Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 AC087683.1-201ENST00000591187 441 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ALCAMQ13740 AL359198.2-201ENST00000611836 194 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ALCAMQ13740 ERBIN-202ENST00000380935 6692 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
ALCAMQ13740 AC016717.2-201ENST00000609089 5141 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ALCAMQ13740 ZNF680P1-201ENST00000436625 1469 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ALCAMQ13740 DPY19L2P1-203ENST00000458672 3347 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
ALCAMQ13740 DNAH7-201ENST00000312428 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
ALCAMQ13740 TXNDC8-203ENST00000374511 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
ALCAMQ13740 SNORA41-201ENST00000384675 132 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ALCAMQ13740 MIR518C-201ENST00000384822 101 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ALCAMQ13740 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.72□□□□□ -1.97
ALCAMQ13740 AL359511.1-201ENST00000402970 211 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ALCAMQ13740 U3.37-201ENST00000408528 213 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ALCAMQ13740 RNU4-46P-201ENST00000410818 138 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ALCAMQ13740 RNU6-1328P-201ENST00000410938 106 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ALCAMQ13740 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ALCAMQ13740 IL33-202ENST00000417746 2327 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
ALCAMQ13740 TOMM20P4-201ENST00000427861 435 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ALCAMQ13740 LINC01626-201ENST00000431997 452 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
ALCAMQ13740 AC000111.3-201ENST00000433478 193 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ALCAMQ13740 AL157937.1-201ENST00000435092 443 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
ALCAMQ13740 FABP5P14-201ENST00000437273 393 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ALCAMQ13740 AL445687.1-201ENST00000439946 251 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ALCAMQ13740 AP001324.2-201ENST00000461163 319 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ALCAMQ13740 HMGB1P29-201ENST00000505659 499 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ALCAMQ13740 MGC32805-203ENST00000506053 652 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
ALCAMQ13740 AC114316.1-201ENST00000511323 278 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
ALCAMQ13740 AC004054.1-201ENST00000515111 270 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
ALCAMQ13740 RNU6-405P-201ENST00000516637 110 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ALCAMQ13740 TRIQK-204ENST00000517858 1882 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
ALCAMQ13740 ASPH-224ENST00000522603 842 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
ALCAMQ13740 AC024909.2-201ENST00000553035 286 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ALCAMQ13740 AC025678.1-201ENST00000567861 338 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ALCAMQ13740 MIR4703-201ENST00000577728 79 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ALCAMQ13740 AC005304.3-201ENST00000581533 511 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
ALCAMQ13740 MIR3670-2-201ENST00000582974 65 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ALCAMQ13740 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ALCAMQ13740 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ALCAMQ13740 AC080013.6-201ENST00000606185 215 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ALCAMQ13740 AC007684.1-201ENST00000609671 477 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ALCAMQ13740 AC005696.2-201ENST00000610120 626 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
ALCAMQ13740 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ALCAMQ13740 AC011890.2-201ENST00000613393 294 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ALCAMQ13740 HIKESHI-208ENST00000618164 499 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
ALCAMQ13740 AC080128.1-201ENST00000474389 1917 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ALCAMQ13740 RGPD6-201ENST00000329516 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
ALCAMQ13740 AL359854.1-201ENST00000614203 1594 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ALCAMQ13740 LINC01592-202ENST00000518540 2367 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
ALCAMQ13740 SEL1L2-201ENST00000284951 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
ALCAMQ13740 C5orf46-201ENST00000318315 506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
ALCAMQ13740 RNU6-1103P-201ENST00000384150 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ALCAMQ13740 AL157709.1-201ENST00000412695 424 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
ALCAMQ13740 Z98742.2-201ENST00000431564 187 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ALCAMQ13740 AC002486.1-201ENST00000435098 391 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ALCAMQ13740 AC078845.1-202ENST00000435996 733 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
ALCAMQ13740 AL590999.1-206ENST00000437947 436 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
ALCAMQ13740 AC004383.1-201ENST00000438135 289 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ALCAMQ13740 AC092802.2-202ENST00000444665 371 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
ALCAMQ13740 AC114501.3-201ENST00000453648 164 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
ALCAMQ13740 snoU109.2-201ENST00000459316 135 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ALCAMQ13740 MTAPP1-201ENST00000489154 819 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ALCAMQ13740 LINC01326-201ENST00000495159 755 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
ALCAMQ13740 AC027343.1-201ENST00000504765 407 ntTSL 4 BASIC2.71□□□□□ -1.98
ALCAMQ13740 AL359273.1-202ENST00000505585 905 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
ALCAMQ13740 AC091133.4-201ENST00000511142 308 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ALCAMQ13740 AC104136.1-201ENST00000512969 394 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ALCAMQ13740 AC114781.4-201ENST00000513707 639 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ALCAMQ13740 LINC00824-201ENST00000517583 805 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
ALCAMQ13740 AC021242.2-203ENST00000521842 687 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
ALCAMQ13740 AC100768.1-201ENST00000525512 506 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
ALCAMQ13740 AC091047.1-201ENST00000533344 552 ntTSL 4 BASIC2.71□□□□□ -1.98
ALCAMQ13740 HSPE1P20-201ENST00000538133 289 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ALCAMQ13740 AL355076.2-202ENST00000553754 574 ntTSL 4 BASIC2.71□□□□□ -1.98
ALCAMQ13740 MIR3199-1-201ENST00000582434 88 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ALCAMQ13740 AC130469.1-201ENST00000597256 388 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
ALCAMQ13740 AL356280.1-201ENST00000603614 379 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ALCAMQ13740 AC091805.2-201ENST00000603848 235 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ALCAMQ13740 AL670379.10-201ENST00000604330 253 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ALCAMQ13740 AC007621.1-201ENST00000604544 437 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ALCAMQ13740 AL670379.9-201ENST00000605428 253 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ALCAMQ13740 CYP3A43-217ENST00000631161 328 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
ALCAMQ13740 MIR7157-201ENST00000635801 60 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ALCAMQ13740 BCHE-201ENST00000264381 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
ALCAMQ13740 AL365361.1-201ENST00000566942 3481 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ALCAMQ13740 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
ALCAMQ13740 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
ALCAMQ13740 COPS2-203ENST00000542928 1580 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
ALCAMQ13740 AL109809.4-201ENST00000603520 2185 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ALCAMQ13740 HSFY1-202ENST00000309834 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
ALCAMQ13740 HSFY2-202ENST00000344884 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
ALCAMQ13740 RNU6-858P-201ENST00000362436 107 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ALCAMQ13740 Y_RNA.159-201ENST00000363674 87 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ALCAMQ13740 DEFA7P-201ENST00000382676 285 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ALCAMQ13740 Y_RNA.510-201ENST00000384511 114 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ALCAMQ13740 MIR634-201ENST00000385208 97 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ALCAMQ13740 BX682237.1-201ENST00000415016 335 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ALCAMQ13740 AL353621.1-201ENST00000418219 243 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ALCAMQ13740 AL096799.1-201ENST00000425900 381 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
ALCAMQ13740 MTCO3P30-201ENST00000426425 670 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ALCAMQ13740 MICF-203ENST00000432679 129 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
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