Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 LIPI-203ENST00000536861 1529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 CFH-202ENST00000367429 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 AC022336.2-201ENST00000568966 2538 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 SCN7A-201ENST00000409855 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.22-201ENST00000362492 102 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 RNU6-960P-201ENST00000364056 120 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 RNU4-91P-201ENST00000364778 135 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 RNU6-169P-201ENST00000365336 107 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.359-201ENST00000365498 102 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 RNU6-641P-201ENST00000384006 107 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 RNU6-348P-201ENST00000384386 107 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.553-201ENST00000384670 102 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 5S_rRNA.2-201ENST00000391293 112 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 AP003170.3-201ENST00000399123 158 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 RNU2-49P-201ENST00000410666 184 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 RNU2-8P-201ENST00000410727 190 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 AC023141.4-201ENST00000412031 328 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 LINC01312-201ENST00000412745 775 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 LINC01780-201ENST00000420059 442 ntTSL 2 BASIC1.94□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 ACTR3BP6-201ENST00000422332 1241 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 MTCO3P30-201ENST00000426425 670 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 AL365496.1-201ENST00000426885 215 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 AC137499.1-201ENST00000427602 88 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 AL356277.3-201ENST00000432484 618 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 AL591212.2-201ENST00000433923 257 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 AC112518.1-201ENST00000436089 575 ntTSL 4 BASIC1.94□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 RPS24P1-201ENST00000438550 371 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 AC073614.1-201ENST00000438690 650 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 AC110995.1-201ENST00000444185 628 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 LINC01758-201ENST00000448001 458 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 AC104058.1-201ENST00000448028 297 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 MTND1P27-201ENST00000451117 902 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 RPS15AP34-201ENST00000487776 387 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 RPL39P36-201ENST00000490784 156 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 RPS27AP10-201ENST00000496103 208 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 AC082650.1-201ENST00000503542 575 ntTSL 4 BASIC1.94□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 AC093534.1-201ENST00000504977 132 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 AC025755.1-201ENST00000521306 278 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 HTN3-202ENST00000526767 578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 AC008115.2-201ENST00000539988 241 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 AL049775.2-201ENST00000557547 558 ntTSL 4 BASIC1.94□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 AC012378.1-201ENST00000561155 364 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 AC006362.1-201ENST00000567392 174 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 AC016229.1-201ENST00000589242 487 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 RNASEH2B-AS1-206ENST00000601286 657 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 MIR98-201ENST00000606724 119 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 AC022893.3-201ENST00000607665 437 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 AC006566.1-201ENST00000608943 513 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 AL365204.3-201ENST00000612448 685 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 AC008498.1-201ENST00000613012 531 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 AC010678.1-201ENST00000614118 713 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 YWHAEP7-203ENST00000622054 312 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 AC008781.3-201ENST00000622826 335 ntTSL 2 BASIC1.94□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 AL512643.1-201ENST00000635735 524 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 ZNF355P-201ENST00000427301 3216 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 AC009487.4-201ENST00000624969 3585 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 EMCN-202ENST00000305864 1575 ntTSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 KPNA2P1-201ENST00000458289 1591 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 ZNF72P-201ENST00000425869 1908 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 FARSBP1-201ENST00000435808 1778 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.77-201ENST00000362962 107 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 RNU6-778P-201ENST00000363269 103 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 RNY1P12-201ENST00000364251 105 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 SNORA4.3-201ENST00000365564 137 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 SNORD116-9-201ENST00000384000 95 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 RNU6-190P-201ENST00000384154 102 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 SNORA75-201ENST00000384158 137 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 SNORD116-3-201ENST00000384287 95 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 SNORD116-7-201ENST00000384404 95 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 SNORD116-5-201ENST00000384462 95 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 MIR558-201ENST00000384920 94 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 MIR767-201ENST00000390228 109 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 RNU6-817P-201ENST00000391083 104 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 RNA5SP354-201ENST00000391247 136 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 MIR888-201ENST00000401186 77 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 AL355497.1-201ENST00000406262 551 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 SPATA17-AS1-201ENST00000415765 420 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 C1DP2-201ENST00000418167 426 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 AL138737.1-202ENST00000418834 876 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 MTCO2P34-201ENST00000421994 607 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 AC027124.2-201ENST00000428249 105 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 SRIP2-201ENST00000428470 166 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 RPL23AP30-201ENST00000432419 501 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 MTATP6P26-201ENST00000445926 662 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 LINC01162-201ENST00000447262 447 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 HMGN2P23-201ENST00000456759 269 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 RPL31P3-201ENST00000458430 332 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 RNU6-717P-201ENST00000459076 104 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 AC025033.1-201ENST00000463883 194 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 AC090515.1-201ENST00000465295 476 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 AC117386.2-202ENST00000472821 522 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 AC022272.1-201ENST00000503478 777 ntTSL 2 BASIC1.93□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 AC012055.2-201ENST00000504167 335 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 AL136537.1-201ENST00000508199 538 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
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