Protein–RNA interactions for Protein: Q13956

PDE6H, Retinal cone rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6HQ13956 ZNF886P-201ENST00000450781 723 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
PDE6HQ13956 AL353148.1-203ENST00000452286 665 ntTSL 3 BASIC0.89□□□□□ -2.27
PDE6HQ13956 AL356272.1-201ENST00000454538 832 ntTSL 2 BASIC0.89□□□□□ -2.27
PDE6HQ13956 MED28P2-201ENST00000475771 317 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
PDE6HQ13956 AC079943.2-201ENST00000488999 716 ntTSL 3 BASIC0.89□□□□□ -2.27
PDE6HQ13956 LINC02101-201ENST00000505861 725 ntTSL 4 BASIC0.89□□□□□ -2.27
PDE6HQ13956 AC025524.2-211ENST00000519990 1173 ntTSL 1 (best) BASIC0.89□□□□□ -2.27
PDE6HQ13956 MTND1P36-201ENST00000522384 936 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
PDE6HQ13956 CARD18-203ENST00000532895 422 ntTSL 2 BASIC0.89□□□□□ -2.27
PDE6HQ13956 AL139193.1-201ENST00000554967 539 ntTSL 4 BASIC0.89□□□□□ -2.27
PDE6HQ13956 AC020661.3-201ENST00000558101 414 ntTSL 3 BASIC0.89□□□□□ -2.27
PDE6HQ13956 AC023906.2-201ENST00000558343 462 ntTSL 3 BASIC0.89□□□□□ -2.27
PDE6HQ13956 ACTG1P17-203ENST00000561222 537 ntTSL 3 BASIC0.89□□□□□ -2.27
PDE6HQ13956 AC025678.1-201ENST00000567861 338 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
PDE6HQ13956 MIR4421-201ENST00000578133 69 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
PDE6HQ13956 AC069061.2-202ENST00000580280 357 ntTSL 3 BASIC0.89□□□□□ -2.27
PDE6HQ13956 ZNF573-209ENST00000585724 453 ntTSL 5 BASIC0.89□□□□□ -2.27
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PDE6HQ13956 AC099811.4-201ENST00000592536 496 ntTSL 2 BASIC0.89□□□□□ -2.27
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PDE6HQ13956 AL358072.1-201ENST00000604156 575 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
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PDE6HQ13956 AL512598.1-201ENST00000610158 273 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
PDE6HQ13956 AC018926.1-201ENST00000616335 435 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
PDE6HQ13956 UHRF1BP1L-203ENST00000545232 4088 ntTSL 1 (best) BASIC0.89□□□□□ -2.27
PDE6HQ13956 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
PDE6HQ13956 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.88□□□□□ -2.27
PDE6HQ13956 AL161668.1-201ENST00000320322 358 ntTSL 1 (best) BASIC0.88□□□□□ -2.27
PDE6HQ13956 RNU6-1010P-201ENST00000362757 107 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
PDE6HQ13956 RNU6-743P-201ENST00000364151 106 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
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PDE6HQ13956 MIR301A-201ENST00000385261 86 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
PDE6HQ13956 SNORA40C-201ENST00000391285 128 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
PDE6HQ13956 BTF3L4P2-201ENST00000392798 346 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
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PDE6HQ13956 LINC00459-201ENST00000431656 376 ntTSL 2 BASIC0.88□□□□□ -2.27
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PDE6HQ13956 FCF1P10-201ENST00000407590 479 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
PDE6HQ13956 MIR1289-2-201ENST00000408360 111 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
PDE6HQ13956 RNU2-36P-201ENST00000410361 191 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
PDE6HQ13956 RNU6-1025P-201ENST00000410629 104 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
PDE6HQ13956 SRIP3-201ENST00000413200 219 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
PDE6HQ13956 AC016831.2-201ENST00000417179 352 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
PDE6HQ13956 AL157786.1-206ENST00000424422 551 ntTSL 3 BASIC0.87□□□□□ -2.27
PDE6HQ13956 AL592466.1-201ENST00000428346 307 ntTSL 5 BASIC0.87□□□□□ -2.27
PDE6HQ13956 LINC02336-201ENST00000434117 330 ntTSL 3 BASIC0.87□□□□□ -2.27
PDE6HQ13956 AL138900.1-201ENST00000449345 399 ntTSL 3 BASIC0.87□□□□□ -2.27
PDE6HQ13956 ITGA9-AS1-208ENST00000449586 726 ntTSL 3 BASIC0.87□□□□□ -2.27
PDE6HQ13956 AL157400.4-201ENST00000455699 667 ntTSL 1 (best) BASIC0.87□□□□□ -2.27
PDE6HQ13956 snoU13.26-201ENST00000459452 105 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
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PDE6HQ13956 AC108729.1-201ENST00000487812 947 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
PDE6HQ13956 AC106821.1-201ENST00000502861 572 ntTSL 5 BASIC0.87□□□□□ -2.27
PDE6HQ13956 AC097467.1-201ENST00000513660 370 ntTSL 5 BASIC0.87□□□□□ -2.27
PDE6HQ13956 ZNF706-202ENST00000517844 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC0.87□□□□□ -2.27
PDE6HQ13956 AC107882.1-201ENST00000530837 477 ntTSL 3 BASIC0.87□□□□□ -2.27
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