Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 AL354733.1-203ENST00000417672 495 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
CDKN3Q16667 AC092660.1-201ENST00000420648 371 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
CDKN3Q16667 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CDKN3Q16667 AL139397.1-201ENST00000430456 644 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
CDKN3Q16667 MTATP6P17-201ENST00000431030 672 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CDKN3Q16667 AC023590.1-204ENST00000434023 431 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
CDKN3Q16667 AC073614.1-201ENST00000438690 650 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CDKN3Q16667 AC009961.3-201ENST00000449832 765 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CDKN3Q16667 AC069549.1-201ENST00000451584 499 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
CDKN3Q16667 LINC00894-208ENST00000455777 284 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
CDKN3Q16667 TSPY5P-202ENST00000456541 142 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
CDKN3Q16667 AC080013.2-201ENST00000460866 323 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CDKN3Q16667 FAM92A1P2-202ENST00000504766 877 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CDKN3Q16667 AC079349.1-201ENST00000509096 589 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
CDKN3Q16667 AC108727.1-201ENST00000513802 393 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
CDKN3Q16667 AC087883.1-201ENST00000551882 391 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CDKN3Q16667 SNRPGP18-201ENST00000553000 214 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CDKN3Q16667 AC026464.5-201ENST00000562497 722 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CDKN3Q16667 AC012414.6-201ENST00000568241 401 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CDKN3Q16667 AC092378.2-202ENST00000569328 445 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
CDKN3Q16667 AC006504.5-204ENST00000592404 765 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
CDKN3Q16667 CLIC4P2-201ENST00000601934 717 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CDKN3Q16667 AC087045.1-201ENST00000605856 382 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CDKN3Q16667 AC126118.1-201ENST00000607744 628 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CDKN3Q16667 AC034238.1-213ENST00000611148 150 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
CDKN3Q16667 AP001506.1-201ENST00000615444 211 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CDKN3Q16667 AC026523.1-201ENST00000617221 490 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
CDKN3Q16667 GPR171-203ENST00000617554 960 ntAPPRIS P1 BASIC2.24□□□□□ -2.05
CDKN3Q16667 USP12-203ENST00000620323 349 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
CDKN3Q16667 PCDH11Y-203ENST00000362095 4220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
CDKN3Q16667 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
CDKN3Q16667 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
CDKN3Q16667 FARSBP1-201ENST00000435808 1778 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CDKN3Q16667 AL589740.1-207ENST00000607823 1962 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
CDKN3Q16667 EFCAB3-202ENST00000450662 1694 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
CDKN3Q16667 AC138393.1-203ENST00000327086 343 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CDKN3Q16667 MIR412-201ENST00000362142 91 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CDKN3Q16667 RNU6-179P-201ENST00000363350 107 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CDKN3Q16667 RNU4-91P-201ENST00000364778 135 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CDKN3Q16667 CISD1P1-201ENST00000393907 327 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CDKN3Q16667 U6atac.2-201ENST00000408644 118 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CDKN3Q16667 RNA5SP111-201ENST00000411386 101 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CDKN3Q16667 AC002456.1-203ENST00000412669 449 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
CDKN3Q16667 MAMDC2-AS1-203ENST00000420573 339 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
CDKN3Q16667 AL162726.4-201ENST00000422010 673 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
CDKN3Q16667 AL160275.3-201ENST00000423876 471 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CDKN3Q16667 ISCA1P6-201ENST00000427740 390 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CDKN3Q16667 RPL30P4-201ENST00000429309 333 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CDKN3Q16667 AL024508.1-201ENST00000432477 505 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
CDKN3Q16667 HMGN2P3-201ENST00000433603 273 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CDKN3Q16667 AL157937.1-201ENST00000435092 443 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
CDKN3Q16667 HMGN2P5-201ENST00000436882 273 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CDKN3Q16667 AC004383.1-201ENST00000438135 289 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CDKN3Q16667 AL359771.1-201ENST00000441809 379 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
CDKN3Q16667 AP000936.1-201ENST00000442124 483 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
CDKN3Q16667 RPS27AP8-201ENST00000452665 445 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CDKN3Q16667 AL133481.3-201ENST00000456546 333 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
CDKN3Q16667 AC117462.1-201ENST00000461186 554 ntTSL 4 BASIC2.23□□□□□ -2.05
CDKN3Q16667 ZBTB20-AS2-201ENST00000478301 372 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
CDKN3Q16667 RPL36AP48-201ENST00000485521 314 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CDKN3Q16667 AC103957.1-202ENST00000519814 735 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
CDKN3Q16667 AP003730.2-202ENST00000527281 774 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
CDKN3Q16667 AC239802.1-201ENST00000531288 406 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
CDKN3Q16667 AP000889.2-201ENST00000532684 490 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CDKN3Q16667 MIR5571-201ENST00000577998 113 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CDKN3Q16667 AC105245.1-201ENST00000581934 244 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CDKN3Q16667 MIR548AC-201ENST00000585049 88 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CDKN3Q16667 Z99497.2-201ENST00000603634 310 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CDKN3Q16667 HMGB1P24-202ENST00000615653 685 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CDKN3Q16667 AC009831.4-201ENST00000620744 325 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CDKN3Q16667 FGF7-206ENST00000614567 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
CDKN3Q16667 ZBED5-201ENST00000413761 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
CDKN3Q16667 EYS-202ENST00000342421 2168 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
CDKN3Q16667 OR51A7-202ENST00000641490 2186 ntAPPRIS P1 BASIC2.22□□□□□ -2.05
CDKN3Q16667 SNORD114-1-201ENST00000362705 72 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CDKN3Q16667 MIR518D-201ENST00000385014 87 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CDKN3Q16667 U3.37-201ENST00000408528 213 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CDKN3Q16667 RN7SKP32-201ENST00000410167 303 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CDKN3Q16667 RNU6-387P-201ENST00000411331 105 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CDKN3Q16667 LINC00428-201ENST00000415620 227 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
CDKN3Q16667 AL157884.2-201ENST00000424177 551 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
CDKN3Q16667 AC241644.2-201ENST00000426504 480 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
CDKN3Q16667 GAPDHP17-201ENST00000449858 1001 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CDKN3Q16667 AC012308.1-201ENST00000451232 178 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CDKN3Q16667 AL583843.1-201ENST00000456070 346 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CDKN3Q16667 Y_RNA.638-201ENST00000459374 113 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CDKN3Q16667 SNORD42A-201ENST00000459584 64 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CDKN3Q16667 MTND4P2-201ENST00000507767 1203 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CDKN3Q16667 LINC02118-202ENST00000510583 419 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
CDKN3Q16667 AC124854.1-202ENST00000513779 339 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
CDKN3Q16667 AC091887.1-201ENST00000514002 439 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
CDKN3Q16667 ASPH-224ENST00000522603 842 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
CDKN3Q16667 OR5AQ1P-201ENST00000527596 927 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CDKN3Q16667 AP002453.2-201ENST00000533503 320 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CDKN3Q16667 MIR4658-201ENST00000584344 65 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CDKN3Q16667 LINC02210-208ENST00000585118 546 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
CDKN3Q16667 AL670379.10-201ENST00000604330 253 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CDKN3Q16667 AL670379.9-201ENST00000605428 253 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CDKN3Q16667 AL157786.1-207ENST00000627771 695 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CDKN3Q16667 AC093536.2-201ENST00000565257 1406 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
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