Protein–RNA interactions for Protein: Q14534

SQLE, Squalene monooxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SQLEQ14534 AL360271.2-201ENST00000447710 161 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SQLEQ14534 NDUFB1P2-201ENST00000449477 176 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SQLEQ14534 SEPT14P2-201ENST00000453405 183 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SQLEQ14534 AL160162.1-201ENST00000456715 442 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
SQLEQ14534 RPS29P25-201ENST00000481709 171 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SQLEQ14534 AC022493.1-201ENST00000492984 337 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SQLEQ14534 SEPT14P4-201ENST00000513445 186 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SQLEQ14534 AC091826.1-201ENST00000514065 313 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SQLEQ14534 Y_RNA.704-201ENST00000516851 102 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SQLEQ14534 SKP1-203ENST00000517625 876 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
SQLEQ14534 AC009812.2-201ENST00000517657 457 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SQLEQ14534 FO082796.1-201ENST00000523795 183 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SQLEQ14534 AL137161.1-201ENST00000532231 390 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SQLEQ14534 AC113146.1-202ENST00000560259 433 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
SQLEQ14534 C8orf59-208ENST00000612809 475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
SQLEQ14534 U6atac.1-201ENST00000616025 117 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SQLEQ14534 AC026585.1-201ENST00000619582 524 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SQLEQ14534 ZMYM1-210ENST00000611874 4466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
SQLEQ14534 SKIL-203ENST00000426052 2757 ntTSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
SQLEQ14534 ZNF680-202ENST00000447137 2159 ntTSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
SQLEQ14534 ZCCHC10-201ENST00000324170 2178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
SQLEQ14534 ERBIN-202ENST00000380935 6692 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
SQLEQ14534 AC000403.1-201ENST00000613696 3585 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SQLEQ14534 SLC6A15-202ENST00000309283 3108 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
SQLEQ14534 RNY3P3-201ENST00000363816 102 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SQLEQ14534 RNU4-12P-201ENST00000365233 139 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SQLEQ14534 MAPK8-202ENST00000374174 739 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
SQLEQ14534 OR51A4-201ENST00000380373 1002 ntAPPRIS P1 BASIC2.66□□□□□ -1.98
SQLEQ14534 RNU1-73P-201ENST00000383971 164 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SQLEQ14534 RNU6-1127P-201ENST00000384580 107 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SQLEQ14534 SNORA40C-201ENST00000391285 128 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SQLEQ14534 NDUFS5P4-201ENST00000412983 318 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SQLEQ14534 SNRPEP10-201ENST00000420249 274 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SQLEQ14534 MTCO1P20-201ENST00000425366 358 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SQLEQ14534 AL592466.1-201ENST00000428346 307 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
SQLEQ14534 HMGB1P9-201ENST00000429856 646 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SQLEQ14534 AF124730.1-201ENST00000430001 327 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
SQLEQ14534 AL445687.1-201ENST00000439946 251 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SQLEQ14534 AC025750.2-201ENST00000442609 450 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SQLEQ14534 TRAPPC2P3-201ENST00000443200 321 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SQLEQ14534 AC092567.1-201ENST00000452397 251 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
SQLEQ14534 AL441989.1-201ENST00000454204 382 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
SQLEQ14534 AC073901.1-201ENST00000462471 408 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SQLEQ14534 AC139453.3-201ENST00000493276 369 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SQLEQ14534 AC074124.1-201ENST00000502368 375 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
SQLEQ14534 AC113155.1-201ENST00000511141 769 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SQLEQ14534 AC104136.1-201ENST00000512969 394 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SQLEQ14534 LRRC34P2-201ENST00000514850 553 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SQLEQ14534 SCGB1D5P-201ENST00000515134 247 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SQLEQ14534 RNA5SP367-201ENST00000516557 118 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SQLEQ14534 COX6CP5-201ENST00000527162 228 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SQLEQ14534 AC090124.2-201ENST00000527727 563 ntTSL 4 BASIC2.66□□□□□ -1.98
SQLEQ14534 MIR548AC-201ENST00000585049 88 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SQLEQ14534 AC104365.1-201ENST00000588835 394 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
SQLEQ14534 YWHAEP7-203ENST00000622054 312 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SQLEQ14534 AC024940.5-201ENST00000622889 474 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SQLEQ14534 DLD-214ENST00000639772 421 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
SQLEQ14534 FOXP2-210ENST00000403559 6415 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
SQLEQ14534 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
SQLEQ14534 NACAP2-201ENST00000318548 624 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SQLEQ14534 ZBTB8OSP1-201ENST00000342688 498 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SQLEQ14534 RNU6-451P-201ENST00000362921 107 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SQLEQ14534 RNU6-884P-201ENST00000363889 107 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SQLEQ14534 RNU6-1090P-201ENST00000364065 94 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SQLEQ14534 SNORA68.1-201ENST00000364537 132 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SQLEQ14534 Y_RNA.256-201ENST00000364594 104 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SQLEQ14534 RNU6-116P-201ENST00000384042 109 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SQLEQ14534 SNORA44-201ENST00000384584 132 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SQLEQ14534 USP9YP27-201ENST00000418455 438 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SQLEQ14534 AC098614.2-201ENST00000426040 255 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SQLEQ14534 AC022018.1-201ENST00000430685 241 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SQLEQ14534 GAS5-221ENST00000450589 632 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
SQLEQ14534 SNRPFP3-201ENST00000457792 225 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SQLEQ14534 TRBV1-201ENST00000476502 284 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SQLEQ14534 AC090525.1-201ENST00000479116 478 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SQLEQ14534 MGC32805-203ENST00000506053 652 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
SQLEQ14534 SNORD60.2-201ENST00000516883 86 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SQLEQ14534 SUB1P1-201ENST00000524415 382 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SQLEQ14534 AL132819.1-201ENST00000555595 208 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
SQLEQ14534 PCLAF-207ENST00000559519 749 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
SQLEQ14534 AC018904.1-201ENST00000560594 542 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
SQLEQ14534 AC007948.1-201ENST00000581632 242 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
SQLEQ14534 AL670379.4-201ENST00000605279 254 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SQLEQ14534 AL359962.2-201ENST00000610044 303 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
SQLEQ14534 AC007014.2-201ENST00000615581 479 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SQLEQ14534 NPPA-AS1_3.1-201ENST00000617059 108 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SQLEQ14534 NANOGNB-202ENST00000640040 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
SQLEQ14534 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
SQLEQ14534 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
SQLEQ14534 AC093536.2-201ENST00000565257 1406 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SQLEQ14534 ADGRG7-202ENST00000475887 2035 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
SQLEQ14534 ACTR6-212ENST00000552376 1659 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
SQLEQ14534 PHTF2-202ENST00000275575 4541 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
SQLEQ14534 RNU6-534P-201ENST00000364877 106 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SQLEQ14534 Y_RNA.399-201ENST00000383955 105 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SQLEQ14534 MIR578-201ENST00000384828 96 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SQLEQ14534 MIR514A2-201ENST00000385131 88 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SQLEQ14534 MIR514A3-201ENST00000385132 88 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SQLEQ14534 SNORD115-47-201ENST00000391226 86 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SQLEQ14534 MIR1277-201ENST00000408536 78 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
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