Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 AC124947.2-202ENST00000552735 133 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
ZFHX3Q15911 AL589743.7-201ENST00000612637 233 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
ZFHX3Q15911 MTCO1P23-201ENST00000415223 1526 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
ZFHX3Q15911 Y_RNA.35-201ENST00000362601 101 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
ZFHX3Q15911 AL353706.1-201ENST00000436728 494 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
ZFHX3Q15911 MIR217HG-201ENST00000446139 900 ntTSL 5 BASIC0.61□□□□□ -2.31
ZFHX3Q15911 PTENP1-201ENST00000447117 1215 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
ZFHX3Q15911 AC022445.1-201ENST00000457499 408 ntTSL 3 BASIC0.61□□□□□ -2.31
ZFHX3Q15911 Y_RNA.644-201ENST00000459006 113 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
ZFHX3Q15911 SNORA48.11-201ENST00000517015 89 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
ZFHX3Q15911 AC079148.1-201ENST00000565944 819 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
ZFHX3Q15911 AC120349.1-201ENST00000599498 282 ntTSL 5 BASIC0.61□□□□□ -2.31
ZFHX3Q15911 HMGB1P51-201ENST00000605166 638 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
ZFHX3Q15911 AL121890.5-201ENST00000620848 304 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
ZFHX3Q15911 AL109659.3-201ENST00000624985 950 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
ZFHX3Q15911 RNU6-217P-201ENST00000384164 104 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
ZFHX3Q15911 NDUFS5P1-201ENST00000405668 289 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
ZFHX3Q15911 OR2A41P-201ENST00000473586 105 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
ZFHX3Q15911 AC099513.1-201ENST00000490423 301 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
ZFHX3Q15911 Y_RNA.700-201ENST00000516806 100 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
ZFHX3Q15911 LINC01495-201ENST00000532380 421 ntTSL 2 BASIC0.61□□□□□ -2.31
ZFHX3Q15911 AL512791.1-201ENST00000555853 300 ntTSL 3 BASIC0.61□□□□□ -2.31
ZFHX3Q15911 AC005695.2-201ENST00000579641 259 ntTSL 3 BASIC0.61□□□□□ -2.31
ZFHX3Q15911 AL139344.1-201ENST00000605228 195 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
ZFHX3Q15911 PRPSAP2-229ENST00000628609 192 ntTSL 5 BASIC0.61□□□□□ -2.31
ZFHX3Q15911 OR4G2P-201ENST00000328113 903 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
ZFHX3Q15911 RNU1-36P-201ENST00000365130 165 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
ZFHX3Q15911 MRPL35P3-201ENST00000421557 364 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
ZFHX3Q15911 AL591848.2-201ENST00000442712 522 ntTSL 3 BASIC0.6□□□□□ -2.31
ZFHX3Q15911 GRM7-AS3-209ENST00000458713 454 ntTSL 3 BASIC0.6□□□□□ -2.31
ZFHX3Q15911 SNORA4.4-201ENST00000515921 135 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
ZFHX3Q15911 AC087045.1-201ENST00000605856 382 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
ZFHX3Q15911 DUXAP10-204ENST00000612052 616 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
ZFHX3Q15911 RNU6-968P-201ENST00000384076 107 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
ZFHX3Q15911 RNU6-1151P-201ENST00000384684 107 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
ZFHX3Q15911 HMGB1P17-201ENST00000403495 628 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
ZFHX3Q15911 TOMM22P2-201ENST00000430735 237 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
ZFHX3Q15911 MRPS17P3-201ENST00000465453 385 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
ZFHX3Q15911 AC108729.1-201ENST00000487812 947 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
ZFHX3Q15911 RNA5SP67-201ENST00000516422 131 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
ZFHX3Q15911 AC010175.1-201ENST00000538219 224 ntTSL 5 BASIC0.6□□□□□ -2.31
ZFHX3Q15911 TIMM9-208ENST00000556007 746 ntTSL 3 BASIC0.6□□□□□ -2.31
ZFHX3Q15911 ADAM3B-201ENST00000569937 840 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
