Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 AL353898.1-201ENST00000444055 238 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
CENPEQ02224 PGBD4P5-201ENST00000445958 426 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
CENPEQ02224 AC087588.1-201ENST00000462203 316 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
CENPEQ02224 AC005920.2-201ENST00000509833 332 ntTSL 3 BASIC-0.21□□□□□ -2.44
CENPEQ02224 MTATP6P9-201ENST00000515039 680 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
CENPEQ02224 AC090124.1-201ENST00000525097 448 ntTSL 3 BASIC-0.21□□□□□ -2.44
CENPEQ02224 MRPS36P4-201ENST00000534436 298 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
CENPEQ02224 LINC02290-203ENST00000556662 577 ntTSL 4 BASIC-0.21□□□□□ -2.44
CENPEQ02224 LINC02562-201ENST00000561705 785 ntTSL 2 BASIC-0.21□□□□□ -2.44
CENPEQ02224 OR1M4P-201ENST00000589199 287 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
CENPEQ02224 AC092106.3-201ENST00000611308 722 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
CENPEQ02224 C8orf59-212ENST00000615697 483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC-0.21□□□□□ -2.44
CENPEQ02224 MIR4315-1-201ENST00000636800 73 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
CENPEQ02224 MIR4315-2-201ENST00000640925 73 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
CENPEQ02224 RNU6-1237P-201ENST00000384777 107 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
CENPEQ02224 FCF1P6-201ENST00000456841 595 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
CENPEQ02224 AC004884.2-201ENST00000476569 546 ntTSL 4 BASIC-0.21□□□□□ -2.44
CENPEQ02224 AC021736.1-201ENST00000521143 563 ntTSL 4 BASIC-0.21□□□□□ -2.44
CENPEQ02224 AP002453.2-201ENST00000533503 320 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
CENPEQ02224 MIR4422-201ENST00000581938 83 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
CENPEQ02224 AC007363.1-201ENST00000604736 620 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
CENPEQ02224 AC110792.4-201ENST00000609843 298 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
CENPEQ02224 AP003399.1-201ENST00000637534 361 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
CENPEQ02224 RNU6-160P-201ENST00000384591 107 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
CENPEQ02224 MIR196A2-201ENST00000385189 110 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
CENPEQ02224 AL138737.1-202ENST00000418834 876 ntTSL 3 BASIC-0.22□□□□□ -2.44
CENPEQ02224 AC092423.1-201ENST00000430165 186 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
CENPEQ02224 AL096803.2-201ENST00000450032 677 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
CENPEQ02224 U8.21-201ENST00000459536 136 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
CENPEQ02224 AC135999.1-201ENST00000478962 479 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
CENPEQ02224 AC093534.1-201ENST00000504977 132 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
CENPEQ02224 AC090616.5-201ENST00000581225 299 ntTSL 5 BASIC-0.22□□□□□ -2.44
CENPEQ02224 AC091132.5-202ENST00000587078 501 ntTSL 3 BASIC-0.22□□□□□ -2.44
CENPEQ02224 AC008147.4-201ENST00000617570 1204 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
CENPEQ02224 SATB1-AS1-237ENST00000626982 735 ntTSL 5 BASIC-0.22□□□□□ -2.44
CENPEQ02224 AC106858.1-201ENST00000637497 429 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
CENPEQ02224 AL391994.1-201ENST00000254724 282 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
CENPEQ02224 RPS3AP24-201ENST00000407896 734 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
CENPEQ02224 RNFT1P2-201ENST00000443064 757 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
CENPEQ02224 AL353691.1-201ENST00000451332 387 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
CENPEQ02224 Y_RNA.684-201ENST00000516510 99 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
CENPEQ02224 RNU6-902P-201ENST00000517212 91 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
CENPEQ02224 AC004584.2-201ENST00000570407 410 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
CENPEQ02224 MIR3616-201ENST00000584070 92 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
CENPEQ02224 DCAF17-212ENST00000611110 975 ntTSL 1 (best) BASIC-0.22□□□□□ -2.44
CENPEQ02224 AL590240.4-201ENST00000616908 390 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
CENPEQ02224 LINC01938-201ENST00000521341 1864 ntTSL 2 BASIC-0.22□□□□□ -2.45
CENPEQ02224 RNY4P7-201ENST00000364600 96 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.45
CENPEQ02224 AL359081.1-201ENST00000432083 615 ntTSL 2 BASIC-0.22□□□□□ -2.45
CENPEQ02224 AL591501.1-201ENST00000439992 495 ntTSL 5 BASIC-0.22□□□□□ -2.45
