Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 AC024581.2-201ENST00000619986 252 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
LRRIQ1Q96JM4 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
LRRIQ1Q96JM4 MYCBP2-AS1-209ENST00000631152 412 ntTSL 5 BASIC0.36□□□□□ -2.35
LRRIQ1Q96JM4 AC138393.1-203ENST00000327086 343 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
LRRIQ1Q96JM4 Y_RNA.60-201ENST00000362831 98 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
LRRIQ1Q96JM4 MIR1265-201ENST00000408444 86 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
LRRIQ1Q96JM4 RNA5SP25-201ENST00000410815 110 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
LRRIQ1Q96JM4 AL049734.2-201ENST00000441066 616 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
LRRIQ1Q96JM4 MTCO1P53-201ENST00000441633 699 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
LRRIQ1Q96JM4 AL390961.1-201ENST00000446557 319 ntTSL 2 BASIC0.35□□□□□ -2.35
LRRIQ1Q96JM4 CYP2C59P-201ENST00000457790 269 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
LRRIQ1Q96JM4 AC135457.1-201ENST00000503553 664 ntTSL 3 BASIC0.35□□□□□ -2.35
LRRIQ1Q96JM4 AL136038.2-201ENST00000553983 283 ntTSL 3 BASIC0.35□□□□□ -2.35
LRRIQ1Q96JM4 AC012669.1-201ENST00000603209 283 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
LRRIQ1Q96JM4 AL022345.2-201ENST00000606307 135 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
LRRIQ1Q96JM4 AL627230.5-201ENST00000619807 58 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
LRRIQ1Q96JM4 USP12-203ENST00000620323 349 ntTSL 3 BASIC0.35□□□□□ -2.35
LRRIQ1Q96JM4 MIR338-201ENST00000636369 67 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
LRRIQ1Q96JM4 XRCC4-202ENST00000338635 1579 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC0.35□□□□□ -2.35
LRRIQ1Q96JM4 OFD1P13Y-201ENST00000431179 1232 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
LRRIQ1Q96JM4 MTCO2P20-201ENST00000437339 673 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
LRRIQ1Q96JM4 MTND4P6-201ENST00000438297 472 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
LRRIQ1Q96JM4 AL049714.1-201ENST00000466686 347 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
LRRIQ1Q96JM4 AC006512.1-201ENST00000468816 291 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
LRRIQ1Q96JM4 AL163195.1-201ENST00000496941 348 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
LRRIQ1Q96JM4 MIR5190-201ENST00000581537 80 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
LRRIQ1Q96JM4 AC073569.3-201ENST00000619055 682 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
LRRIQ1Q96JM4 AL359854.1-201ENST00000614203 1594 ntBASIC0.34□□□□□ -2.35
LRRIQ1Q96JM4 SNORA25-201ENST00000384384 134 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
LRRIQ1Q96JM4 AC064852.1-201ENST00000427571 851 ntTSL 3 BASIC0.34□□□□□ -2.36
LRRIQ1Q96JM4 AL133481.3-201ENST00000456546 333 ntTSL 3 BASIC0.34□□□□□ -2.36
LRRIQ1Q96JM4 RNU6-1308P-201ENST00000516817 103 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
LRRIQ1Q96JM4 AC090510.1-201ENST00000567456 425 ntTSL 3 BASIC0.34□□□□□ -2.36
LRRIQ1Q96JM4 AC073544.2-201ENST00000601155 540 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
LRRIQ1Q96JM4 AC004492.1-201ENST00000607036 742 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
LRRIQ1Q96JM4 AC091965.5-201ENST00000624785 342 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
LRRIQ1Q96JM4 RGS13-201ENST00000391995 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.34□□□□□ -2.36
LRRIQ1Q96JM4 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC0.33□□□□□ -2.36
LRRIQ1Q96JM4 RPS25P9-201ENST00000435591 252 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
LRRIQ1Q96JM4 COX6CP6-201ENST00000490840 228 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
LRRIQ1Q96JM4 SNORA4.4-201ENST00000515921 135 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
LRRIQ1Q96JM4 AC018659.1-201ENST00000551083 169 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
LRRIQ1Q96JM4 RNA5SP327-201ENST00000362494 101 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
LRRIQ1Q96JM4 RNU6-989P-201ENST00000362756 107 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
LRRIQ1Q96JM4 RNU6-105P-201ENST00000363909 104 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
LRRIQ1Q96JM4 FAM206A-202ENST00000374624 499 ntTSL 3 BASIC0.33□□□□□ -2.36
LRRIQ1Q96JM4 RNU6-1226P-201ENST00000384317 107 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
LRRIQ1Q96JM4 MIR325-201ENST00000385260 98 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
LRRIQ1Q96JM4 TSPY5P-202ENST00000456541 142 ntTSL 3 BASIC0.33□□□□□ -2.36
