Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 AC005062.1-201ENST00000457921 566 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 AC107626.1-201ENST00000471084 183 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 AC113155.1-201ENST00000511141 769 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 AC105417.1-201ENST00000514691 285 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 RNU6-581P-201ENST00000516214 105 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 RNU6-720P-201ENST00000516363 108 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 TRIQK-207ENST00000519069 598 ntTSL 4 BASIC2.4□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 AC022360.2-201ENST00000522390 456 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 AC078889.1-201ENST00000536412 523 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 AC008115.2-201ENST00000539988 241 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 LINC02305-201ENST00000554142 476 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 EIF4BP1-201ENST00000554881 351 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 AL512791.1-201ENST00000555853 300 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 LINC02253-201ENST00000559321 448 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 LINC00933-203ENST00000559812 219 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 AC009163.5-201ENST00000575421 637 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 ELOCP29-201ENST00000588193 334 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 AC005498.1-201ENST00000592125 465 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 AC073539.2-201ENST00000597113 165 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 RPL12P50-201ENST00000603116 116 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 AL645944.1-201ENST00000603857 493 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 AC079610.3-201ENST00000606960 147 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 AP001330.5-201ENST00000607176 411 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 AP001596.2-201ENST00000608410 312 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 AC139792.3-201ENST00000623525 224 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 Clostridiales-1.2-201ENST00000636724 160 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 AC093536.2-201ENST00000565257 1406 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 PSG1-205ENST00000595124 1692 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 CDC27P3-201ENST00000635418 1910 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 RGPD6-201ENST00000329516 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 DNAJC2-201ENST00000249270 1846 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 NOC3L-201ENST00000371361 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 CBLL1-201ENST00000222597 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 ADAM3A-203ENST00000461344 2157 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 DEFB107A-201ENST00000335021 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 DEFB107B-201ENST00000355602 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 MIR412-201ENST00000362142 91 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 RNU6-384P-201ENST00000364900 104 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 RNU6-1179P-201ENST00000384667 107 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 RNU6-903P-201ENST00000391270 109 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 BCL2L11-207ENST00000405953 425 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 Y_RNA.623-201ENST00000411128 95 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 AC096649.2-201ENST00000416186 393 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 TTTY3-201ENST00000417334 344 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 AC011243.1-201ENST00000420184 415 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 AL358075.3-201ENST00000426289 226 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 AL669831.1-202ENST00000428504 417 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 GTF2IP13-201ENST00000438487 386 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 AC105272.1-201ENST00000438604 198 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 MTND1P1-201ENST00000445453 368 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 FDX1P2-201ENST00000450769 375 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 AC233279.1-201ENST00000455300 423 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 RNU7-63P-201ENST00000459054 62 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 GMFBP1-201ENST00000467831 427 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 OARD1-209ENST00000471367 401 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 AC108727.1-201ENST00000513802 393 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 RNU1-86P-201ENST00000516108 154 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 RNU1-107P-201ENST00000516617 154 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 AC025871.1-201ENST00000523935 443 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 AP001893.2-201ENST00000526949 202 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 AP001189.6-201ENST00000528781 831 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 AC104383.1-201ENST00000530297 370 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 AP003034.1-201ENST00000534621 422 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 GLYCAM1-201ENST00000546596 285 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 AC025575.1-201ENST00000548497 544 ntTSL 4 BASIC2.39□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 AL121821.2-201ENST00000556081 394 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 AC009558.1-201ENST00000561174 581 ntTSL 4 BASIC2.39□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 AC025678.1-201ENST00000567861 338 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 AC022809.1-201ENST00000579247 428 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 OR1M4P-201ENST00000589199 287 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 BNIP3P30-201ENST00000601184 574 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 AC012507.3-201ENST00000603556 477 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 AC092954.2-201ENST00000609103 430 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 uc_338.11-201ENST00000619132 160 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 AL359880.1-201ENST00000621879 266 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 AC244517.5-202ENST00000623741 500 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 CYP3A43-217ENST00000631161 328 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 TTTY3B-201ENST00000631331 344 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 DLD-214ENST00000639772 421 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 AC099654.12-201ENST00000639868 649 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 AC006020.1-201ENST00000420179 1854 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 OR13G1-202ENST00000642119 2568 ntAPPRIS P1 BASIC2.38□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 Y_RNA.3-201ENST00000362331 103 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 RNU6-552P-201ENST00000362869 119 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 SNORD14B-201ENST00000364533 90 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 RNU6-715P-201ENST00000365204 103 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 RNU6-996P-201ENST00000365438 107 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 MAPK8-202ENST00000374174 739 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 RNU6-780P-201ENST00000391030 104 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 AL360182.1-201ENST00000397433 468 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 AL356057.3-201ENST00000402607 340 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 RNA5SP181-201ENST00000410246 98 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 RNU2-29P-201ENST00000410423 189 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 RNU4-46P-201ENST00000410818 138 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 AC016831.2-201ENST00000417179 352 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 AL157937.1-201ENST00000435092 443 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 AL359853.2-201ENST00000442108 353 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
RBBP4Q09028 AC073415.1-201ENST00000449240 153 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.4 ms