Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 PMCHL1-202ENST00000423102 261 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
TCIRG1Q13488 AL669831.1-202ENST00000428504 417 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
TCIRG1Q13488 KCNMA1-AS2-201ENST00000428936 427 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
TCIRG1Q13488 AL049641.1-201ENST00000441055 1948 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
TCIRG1Q13488 RNU7-167P-201ENST00000459160 62 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
TCIRG1Q13488 TIPARP-AS1-202ENST00000478005 554 ntTSL 4 BASIC4.08□□□□□ -1.76
TCIRG1Q13488 HYDIN2-201ENST00000493714 554 ntTSL 4 BASIC4.08□□□□□ -1.76
TCIRG1Q13488 AC008526.1-201ENST00000509149 338 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
TCIRG1Q13488 RNU2-69P-201ENST00000516061 100 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
TCIRG1Q13488 Y_RNA.689-201ENST00000516589 107 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
TCIRG1Q13488 AC022634.1-201ENST00000520765 532 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
TCIRG1Q13488 AC104211.1-202ENST00000521307 866 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
TCIRG1Q13488 LINC02350-201ENST00000544419 480 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
TCIRG1Q13488 SNRPGP18-201ENST00000553000 214 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
TCIRG1Q13488 AC009145.1-201ENST00000563230 433 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
TCIRG1Q13488 AL589765.7-201ENST00000601684 629 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
TCIRG1Q13488 AP001972.3-202ENST00000603012 375 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
TCIRG1Q13488 AC019193.3-201ENST00000609144 554 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
TCIRG1Q13488 AL589935.1-202ENST00000612512 393 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
TCIRG1Q13488 uc_338.22-201ENST00000622722 187 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
TCIRG1Q13488 GEN1-201ENST00000317402 9854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
TCIRG1Q13488 BLM-208ENST00000560509 3966 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
TCIRG1Q13488 FBXO11-201ENST00000402508 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
TCIRG1Q13488 ERBIN-204ENST00000380943 6410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
TCIRG1Q13488 WHAMMP2-201ENST00000512149 5482 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
TCIRG1Q13488 RNU6-601P-201ENST00000384540 107 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
TCIRG1Q13488 RNU6-308P-201ENST00000390957 107 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
TCIRG1Q13488 AL139039.1-201ENST00000401900 692 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
TCIRG1Q13488 AL138878.1-201ENST00000405131 347 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
TCIRG1Q13488 AC080125.1-201ENST00000414888 684 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
TCIRG1Q13488 RPL23AP69-201ENST00000431134 458 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
TCIRG1Q13488 MTCO3P10-201ENST00000455912 772 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
TCIRG1Q13488 ELOCP24-201ENST00000456370 334 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
TCIRG1Q13488 AC009468.2-201ENST00000457372 366 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
TCIRG1Q13488 Y_RNA.653-201ENST00000459091 95 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
TCIRG1Q13488 RPL23AP62-201ENST00000463396 453 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
TCIRG1Q13488 AC079140.5-201ENST00000507882 310 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
TCIRG1Q13488 MTCYBP40-201ENST00000509390 1135 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
TCIRG1Q13488 SNORA14.1-201ENST00000516113 141 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
TCIRG1Q13488 RNU6-1069P-201ENST00000516612 133 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
TCIRG1Q13488 MIR2114-201ENST00000516645 80 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
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TCIRG1Q13488 AC103957.1-201ENST00000517681 503 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
TCIRG1Q13488 LINC02155-201ENST00000519215 407 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
TCIRG1Q13488 AP001318.2-201ENST00000533378 492 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
TCIRG1Q13488 APAF1-207ENST00000547743 651 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
TCIRG1Q13488 G2E3-AS1-202ENST00000550118 609 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
TCIRG1Q13488 HMGB1P14-201ENST00000557424 591 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
TCIRG1Q13488 MTCO3P23-201ENST00000561363 289 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
TCIRG1Q13488 AC046158.1-201ENST00000563408 719 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
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TCIRG1Q13488 AC118755.2-201ENST00000584676 212 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
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TCIRG1Q13488 AC008121.3-201ENST00000618726 433 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
TCIRG1Q13488 AC098657.3-201ENST00000620434 263 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
TCIRG1Q13488 SLC30A6-203ENST00000379343 2354 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
TCIRG1Q13488 HSPA8P4-201ENST00000511877 1920 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
TCIRG1Q13488 GALNT1-201ENST00000269195 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
TCIRG1Q13488 DTHD1-202ENST00000456874 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
TCIRG1Q13488 AP001148.1-201ENST00000624124 2359 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
TCIRG1Q13488 XRCC4-202ENST00000338635 1579 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
TCIRG1Q13488 C5orf51-201ENST00000381647 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
TCIRG1Q13488 PHF6-205ENST00000625464 4434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
TCIRG1Q13488 C6orf10-209ENST00000612031 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
TCIRG1Q13488 ECT2-211ENST00000441497 2825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
TCIRG1Q13488 CCDC168-201ENST00000322527 21466 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
TCIRG1Q13488 USP9Y-201ENST00000338981 10036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
TCIRG1Q13488 TCF12-203ENST00000343827 3956 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
TCIRG1Q13488 MIR422A-201ENST00000362286 90 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
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TCIRG1Q13488 SNORA7.4-201ENST00000384249 137 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
TCIRG1Q13488 RNU6-434P-201ENST00000384376 107 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
TCIRG1Q13488 RPS12P24-201ENST00000412619 387 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
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TCIRG1Q13488 LINC01683-201ENST00000443479 412 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
TCIRG1Q13488 AL137792.2-201ENST00000443484 235 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
TCIRG1Q13488 LINC01810-201ENST00000450397 411 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
TCIRG1Q13488 RPL30P15-201ENST00000457129 321 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
TCIRG1Q13488 CENPBD1P1-201ENST00000464061 469 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
TCIRG1Q13488 OARD1-209ENST00000471367 401 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
TCIRG1Q13488 BMPR1B-AS1-201ENST00000510795 511 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
TCIRG1Q13488 AC114316.1-201ENST00000511323 278 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
TCIRG1Q13488 FAM92A-209ENST00000519679 538 ntTSL 4 BASIC4.06□□□□□ -1.76
TCIRG1Q13488 MIR3941-201ENST00000582572 103 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
TCIRG1Q13488 AC136443.5-201ENST00000603741 370 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
TCIRG1Q13488 AC016747.2-202ENST00000607743 332 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
TCIRG1Q13488 UBE2Q2P6-201ENST00000612666 153 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
TCIRG1Q13488 MIR6076-201ENST00000617521 113 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
TCIRG1Q13488 AC027309.3-201ENST00000623419 351 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
TCIRG1Q13488 PROX1-AS1-244ENST00000630355 599 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
TCIRG1Q13488 MTND5P10-201ENST00000603719 1809 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
TCIRG1Q13488 AL359693.1-201ENST00000614959 2407 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
TCIRG1Q13488 AGTR1-206ENST00000474935 1795 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
TCIRG1Q13488 FAM35BP-202ENST00000497389 3337 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
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