ZFHX3Q15911 LINC01195-201ENST00000570118 451 ntTSL 3 BASIC0.6□□□□□ -2.31
ZFHX3Q15911 AC010900.2-201ENST00000604508 210 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
ZFHX3Q15911 AC007370.2-201ENST00000506899 2694 ntTSL 5 BASIC0.6□□□□□ -2.31
ZFHX3Q15911 AC064871.1-202ENST00000413954 382 ntTSL 5 BASIC0.6□□□□□ -2.31
ZFHX3Q15911 AC119618.1-201ENST00000434191 222 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
ZFHX3Q15911 TRBVB-201ENST00000477100 408 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
ZFHX3Q15911 AC012669.1-201ENST00000603209 283 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
ZFHX3Q15911 AC083798.2-205ENST00000608015 575 ntTSL 5 BASIC0.6□□□□□ -2.31
ZFHX3Q15911 AC006355.2-201ENST00000629240 317 ntTSL 3 BASIC0.6□□□□□ -2.31
ZFHX3Q15911 ZNF93-209ENST00000638737 1020 ntTSL 5 BASIC0.6□□□□□ -2.31
ZFHX3Q15911 SCOC-202ENST00000394201 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC0.59□□□□□ -2.31
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ZFHX3Q15911 RSU1P2-202ENST00000437884 485 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
ZFHX3Q15911 AC095056.1-201ENST00000503918 425 ntTSL 3 BASIC0.59□□□□□ -2.31
ZFHX3Q15911 AC098591.2-201ENST00000510152 315 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
ZFHX3Q15911 AC078880.1-201ENST00000546696 553 ntTSL 4 BASIC0.59□□□□□ -2.31
ZFHX3Q15911 AC006199.1-201ENST00000548728 219 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
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ZFHX3Q15911 AC010420.1-201ENST00000515077 509 ntTSL 3 BASIC0.59□□□□□ -2.32
ZFHX3Q15911 AC068643.2-202ENST00000552759 622 ntTSL 3 BASIC0.59□□□□□ -2.32
ZFHX3Q15911 AC092953.2-201ENST00000608000 699 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
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ZFHX3Q15911 SNORA4.3-201ENST00000365564 137 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
ZFHX3Q15911 RNU6-39P-201ENST00000384344 107 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
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ZFHX3Q15911 RPL37P10-201ENST00000412884 288 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
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ZFHX3Q15911 AC092757.1-201ENST00000467293 467 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
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ZFHX3Q15911 AC090592.1-203ENST00000533942 575 ntTSL 3 BASIC0.59□□□□□ -2.32
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ZFHX3Q15911 AL031176.1-201ENST00000604554 466 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
ZFHX3Q15911 SNORA51.6-201ENST00000384151 125 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
ZFHX3Q15911 RNU6-748P-201ENST00000384648 107 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
ZFHX3Q15911 AL096803.2-201ENST00000450032 677 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
ZFHX3Q15911 AL441985.1-201ENST00000457727 251 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
ZFHX3Q15911 LINC02053-202ENST00000488262 940 ntTSL 1 (best) BASIC0.58□□□□□ -2.32
ZFHX3Q15911 RNA5SP137-201ENST00000516833 135 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
ZFHX3Q15911 AC004812.1-201ENST00000540773 146 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
ZFHX3Q15911 AL161729.4-201ENST00000604650 476 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
ZFHX3Q15911 MIR8074-201ENST00000615081 81 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
ZFHX3Q15911 AL359314.1-201ENST00000616913 261 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
ZFHX3Q15911 DEFB114-201ENST00000322066 253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.58□□□□□ -2.32
ZFHX3Q15911 AC118282.2-201ENST00000508739 374 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
ZFHX3Q15911 HSPA8P13-201ENST00000523715 472 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
ZFHX3Q15911 AC005832.3-201ENST00000537929 631 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
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