Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 AL049545.1-201ENST00000401856 572 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SGCAQ16586 RNU2-39P-201ENST00000410604 198 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SGCAQ16586 AC127391.1-201ENST00000411737 98 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SGCAQ16586 SLC44A3-AS1-205ENST00000424505 612 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SGCAQ16586 AP001136.1-201ENST00000425058 635 ntTSL 2 BASIC1.92□□□□□ -2.1
SGCAQ16586 AC241644.2-201ENST00000426504 480 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
SGCAQ16586 HTR2A-AS1-201ENST00000430913 429 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
SGCAQ16586 AL136234.1-201ENST00000437080 349 ntTSL 2 BASIC1.92□□□□□ -2.1
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SGCAQ16586 AL133481.3-201ENST00000456546 333 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
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SGCAQ16586 RPS3A-208ENST00000509736 576 ntTSL 2 BASIC1.92□□□□□ -2.1
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SGCAQ16586 AL022154.1-201ENST00000604698 785 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SGCAQ16586 AL158032.1-201ENST00000605401 106 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
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SGCAQ16586 SATB1-AS1-227ENST00000625533 743 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
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SGCAQ16586 CYLC2-202ENST00000487798 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
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SGCAQ16586 TSHB-202ENST00000369517 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
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SGCAQ16586 snoU109.1-201ENST00000459339 135 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SGCAQ16586 MTCO2P6-201ENST00000463134 685 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
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