CENPEQ02224 AC016751.2-201ENST00000453206 280 ntTSL 5 BASIC-0.22□□□□□ -2.45
CENPEQ02224 AC010631.1-201ENST00000474150 156 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.45
CENPEQ02224 AP000797.1-201ENST00000478870 387 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.45
CENPEQ02224 AC022493.2-201ENST00000506122 481 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.45
CENPEQ02224 AC104136.1-201ENST00000512969 394 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.45
CENPEQ02224 AC087272.1-201ENST00000523624 533 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.45
CENPEQ02224 AC087685.1-201ENST00000587507 141 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.45
CENPEQ02224 AC073544.2-201ENST00000601155 540 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.45
CENPEQ02224 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.45
CENPEQ02224 SAMSN1-202ENST00000400564 1382 ntTSL 1 (best) BASIC-0.23□□□□□ -2.45
CENPEQ02224 RNA5SP219-201ENST00000390940 113 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
CENPEQ02224 PDC-202ENST00000497198 1174 ntTSL 1 (best) BASIC-0.23□□□□□ -2.45
CENPEQ02224 AC114811.1-201ENST00000507207 168 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
CENPEQ02224 AC097467.3-213ENST00000508191 726 ntTSL 3 BASIC-0.23□□□□□ -2.45
CENPEQ02224 KRTAP13-6P-201ENST00000508999 371 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
CENPEQ02224 AC121334.2-201ENST00000605387 271 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
CENPEQ02224 AL590410.1-201ENST00000617925 333 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
CENPEQ02224 ZEB2_AS1_1.1-201ENST00000621504 128 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
CENPEQ02224 RNU6-1097P-201ENST00000363586 107 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
CENPEQ02224 MIR506-201ENST00000384998 124 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
CENPEQ02224 MIR30A-201ENST00000385092 71 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
CENPEQ02224 RNU6-952P-201ENST00000391164 108 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
CENPEQ02224 CALM2P3-201ENST00000400429 449 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
CENPEQ02224 SNORD75.1-201ENST00000408373 60 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
CENPEQ02224 LINC02331-201ENST00000418927 602 ntTSL 5 BASIC-0.23□□□□□ -2.45
CENPEQ02224 Z99289.1-206ENST00000425503 393 ntTSL 3 BASIC-0.23□□□□□ -2.45
CENPEQ02224 AP000146.1-202ENST00000441666 441 ntTSL 3 BASIC-0.23□□□□□ -2.45
CENPEQ02224 CASP3P1-201ENST00000446037 609 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
CENPEQ02224 AL583803.1-201ENST00000454262 334 ntTSL 3 BASIC-0.23□□□□□ -2.45
CENPEQ02224 RPL7P43-201ENST00000478876 753 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
CENPEQ02224 AC130650.1-201ENST00000570581 415 ntTSL 2 BASIC-0.23□□□□□ -2.45
CENPEQ02224 MIR4441-201ENST00000582623 100 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
CENPEQ02224 MIR4713-201ENST00000582691 75 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
CENPEQ02224 AC138749.5-201ENST00000611461 208 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
CENPEQ02224 FTX_2.1-201ENST00000618816 94 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
CENPEQ02224 AL049545.1-201ENST00000401856 572 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
CENPEQ02224 RN7SKP266-201ENST00000410232 287 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
CENPEQ02224 Y_RNA.616-201ENST00000410835 95 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
CENPEQ02224 PTGES3P4-201ENST00000426243 356 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
CENPEQ02224 AL050338.1-201ENST00000445585 786 ntTSL 3 BASIC-0.24□□□□□ -2.45
CENPEQ02224 AC011092.2-201ENST00000533659 586 ntTSL 1 (best) BASIC-0.24□□□□□ -2.45
CENPEQ02224 ZFAND6P1-201ENST00000434138 605 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
CENPEQ02224 snoU13.9-201ENST00000458927 103 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
CENPEQ02224 AC090616.5-202ENST00000582111 297 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
CENPEQ02224 BNIP3P25-201ENST00000596023 559 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
CENPEQ02224 AC097065.2-201ENST00000608159 533 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
CENPEQ02224 RNU6-1263P-201ENST00000384601 106 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
CENPEQ02224 AC009276.1-201ENST00000422042 253 ntTSL 5 BASIC-0.25□□□□□ -2.45
CENPEQ02224 RAC1P8-201ENST00000427086 527 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
CENPEQ02224 AC116035.1-201ENST00000431057 517 ntTSL 3 BASIC-0.25□□□□□ -2.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 128.6 ms