Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 SNORA48.11-201ENST00000517015 89 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CHRNA6Q15825 AC090796.1-201ENST00000520370 567 ntTSL 4 BASIC1.91□□□□□ -2.1
CHRNA6Q15825 AC107953.1-201ENST00000522216 297 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CHRNA6Q15825 MTND1P8-201ENST00000571424 950 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CHRNA6Q15825 MIR4299-201ENST00000577899 72 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CHRNA6Q15825 AP001004.1-201ENST00000582468 324 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CHRNA6Q15825 MTCO2P2-201ENST00000591258 225 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CHRNA6Q15825 BNIP3P40-201ENST00000596017 556 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CHRNA6Q15825 AL031274.2-201ENST00000599419 203 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CHRNA6Q15825 AL713866.2-201ENST00000603579 219 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CHRNA6Q15825 AC105148.1-201ENST00000604961 409 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CHRNA6Q15825 AC121334.2-201ENST00000605387 271 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CHRNA6Q15825 AC087045.1-201ENST00000605856 382 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CHRNA6Q15825 AL139022.2-201ENST00000606934 443 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CHRNA6Q15825 AC009974.1-201ENST00000608881 455 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CHRNA6Q15825 AC021755.4-201ENST00000616620 456 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CHRNA6Q15825 AC008121.3-201ENST00000618726 433 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CHRNA6Q15825 AL589994.2-201ENST00000621124 579 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CHRNA6Q15825 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC1.91□□□□□ -2.1
CHRNA6Q15825 AP002782.1-201ENST00000623107 614 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CHRNA6Q15825 AL160287.1-202ENST00000638113 454 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
CHRNA6Q15825 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
CHRNA6Q15825 DEUP1-201ENST00000298050 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
CHRNA6Q15825 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.1
CHRNA6Q15825 Y_RNA.302-201ENST00000364997 102 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CHRNA6Q15825 AL356432.1-201ENST00000405809 419 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CHRNA6Q15825 EIF1AXP1-201ENST00000419267 435 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CHRNA6Q15825 GS1-594A7.3-201ENST00000421585 574 ntTSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.11
CHRNA6Q15825 AL022400.1-201ENST00000423946 935 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CHRNA6Q15825 AL353777.1-201ENST00000425552 326 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CHRNA6Q15825 AC093423.2-201ENST00000429074 437 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
CHRNA6Q15825 AL591212.2-201ENST00000433923 257 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CHRNA6Q15825 AL354936.1-201ENST00000441521 649 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
CHRNA6Q15825 RPL23AP6-201ENST00000446637 472 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CHRNA6Q15825 AC114485.1-201ENST00000447916 657 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
CHRNA6Q15825 ITGA9-AS1-208ENST00000449586 726 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
CHRNA6Q15825 AC110009.1-201ENST00000512965 451 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
CHRNA6Q15825 RNU2-44P-201ENST00000516795 194 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CHRNA6Q15825 RNU6-1092P-201ENST00000516955 87 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CHRNA6Q15825 LINC02294-201ENST00000549330 497 ntTSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.11
CHRNA6Q15825 MIR1273C-201ENST00000578669 77 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CHRNA6Q15825 AC012594.1-269ENST00000600489 628 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
CHRNA6Q15825 AC243960.4-201ENST00000600532 288 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CHRNA6Q15825 AC107952.2-201ENST00000606048 486 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CHRNA6Q15825 MIR6845-201ENST00000613182 61 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CHRNA6Q15825 AC022202.1-201ENST00000613515 211 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CHRNA6Q15825 AC091953.2-201ENST00000623979 160 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CHRNA6Q15825 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
CHRNA6Q15825 KLRA1P-202ENST00000510134 1410 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
CHRNA6Q15825 ANKRD36BP1-202ENST00000604892 1417 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CHRNA6Q15825 LINC01938-201ENST00000521341 1864 ntTSL 2 BASIC1.89□□□□□ -2.11
