Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 MIR578-201ENST00000384828 96 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CNTN1Q12860 FO393413.1-201ENST00000402892 195 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CNTN1Q12860 AL356057.2-201ENST00000403318 432 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CNTN1Q12860 RPS4XP7-201ENST00000406274 780 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CNTN1Q12860 OR6C66P-201ENST00000414917 930 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CNTN1Q12860 AC096649.2-201ENST00000416186 393 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CNTN1Q12860 AL358075.3-201ENST00000426289 226 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CNTN1Q12860 AC241644.2-201ENST00000426504 480 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
CNTN1Q12860 MTCO2P19-201ENST00000427513 598 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CNTN1Q12860 AC079799.1-201ENST00000430696 331 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
CNTN1Q12860 AC002486.1-201ENST00000435098 391 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CNTN1Q12860 AC091133.1-201ENST00000435491 483 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
CNTN1Q12860 AL078601.1-201ENST00000444542 271 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CNTN1Q12860 AC104058.1-201ENST00000448028 297 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CNTN1Q12860 AC006512.1-201ENST00000468816 291 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CNTN1Q12860 RPL23AP45-201ENST00000476406 468 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CNTN1Q12860 TRBV1-201ENST00000476502 284 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CNTN1Q12860 TRBV12-1-201ENST00000479785 344 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CNTN1Q12860 AC112206.3-201ENST00000514578 389 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CNTN1Q12860 RNA5SP503-201ENST00000517047 117 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CNTN1Q12860 SPINK7-205ENST00000523535 299 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
CNTN1Q12860 AC025871.1-201ENST00000523935 443 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
CNTN1Q12860 OR5BN1P-201ENST00000532955 829 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CNTN1Q12860 OR5V1-216ENST00000543825 1048 ntAPPRIS P1 BASIC2.49□□□□□ -2.01
CNTN1Q12860 NTS-203ENST00000551529 801 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
CNTN1Q12860 AL355076.2-202ENST00000553754 574 ntTSL 4 BASIC2.49□□□□□ -2.01
CNTN1Q12860 SNORD53-201ENST00000579969 78 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CNTN1Q12860 AC010620.2-201ENST00000600135 313 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CNTN1Q12860 AC019159.1-201ENST00000605094 187 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CNTN1Q12860 AC008536.2-201ENST00000607284 349 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CNTN1Q12860 AC007684.1-201ENST00000609671 477 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CNTN1Q12860 AC068631.1-221ENST00000626006 592 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
CNTN1Q12860 TTC6-201ENST00000267368 1681 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
CNTN1Q12860 BCHE-201ENST00000264381 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
CNTN1Q12860 ANKRD36BP1-202ENST00000604892 1417 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CNTN1Q12860 AC010889.1-201ENST00000566193 2666 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CNTN1Q12860 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC2.48□□□□□ -2.01
CNTN1Q12860 TRIQK-204ENST00000517858 1882 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
CNTN1Q12860 AC138915.1-201ENST00000565427 1685 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CNTN1Q12860 Y_RNA.1-201ENST00000352915 104 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CNTN1Q12860 SNORD3E-201ENST00000362899 217 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CNTN1Q12860 RNU6-1287P-201ENST00000362914 107 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CNTN1Q12860 OR51A4-201ENST00000380373 1002 ntAPPRIS P1 BASIC2.48□□□□□ -2.01
CNTN1Q12860 RNU6-116P-201ENST00000384042 109 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CNTN1Q12860 RNU6-1060P-201ENST00000384664 107 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
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CNTN1Q12860 AL359511.1-201ENST00000402970 211 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
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CNTN1Q12860 AC005261.5-201ENST00000596280 355 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CNTN1Q12860 RPL23AP78-201ENST00000599928 470 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CNTN1Q12860 AL138889.2-201ENST00000603883 242 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CNTN1Q12860 C8orf59-207ENST00000611854 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
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CNTN1Q12860 RNA5SP456-201ENST00000364002 114 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CNTN1Q12860 RNU6-371P-201ENST00000364283 108 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
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CNTN1Q12860 AC233279.1-201ENST00000455300 423 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CNTN1Q12860 RN7SL636P-201ENST00000497504 294 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CNTN1Q12860 MGC32805-203ENST00000506053 652 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
CNTN1Q12860 AC092436.1-201ENST00000506450 503 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CNTN1Q12860 LINC02494-201ENST00000509824 427 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
CNTN1Q12860 AP002770.2-201ENST00000543613 532 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CNTN1Q12860 GLYCAM1-201ENST00000546596 285 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CNTN1Q12860 AL121821.2-201ENST00000556081 394 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CNTN1Q12860 LINC00933-203ENST00000559812 219 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CNTN1Q12860 MIR4703-201ENST00000577728 79 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CNTN1Q12860 AC004223.2-201ENST00000590309 544 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CNTN1Q12860 MIR6134-201ENST00000617606 109 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CNTN1Q12860 AC005609.4-201ENST00000625071 447 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CNTN1Q12860 OR5AK4P-201ENST00000635912 903 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CNTN1Q12860 ATM-228ENST00000639240 498 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
CNTN1Q12860 ATM-230ENST00000640388 578 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
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