LRRIQ1Q96JM4 AC108729.1-201ENST00000487812 947 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
LRRIQ1Q96JM4 BLNK-209ENST00000495266 440 ntTSL 5 BASIC0.33□□□□□ -2.36
LRRIQ1Q96JM4 RNU6ATAC13P-201ENST00000516152 131 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
LRRIQ1Q96JM4 AC090124.2-201ENST00000527727 563 ntTSL 4 BASIC0.33□□□□□ -2.36
LRRIQ1Q96JM4 AP003034.1-201ENST00000534621 422 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
LRRIQ1Q96JM4 AC215217.1-201ENST00000562162 347 ntTSL 3 BASIC0.33□□□□□ -2.36
LRRIQ1Q96JM4 AL138726.1-201ENST00000614873 333 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
LRRIQ1Q96JM4 AC012361.1-201ENST00000447260 1498 ntTSL 1 (best) BASIC0.32□□□□□ -2.36
LRRIQ1Q96JM4 AC069228.1-201ENST00000546936 1615 ntTSL 3 BASIC0.32□□□□□ -2.36
LRRIQ1Q96JM4 Y_RNA.167-201ENST00000363735 109 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
LRRIQ1Q96JM4 TTTY3-201ENST00000417334 344 ntTSL 1 (best) BASIC0.32□□□□□ -2.36
LRRIQ1Q96JM4 AL158834.1-201ENST00000419441 466 ntTSL 5 BASIC0.32□□□□□ -2.36
LRRIQ1Q96JM4 AC006041.1-201ENST00000425322 328 ntTSL 3 BASIC0.32□□□□□ -2.36
LRRIQ1Q96JM4 LINC01473-202ENST00000427108 695 ntTSL 5 BASIC0.32□□□□□ -2.36
LRRIQ1Q96JM4 AC023512.1-201ENST00000444513 499 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
LRRIQ1Q96JM4 AC025465.3-201ENST00000510570 311 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
LRRIQ1Q96JM4 RNU4-54P-201ENST00000516428 129 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
LRRIQ1Q96JM4 AC012414.6-201ENST00000568241 401 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
LRRIQ1Q96JM4 AC002400.1-201ENST00000569310 726 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
LRRIQ1Q96JM4 AC092071.1-201ENST00000597260 549 ntTSL 5 BASIC0.32□□□□□ -2.36
LRRIQ1Q96JM4 AL161729.4-201ENST00000604650 476 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
LRRIQ1Q96JM4 AC013468.1-201ENST00000608680 598 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
LRRIQ1Q96JM4 AC009233.1-201ENST00000616477 371 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
LRRIQ1Q96JM4 TTTY3B-201ENST00000631331 344 ntTSL 1 (best) BASIC0.32□□□□□ -2.36
LRRIQ1Q96JM4 Y_RNA.62-201ENST00000362840 99 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
LRRIQ1Q96JM4 RPL21P24-201ENST00000413752 448 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
LRRIQ1Q96JM4 RPS3AP37-201ENST00000419176 745 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
LRRIQ1Q96JM4 MTND1P16-201ENST00000465177 898 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
LRRIQ1Q96JM4 AC093766.1-202ENST00000513400 718 ntTSL 3 BASIC0.31□□□□□ -2.36
LRRIQ1Q96JM4 OR5AK1P-201ENST00000524837 922 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
LRRIQ1Q96JM4 HTN3-202ENST00000526767 578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.31□□□□□ -2.36
LRRIQ1Q96JM4 LINC02384-205ENST00000539404 785 ntTSL 3 BASIC0.31□□□□□ -2.36
LRRIQ1Q96JM4 ADAM3B-201ENST00000569937 840 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
LRRIQ1Q96JM4 AC091132.5-202ENST00000587078 501 ntTSL 3 BASIC0.31□□□□□ -2.36
LRRIQ1Q96JM4 LINC00907-210ENST00000593316 847 ntTSL 3 BASIC0.31□□□□□ -2.36
LRRIQ1Q96JM4 MTND4LP5-201ENST00000605152 292 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
LRRIQ1Q96JM4 RNU6-110P-201ENST00000384508 104 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
LRRIQ1Q96JM4 Y_RNA.549-201ENST00000384657 102 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
LRRIQ1Q96JM4 MED14P1-201ENST00000430517 648 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
LRRIQ1Q96JM4 TAAR7P-201ENST00000436141 242 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
LRRIQ1Q96JM4 SPIN4-AS1-201ENST00000451979 426 ntTSL 2 BASIC0.3□□□□□ -2.36
LRRIQ1Q96JM4 AL034345.2-203ENST00000453417 383 ntTSL 3 BASIC0.3□□□□□ -2.36
LRRIQ1Q96JM4 BOLA3P3-201ENST00000505182 232 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
LRRIQ1Q96JM4 RNU6-1095P-201ENST00000516148 108 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
LRRIQ1Q96JM4 MIR4667-201ENST00000578933 66 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
LRRIQ1Q96JM4 MIR4802-201ENST00000581881 80 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
LRRIQ1Q96JM4 AL022345.1-201ENST00000607292 135 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
LRRIQ1Q96JM4 AC005021.1-201ENST00000608730 355 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
LRRIQ1Q96JM4 uc_338.22-201ENST00000622722 187 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
LRRIQ1Q96JM4 Z95118.1-201ENST00000421372 247 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
LRRIQ1Q96JM4 YWHAZP8-201ENST00000436935 731 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.5 ms