CHRNA6Q15825 Y_RNA.140-201ENST00000363474 103 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CHRNA6Q15825 RNU6-960P-201ENST00000364056 120 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CHRNA6Q15825 SNORA25B-201ENST00000365507 128 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CHRNA6Q15825 Y_RNA.534-201ENST00000384599 112 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CHRNA6Q15825 SNORA40C-201ENST00000391285 128 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CHRNA6Q15825 FCF1P10-201ENST00000407590 479 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CHRNA6Q15825 AC018816.1-203ENST00000441894 338 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
CHRNA6Q15825 AC069549.1-201ENST00000451584 499 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
CHRNA6Q15825 FAM92A1P2-202ENST00000504766 877 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CHRNA6Q15825 LINC02465-202ENST00000508724 503 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
CHRNA6Q15825 RNA5SP182-201ENST00000516064 82 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CHRNA6Q15825 RNU6-1315P-201ENST00000517187 99 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CHRNA6Q15825 OR5AL2P-201ENST00000532185 920 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CHRNA6Q15825 POC1B-211ENST00000549504 581 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
CHRNA6Q15825 ANP32BP3-201ENST00000559213 706 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CHRNA6Q15825 AC090888.2-201ENST00000559765 1144 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CHRNA6Q15825 AC233702.2-202ENST00000562547 291 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CHRNA6Q15825 LINC01899-202ENST00000583756 575 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
CHRNA6Q15825 LINC02210-208ENST00000585118 546 ntTSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
CHRNA6Q15825 AC016727.1-205ENST00000605437 569 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CHRNA6Q15825 AL391813.2-201ENST00000609113 322 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CHRNA6Q15825 USP12-203ENST00000620323 349 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
CHRNA6Q15825 CGGBP1-202ENST00000398392 5298 ntAPPRIS P1 BASIC1.89□□□□□ -2.11
CHRNA6Q15825 LINC01684-201ENST00000415182 2176 ntTSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
CHRNA6Q15825 AC106754.1-201ENST00000562632 1513 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CHRNA6Q15825 RNU6-511P-201ENST00000363496 107 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CHRNA6Q15825 RNU5E-6P-201ENST00000365574 115 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CHRNA6Q15825 RNU6-395P-201ENST00000365662 106 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CHRNA6Q15825 SMIM11P1-201ENST00000369586 178 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CHRNA6Q15825 SNORA40.19-201ENST00000390846 128 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CHRNA6Q15825 AL030996.1-201ENST00000411430 235 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CHRNA6Q15825 LURAP1L-AS1-201ENST00000417638 799 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
CHRNA6Q15825 AC096920.1-201ENST00000423991 241 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CHRNA6Q15825 LINC01673-201ENST00000426418 468 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
CHRNA6Q15825 AC020571.1-201ENST00000430904 768 ntTSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
CHRNA6Q15825 AL024508.1-201ENST00000432477 505 ntTSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
CHRNA6Q15825 HSFY7P-201ENST00000432672 318 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CHRNA6Q15825 HSFY8P-201ENST00000437934 318 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CHRNA6Q15825 AL359771.1-201ENST00000441809 379 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
CHRNA6Q15825 LINC01564-201ENST00000448327 566 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
CHRNA6Q15825 AC010974.1-201ENST00000450509 374 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
CHRNA6Q15825 HSFY5P-201ENST00000453726 309 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CHRNA6Q15825 AC093899.1-201ENST00000457984 376 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CHRNA6Q15825 AL139824.2-201ENST00000458731 1095 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CHRNA6Q15825 RPL7P43-201ENST00000478876 753 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CHRNA6Q15825 AC008869.1-201ENST00000510938 442 ntTSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
CHRNA6Q15825 AC091965.2-201ENST00000512324 613 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CHRNA6Q15825 OCIAD1-AS1-201ENST00000513576 265 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
CHRNA6Q15825 AC108727.1-201ENST00000513802 393 ntTSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
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