Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 AC091390.1-201ENST00000433904 331 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SH3BP4Q9P0V3 AL137789.1-201ENST00000439443 682 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
SH3BP4Q9P0V3 MTND5P22-201ENST00000458380 195 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SH3BP4Q9P0V3 RNU7-187P-201ENST00000458985 68 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SH3BP4Q9P0V3 AL135752.1-201ENST00000479477 471 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SH3BP4Q9P0V3 LINC02377-201ENST00000500169 450 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
SH3BP4Q9P0V3 AC096745.1-201ENST00000509945 370 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SH3BP4Q9P0V3 ABCA17P-206ENST00000512848 467 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
SH3BP4Q9P0V3 RNU1-86P-201ENST00000516108 154 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SH3BP4Q9P0V3 RNU1-107P-201ENST00000516617 154 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.720-201ENST00000517166 92 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-988P-201ENST00000519081 107 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SH3BP4Q9P0V3 AC007991.1-201ENST00000522680 631 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SH3BP4Q9P0V3 AL512791.1-201ENST00000555853 300 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
SH3BP4Q9P0V3 AL352979.2-201ENST00000556988 366 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
SH3BP4Q9P0V3 TGIF1P1-201ENST00000558095 802 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SH3BP4Q9P0V3 AC020661.3-201ENST00000558101 414 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
SH3BP4Q9P0V3 MIR5692A1-201ENST00000580523 69 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SH3BP4Q9P0V3 MIR4680-201ENST00000580906 66 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SH3BP4Q9P0V3 MIR548AC-201ENST00000585049 88 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SH3BP4Q9P0V3 MACROD2-IT1-202ENST00000605675 575 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
SH3BP4Q9P0V3 AC133104.2-201ENST00000615272 193 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SH3BP4Q9P0V3 RMST_4.1-201ENST00000616886 107 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SH3BP4Q9P0V3 AL731566.2-201ENST00000618971 317 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SH3BP4Q9P0V3 MIR6810-201ENST00000622701 70 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SH3BP4Q9P0V3 AP003355.3-201ENST00000623465 114 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SH3BP4Q9P0V3 AC119674.1-207ENST00000641355 633 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SH3BP4Q9P0V3 TOP2A-201ENST00000423485 5758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
SH3BP4Q9P0V3 FAM35BP-202ENST00000497389 3337 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SH3BP4Q9P0V3 CYYR1-AS1-201ENST00000357401 3412 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
SH3BP4Q9P0V3 AC100800.1-201ENST00000524252 2054 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
SH3BP4Q9P0V3 AL161668.1-201ENST00000320322 358 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
SH3BP4Q9P0V3 HMGN5-201ENST00000358130 2126 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-1167P-201ENST00000363227 94 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-1059P-201ENST00000363752 98 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SH3BP4Q9P0V3 RFX3-203ENST00000381984 364 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-1032P-201ENST00000384100 107 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-842P-201ENST00000384269 107 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SH3BP4Q9P0V3 AL356057.3-201ENST00000402607 340 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SH3BP4Q9P0V3 Z99755.1-201ENST00000414048 380 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SH3BP4Q9P0V3 AC243428.1-201ENST00000421099 264 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SH3BP4Q9P0V3 MYL8P-204ENST00000431574 518 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SH3BP4Q9P0V3 AC009237.8-201ENST00000445492 379 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SH3BP4Q9P0V3 LINC01810-201ENST00000450397 411 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
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SH3BP4Q9P0V3 RPL30P14-201ENST00000482744 348 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
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SH3BP4Q9P0V3 AL359237.1-201ENST00000554305 826 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
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SH3BP4Q9P0V3 AC007485.1-201ENST00000616755 206 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SH3BP4Q9P0V3 AC022149.2-201ENST00000621061 203 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SH3BP4Q9P0V3 TTK-211ENST00000627129 240 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
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SH3BP4Q9P0V3 PHF3-202ENST00000393387 6947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
SH3BP4Q9P0V3 CYSLTR2-201ENST00000282018 4672 ntAPPRIS P1 BASIC3.35□□□□□ -1.87
SH3BP4Q9P0V3 AL049641.1-201ENST00000441055 1948 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SH3BP4Q9P0V3 HNRNPC-203ENST00000430246 4501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
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SH3BP4Q9P0V3 RNU6-214P-201ENST00000384130 107 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SH3BP4Q9P0V3 U8.11-201ENST00000384699 133 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SH3BP4Q9P0V3 U8.12-201ENST00000384701 133 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SH3BP4Q9P0V3 SNORD73A-201ENST00000386062 65 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
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SH3BP4Q9P0V3 AL157937.1-201ENST00000435092 443 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
SH3BP4Q9P0V3 LINC01757-201ENST00000435552 480 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
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SH3BP4Q9P0V3 FABP5P15-201ENST00000453566 214 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
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SH3BP4Q9P0V3 AC004024.1-201ENST00000549244 247 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SH3BP4Q9P0V3 HMGB1P14-201ENST00000557424 591 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SH3BP4Q9P0V3 AC023906.2-201ENST00000558343 462 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
SH3BP4Q9P0V3 MIR3671-201ENST00000580455 88 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SH3BP4Q9P0V3 VN1R85P-201ENST00000601587 426 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SH3BP4Q9P0V3 LINC02112-205ENST00000606744 236 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
SH3BP4Q9P0V3 U4.6-201ENST00000621618 127 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
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