00000365176 113 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CTIFO43310 TRAJ59-201ENST00000390480 54 ntAPPRIS P1 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CTIFO43310 MIR548F5-201ENST00000408421 86 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CTIFO43310 RPL26P27-201ENST00000414397 437 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CTIFO43310 CYCSP33-201ENST00000414485 327 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CTIFO43310 AC099548.1-201ENST00000421443 426 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CTIFO43310 AF228730.4-201ENST00000421457 183 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CTIFO43310 U51244.1-201ENST00000423120 374 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CTIFO43310 LINC01564-201ENST00000448327 566 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CTIFO43310 RPL37P4-201ENST00000448908 268 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CTIFO43310 MTATP6P7-201ENST00000453315 681 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CTIFO43310 AC092798.1-201ENST00000458542 409 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CTIFO43310 AC087884.1-201ENST00000469738 328 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CTIFO43310 AC117503.1-201ENST00000472241 394 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CTIFO43310 HMGN1P10-201ENST00000474557 553 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CTIFO43310 AC011005.2-201ENST00000487324 359 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CTIFO43310 MTCO1P29-201ENST00000496868 288 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CTIFO43310 AC099520.1-202ENST00000503650 777 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CTIFO43310 AC096736.2-201ENST00000507972 175 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CTIFO43310 AC096721.1-201ENST00000513540 552 ntTSL 4 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CTIFO43310 LIAS-206ENST00000513731 826 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
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