Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 SNORA14A-201ENST00000364773 135 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ITGA9Q13797 Y_RNA.615-201ENST00000410769 117 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ITGA9Q13797 Z92545.1-201ENST00000411782 234 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ITGA9Q13797 AF241725.1-201ENST00000416182 480 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
ITGA9Q13797 LINC01853-201ENST00000417715 444 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
ITGA9Q13797 MTND1P18-201ENST00000448191 573 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ITGA9Q13797 FABP5P13-201ENST00000452144 328 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ITGA9Q13797 PMCHL2-203ENST00000457791 237 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ITGA9Q13797 AC003982.1-202ENST00000469928 248 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ITGA9Q13797 MGC32805-203ENST00000506053 652 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
ITGA9Q13797 MTCO3P9-201ENST00000506989 781 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ITGA9Q13797 AC104806.1-201ENST00000508720 308 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ITGA9Q13797 HIGD1AP13-201ENST00000509878 289 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ITGA9Q13797 TBCAP3-201ENST00000512475 312 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ITGA9Q13797 AC105417.1-201ENST00000514691 285 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ITGA9Q13797 RNU4ATAC8P-201ENST00000516196 109 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ITGA9Q13797 RNU6-875P-201ENST00000516488 106 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ITGA9Q13797 AC023050.3-201ENST00000541142 333 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ITGA9Q13797 APAF1-207ENST00000547743 651 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
ITGA9Q13797 HMGB1P14-201ENST00000557424 591 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ITGA9Q13797 AC009145.1-201ENST00000563230 433 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
ITGA9Q13797 FOPNL-205ENST00000573429 646 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
ITGA9Q13797 AC015845.1-201ENST00000579285 335 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
ITGA9Q13797 TTN-AS1-212ENST00000582847 1036 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
ITGA9Q13797 AC008521.1-201ENST00000587471 187 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ITGA9Q13797 AL158032.1-201ENST00000605401 106 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ITGA9Q13797 AC005046.1-201ENST00000608515 625 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ITGA9Q13797 AC005858.4-201ENST00000623191 700 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ITGA9Q13797 AC090617.10-201ENST00000624308 134 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ITGA9Q13797 U6.114-201ENST00000636407 96 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ITGA9Q13797 PSMD5-AS1-215ENST00000640622 205 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ITGA9Q13797 MCMDC2-201ENST00000313616 2043 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
ITGA9Q13797 NETO1-202ENST00000397929 1849 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
ITGA9Q13797 MTND5P17-201ENST00000418405 1603 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ITGA9Q13797 KBTBD3-207ENST00000534815 3396 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
ITGA9Q13797 MTND4P12-201ENST00000498999 1377 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ITGA9Q13797 BTLA-202ENST00000383680 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
ITGA9Q13797 RNU6-1035P-201ENST00000384477 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ITGA9Q13797 TRAJ21-201ENST00000390516 55 ntAPPRIS P1 BASIC2.79□□□□□ -1.96
ITGA9Q13797 LINC01737-201ENST00000412647 403 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
ITGA9Q13797 BTF3L4P3-201ENST00000418879 476 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ITGA9Q13797 AC011243.1-201ENST00000420184 415 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
ITGA9Q13797 AL136322.1-201ENST00000422250 548 ntTSL 4 BASIC2.79□□□□□ -1.96
ITGA9Q13797 LINC02263-203ENST00000426240 515 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
ITGA9Q13797 AL355340.1-201ENST00000433085 344 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
ITGA9Q13797 AC098614.3-201ENST00000438957 440 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ITGA9Q13797 AC107083.1-201ENST00000439643 279 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ITGA9Q13797 RPS24P13-201ENST00000442520 397 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ITGA9Q13797 NEFMP1-201ENST00000443423 1006 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ITGA9Q13797 LINC01683-201ENST00000443479 412 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
