Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 AL157882.1-201ENST00000447148 429 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
COPS7AQ9UBW8 AC104058.1-201ENST00000448028 297 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
COPS7AQ9UBW8 AC046136.1-201ENST00000459855 533 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
COPS7AQ9UBW8 MED28P2-201ENST00000475771 317 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
COPS7AQ9UBW8 MTAPP1-201ENST00000489154 819 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
COPS7AQ9UBW8 PLCXD2-AS1-201ENST00000493131 491 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
COPS7AQ9UBW8 SMURF2P1-201ENST00000514992 481 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
COPS7AQ9UBW8 AP004607.1-201ENST00000524456 203 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
COPS7AQ9UBW8 AC006504.5-204ENST00000592404 765 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
COPS7AQ9UBW8 AC073114.1-201ENST00000612027 490 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
COPS7AQ9UBW8 AC011155.2-201ENST00000623202 216 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
COPS7AQ9UBW8 AC068631.1-221ENST00000626006 592 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
COPS7AQ9UBW8 CYP3A43-217ENST00000631161 328 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
COPS7AQ9UBW8 AL355596.1-201ENST00000565399 3996 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
COPS7AQ9UBW8 TSGA10-205ENST00000410001 3036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
COPS7AQ9UBW8 OGN-202ENST00000375561 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
COPS7AQ9UBW8 AC009975.1-201ENST00000634588 2698 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
COPS7AQ9UBW8 OR6C76-201ENST00000328314 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.28□□□□□ -2.04
COPS7AQ9UBW8 Y_RNA.201-201ENST00000364052 96 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
COPS7AQ9UBW8 U3.12-201ENST00000364498 214 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
COPS7AQ9UBW8 SNORA67.1-201ENST00000364749 141 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
COPS7AQ9UBW8 RNU6-843P-201ENST00000384454 104 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
COPS7AQ9UBW8 MIR518C-201ENST00000384822 101 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
COPS7AQ9UBW8 MIR454-201ENST00000390180 115 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
COPS7AQ9UBW8 AL133475.1-201ENST00000404414 305 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
COPS7AQ9UBW8 MIR1302-8-201ENST00000408342 128 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
COPS7AQ9UBW8 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
COPS7AQ9UBW8 RNA5SP111-201ENST00000411386 101 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
COPS7AQ9UBW8 AC105271.1-202ENST00000411417 445 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
COPS7AQ9UBW8 AC002456.1-201ENST00000415965 317 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
COPS7AQ9UBW8 AC007463.1-201ENST00000416534 734 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
COPS7AQ9UBW8 CYCSP48-201ENST00000417124 323 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
COPS7AQ9UBW8 PIGFP2-201ENST00000421400 651 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
COPS7AQ9UBW8 LINC00844-201ENST00000432535 477 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
COPS7AQ9UBW8 AC020594.1-201ENST00000437680 338 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
COPS7AQ9UBW8 AC018693.1-201ENST00000442829 550 ntTSL 4 BASIC2.28□□□□□ -2.04
COPS7AQ9UBW8 LINC02195-201ENST00000443373 294 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
COPS7AQ9UBW8 AC079448.1-201ENST00000449377 373 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
COPS7AQ9UBW8 AC073901.1-201ENST00000462471 408 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
COPS7AQ9UBW8 AC117503.1-201ENST00000472241 394 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
COPS7AQ9UBW8 AC023794.1-201ENST00000504210 403 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
COPS7AQ9UBW8 AC104806.1-201ENST00000508720 308 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
COPS7AQ9UBW8 AC117460.1-201ENST00000508964 467 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
COPS7AQ9UBW8 LINC02501-201ENST00000510420 426 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
COPS7AQ9UBW8 AC074131.1-201ENST00000514662 253 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
COPS7AQ9UBW8 AP005902.1-201ENST00000521358 186 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
COPS7AQ9UBW8 AC127894.1-201ENST00000548266 851 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
COPS7AQ9UBW8 CR383656.8-201ENST00000549046 145 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
COPS7AQ9UBW8 AL512791.1-201ENST00000555853 300 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
