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| CHCHD4 | Q8N4Q1 | AL445989.1-202 | ENST00000418943 | 776 nt | TSL 2 BASIC | 2.56 | □□□□□ -2 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | AC092660.1-201 | ENST00000420648 | 371 nt | TSL 2 BASIC | 2.56 | □□□□□ -2 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | AL592466.1-201 | ENST00000428346 | 307 nt | TSL 5 BASIC | 2.56 | □□□□□ -2 | | |
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| CHCHD4 | Q8N4Q1 | Clostridiales-1.3-201 | ENST00000637703 | 147 nt | BASIC | 2.56 | □□□□□ -2 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | AC241585.2-209 | ENST00000638217 | 143 nt | BASIC | 2.56 | □□□□□ -2 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | MAP4K3-205 | ENST00000437545 | 3924 nt | TSL 5 BASIC | 2.56 | □□□□□ -2 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | C6orf10-201 | ENST00000375007 | 2125 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 2.56 | □□□□□ -2 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | THOC2-216 | ENST00000491737 | 4452 nt | TSL 5 BASIC | 2.56 | □□□□□ -2 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | MT-TH-201 | ENST00000387441 | 69 nt | BASIC | 2.55 | □□□□□ -2 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | MORN2-203 | ENST00000409131 | 544 nt | TSL 5 BASIC | 2.55 | □□□□□ -2 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | RN7SKP223-201 | ENST00000410582 | 62 nt | BASIC | 2.55 | □□□□□ -2 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | AC010731.2-201 | ENST00000415275 | 440 nt | TSL 3 BASIC | 2.55 | □□□□□ -2 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | AL135786.1-201 | ENST00000415892 | 214 nt | BASIC | 2.55 | □□□□□ -2 | | |
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| CHCHD4 | Q8N4Q1 | AC023590.1-204 | ENST00000434023 | 431 nt | TSL 5 BASIC | 2.55 | □□□□□ -2 | | |
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| CHCHD4 | Q8N4Q1 | AC074131.1-201 | ENST00000514662 | 253 nt | TSL 2 BASIC | 2.55 | □□□□□ -2 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | RNU7-51P-201 | ENST00000516560 | 62 nt | BASIC | 2.55 | □□□□□ -2 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | RNU6-1315P-201 | ENST00000517187 | 99 nt | BASIC | 2.55 | □□□□□ -2 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | AP003465.1-201 | ENST00000520575 | 382 nt | TSL 2 BASIC | 2.55 | □□□□□ -2 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | AP003181.2-201 | ENST00000528941 | 181 nt | BASIC | 2.55 | □□□□□ -2 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | AC022878.1-201 | ENST00000530684 | 149 nt | BASIC | 2.55 | □□□□□ -2 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | AP000889.2-201 | ENST00000532684 | 490 nt | BASIC | 2.55 | □□□□□ -2 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | OR5V1-216 | ENST00000543825 | 1048 nt | APPRIS P1 BASIC | 2.55 | □□□□□ -2 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | MIR4529-201 | ENST00000578110 | 78 nt | BASIC | 2.55 | □□□□□ -2 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | BNIP3P8-201 | ENST00000597863 | 560 nt | BASIC | 2.55 | □□□□□ -2 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | AC174048.1-201 | ENST00000603389 | 144 nt | BASIC | 2.55 | □□□□□ -2 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | AC078883.4-201 | ENST00000623218 | 367 nt | BASIC | 2.55 | □□□□□ -2 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | AC131280.1-202 | ENST00000624067 | 4211 nt | BASIC | 2.54 | □□□□□ -2 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | RNU1-72P-201 | ENST00000362976 | 153 nt | BASIC | 2.54 | □□□□□ -2 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | DEFA7P-201 | ENST00000382676 | 285 nt | BASIC | 2.54 | □□□□□ -2 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | Y_RNA.534-201 | ENST00000384599 | 112 nt | BASIC | 2.54 | □□□□□ -2 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | MIR17-201 | ENST00000385012 | 84 nt | BASIC | 2.54 | □□□□□ -2 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | RNU6ATAC3P-201 | ENST00000387974 | 126 nt | BASIC | 2.54 | □□□□□ -2 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | SNORA40C-201 | ENST00000391285 | 128 nt | BASIC | 2.54 | □□□□□ -2 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | CASP3-203 | ENST00000393588 | 677 nt | TSL 4 BASIC | 2.54 | □□□□□ -2 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | STAP1-202 | ENST00000396225 | 1146 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.54 | □□□□□ -2 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | CIR1P3-201 | ENST00000405137 | 479 nt | BASIC | 2.54 | □□□□□ -2 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | RNU2-8P-201 | ENST00000410727 | 190 nt | BASIC | 2.54 | □□□□□ -2 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | AC127391.1-201 | ENST00000411737 | 98 nt | BASIC | 2.54 | □□□□□ -2 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | EDDM3CP-201 | ENST00000415977 | 425 nt | BASIC | 2.54 | □□□□□ -2 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | AL592435.1-201 | ENST00000416401 | 469 nt | TSL 3 BASIC | 2.54 | □□□□□ -2 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | ELOCP4-201 | ENST00000420090 | 333 nt | BASIC | 2.54 | □□□□□ -2 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | AL161788.1-201 | ENST00000441805 | 169 nt | BASIC | 2.54 | □□□□□ -2 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | AL157882.1-201 | ENST00000447148 | 429 nt | TSL 3 BASIC | 2.54 | □□□□□ -2 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | ANKRD62P1-PARP4P3-201 | ENST00000456726 | 1181 nt | TSL 5 BASIC | 2.54 | □□□□□ -2 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | MTCO2P6-201 | ENST00000463134 | 685 nt | BASIC | 2.54 | □□□□□ -2 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | AC114316.1-201 | ENST00000511323 | 278 nt | TSL 5 BASIC | 2.54 | □□□□□ -2 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | RNU6-1092P-201 | ENST00000516955 | 87 nt | BASIC | 2.54 | □□□□□ -2 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | RNU2-19P-201 | ENST00000517288 | 84 nt | BASIC | 2.54 | □□□□□ -2 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | AC090796.1-201 | ENST00000520370 | 567 nt | TSL 4 BASIC | 2.54 | □□□□□ -2 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | PSMA3P-201 | ENST00000555485 | 635 nt | BASIC | 2.54 | □□□□□ -2 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | AC012065.4-201 | ENST00000602445 | 679 nt | BASIC | 2.54 | □□□□□ -2 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | AC138749.5-201 | ENST00000611461 | 208 nt | BASIC | 2.54 | □□□□□ -2 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | AC116165.2-201 | ENST00000616705 | 206 nt | BASIC | 2.54 | □□□□□ -2 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | AC097520.1-201 | ENST00000624435 | 385 nt | BASIC | 2.54 | □□□□□ -2 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | Clostridiales-1.2-201 | ENST00000636724 | 160 nt | BASIC | 2.54 | □□□□□ -2 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | ATP11C-201 | ENST00000327569 | 6115 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 2.54 | □□□□□ -2 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | AP006437.1-201 | ENST00000641440 | 3685 nt | BASIC | 2.53 | □□□□□ -2 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | IL2-201 | ENST00000226730 | 1029 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.53 | □□□□□ -2 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | SNORD62.1-201 | ENST00000362541 | 86 nt | BASIC | 2.53 | □□□□□ -2 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | RNY1P12-201 | ENST00000364251 | 105 nt | BASIC | 2.53 | □□□□□ -2 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | MDM4-202 | ENST00000367180 | 547 nt | TSL 3 BASIC | 2.53 | □□□□□ -2 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | MIR518D-201 | ENST00000385014 | 87 nt | BASIC | 2.53 | □□□□□ -2 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | MIR95-201 | ENST00000385072 | 81 nt | BASIC | 2.53 | □□□□□ -2 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | ZNF705D-201 | ENST00000400078 | 925 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 2.53 | □□□□□ -2 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | RPLP0P7-201 | ENST00000416050 | 667 nt | BASIC | 2.53 | □□□□□ -2 | | |