ITGA9Q13797 AL031183.1-201ENST00000457667 207 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ITGA9Q13797 LINC02110-201ENST00000503870 546 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
ITGA9Q13797 AC096711.2-201ENST00000510592 454 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
ITGA9Q13797 SNORA31.3-201ENST00000516029 96 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ITGA9Q13797 RNU6-123P-201ENST00000516163 102 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ITGA9Q13797 Y_RNA.689-201ENST00000516589 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ITGA9Q13797 RNA5SP291-201ENST00000517222 105 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ITGA9Q13797 AC087439.1-201ENST00000517920 398 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
ITGA9Q13797 AL132780.1-202ENST00000548322 591 ntTSL 4 BASIC2.79□□□□□ -1.96
ITGA9Q13797 ADI1P3-201ENST00000549509 470 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ITGA9Q13797 G2E3-AS1-202ENST00000550118 609 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
ITGA9Q13797 AL118558.2-201ENST00000556294 238 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ITGA9Q13797 AC012100.2-201ENST00000558317 304 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
ITGA9Q13797 AC130324.3-201ENST00000614165 542 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ITGA9Q13797 FRG1KP-201ENST00000623592 341 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ITGA9Q13797 OR4K2-204ENST00000641885 8681 ntAPPRIS P1 BASIC2.79□□□□□ -1.96
ITGA9Q13797 OR2J3-203ENST00000641960 3342 ntAPPRIS P1 BASIC2.79□□□□□ -1.96
ITGA9Q13797 GABRG2-209ENST00000638660 3799 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
ITGA9Q13797 Z82195.2-201ENST00000612348 18351 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ITGA9Q13797 LEPR-202ENST00000349533 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
ITGA9Q13797 TOPORSLP1-203ENST00000493279 2871 ntTSL 4 BASIC2.78□□□□□ -1.96
ITGA9Q13797 Y_RNA.279-201ENST00000364763 95 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ITGA9Q13797 RNU4-66P-201ENST00000365199 138 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ITGA9Q13797 RNU6-116P-201ENST00000384042 109 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ITGA9Q13797 TRAJ59-201ENST00000390480 54 ntAPPRIS P1 BASIC2.78□□□□□ -1.96
ITGA9Q13797 AL162578.1-201ENST00000406202 378 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ITGA9Q13797 LANCL1-AS1-203ENST00000433296 864 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
ITGA9Q13797 CALM1P1-201ENST00000442082 433 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ITGA9Q13797 AL135938.1-201ENST00000443141 297 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ITGA9Q13797 MCHR2-AS1-203ENST00000451220 429 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
ITGA9Q13797 AC046136.1-201ENST00000459855 533 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
ITGA9Q13797 LINC00971-201ENST00000482721 535 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
ITGA9Q13797 LINC02377-201ENST00000500169 450 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
ITGA9Q13797 AC097462.2-201ENST00000504623 481 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ITGA9Q13797 LINC02220-201ENST00000510065 270 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
ITGA9Q13797 AC004054.1-201ENST00000515111 270 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
ITGA9Q13797 RNU4-29P-201ENST00000515943 174 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ITGA9Q13797 RNA5SP367-201ENST00000516557 118 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ITGA9Q13797 SNORD60.2-201ENST00000516883 86 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ITGA9Q13797 RNA5SP471-201ENST00000516971 106 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ITGA9Q13797 ATP5F1P5-201ENST00000526403 760 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ITGA9Q13797 ZNF861P-201ENST00000588126 639 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ITGA9Q13797 AL670379.6-201ENST00000603753 252 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ITGA9Q13797 AL670379.11-201ENST00000604059 253 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ITGA9Q13797 AC136601.2-201ENST00000604356 474 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ITGA9Q13797 AC008162.1-201ENST00000604718 254 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ITGA9Q13797 AL670379.1-201ENST00000604752 252 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ITGA9Q13797 AL670379.5-201ENST00000605253 252 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ITGA9Q13797 AL670379.12-201ENST00000605291 253 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ITGA9Q13797 AL670379.8-201ENST00000605353 252 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.6 ms