COPS7AQ9UBW8 LINC01195-201ENST00000570118 451 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
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COPS7AQ9UBW8 RPS15AP11-201ENST00000594193 385 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
COPS7AQ9UBW8 AL670379.4-201ENST00000605279 254 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
COPS7AQ9UBW8 AC109347.2-201ENST00000610220 349 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
COPS7AQ9UBW8 AC009233.1-201ENST00000616477 371 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
COPS7AQ9UBW8 IGHVIII-44-202ENST00000636235 289 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
COPS7AQ9UBW8 MIR3974-201ENST00000637126 96 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
COPS7AQ9UBW8 ZNF280D-204ENST00000558320 3666 ntTSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
COPS7AQ9UBW8 AC006020.1-201ENST00000420179 1854 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
COPS7AQ9UBW8 HAUS6P2-201ENST00000433254 2404 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
COPS7AQ9UBW8 CCPG1-203ENST00000442196 3453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
COPS7AQ9UBW8 SNORA38-201ENST00000363946 132 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
COPS7AQ9UBW8 RNU6-282P-201ENST00000365357 103 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
COPS7AQ9UBW8 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
COPS7AQ9UBW8 OR6C66P-201ENST00000414917 930 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
COPS7AQ9UBW8 AC010731.2-201ENST00000415275 440 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
COPS7AQ9UBW8 RPL21P90-201ENST00000415692 466 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
COPS7AQ9UBW8 BX295541.1-201ENST00000417774 250 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
COPS7AQ9UBW8 AC012370.1-201ENST00000419244 530 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
COPS7AQ9UBW8 AL356134.1-201ENST00000419815 373 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
COPS7AQ9UBW8 LINC02559-201ENST00000420391 188 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
COPS7AQ9UBW8 AC133104.1-201ENST00000429100 218 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
COPS7AQ9UBW8 PCDH9-AS1-201ENST00000430861 532 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
COPS7AQ9UBW8 AC000111.3-201ENST00000433478 193 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
COPS7AQ9UBW8 AC098826.1-201ENST00000433943 471 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
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COPS7AQ9UBW8 AC091153.2-202ENST00000441700 384 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
COPS7AQ9UBW8 CALM1P1-201ENST00000442082 433 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
COPS7AQ9UBW8 AL118523.1-201ENST00000444436 480 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
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COPS7AQ9UBW8 AP000705.1-201ENST00000454567 350 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
COPS7AQ9UBW8 snoU109.2-201ENST00000459316 135 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
COPS7AQ9UBW8 AC112771.1-201ENST00000463581 102 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
COPS7AQ9UBW8 LINC02101-201ENST00000505861 725 ntTSL 4 BASIC2.27□□□□□ -2.05
COPS7AQ9UBW8 AC010486.1-201ENST00000511793 424 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
COPS7AQ9UBW8 AC091965.2-201ENST00000512324 613 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
COPS7AQ9UBW8 SNORA25.11-201ENST00000515935 105 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
COPS7AQ9UBW8 RNU1-86P-201ENST00000516108 154 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
COPS7AQ9UBW8 RNU1-107P-201ENST00000516617 154 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
COPS7AQ9UBW8 OR5AL2P-201ENST00000532185 920 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
COPS7AQ9UBW8 AC090023.1-201ENST00000545750 443 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
COPS7AQ9UBW8 POC1B-211ENST00000549504 581 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
COPS7AQ9UBW8 AL133241.1-201ENST00000556832 487 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
COPS7AQ9UBW8 AC136619.2-201ENST00000563361 631 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
COPS7AQ9UBW8 AC087752.4-201ENST00000605911 462 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
COPS7AQ9UBW8 AC006566.1-201ENST00000608943 513 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
COPS7AQ9UBW8 AL158063.1-201ENST00000615349 536 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
COPS7AQ9UBW8 RMST_4.1-201ENST00000616886 107 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
COPS7AQ9UBW8 SCARNA4-202ENST00000625402 129 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
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