Protein–RNA interactions for Protein: Q13214

SEMA3B, Semaphorin-3B, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3BQ13214 AC005498.1-201ENST00000592125 465 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SEMA3BQ13214 AL162713.1-201ENST00000604480 262 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SEMA3BQ13214 AC007938.3-201ENST00000604965 623 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SEMA3BQ13214 AC002044.1-201ENST00000606707 158 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SEMA3BQ13214 ADARB1-213ENST00000611195 159 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
SEMA3BQ13214 AL031601.2-202ENST00000622650 282 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SEMA3BQ13214 AC244517.5-202ENST00000623741 500 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
SEMA3BQ13214 AL133216.2-202ENST00000634512 349 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SEMA3BQ13214 ATM-203ENST00000452508 12954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
SEMA3BQ13214 ERBIN-212ENST00000508515 4374 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.88
SEMA3BQ13214 WDR72-201ENST00000360509 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.88
SEMA3BQ13214 ATP8A2P2-201ENST00000437678 1568 ntBASIC3.34□□□□□ -1.88
SEMA3BQ13214 FILIP1L-206ENST00000471562 2854 ntTSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
SEMA3BQ13214 CCDC168-201ENST00000322527 21466 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
SEMA3BQ13214 UEVLD-208ENST00000535484 1963 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
SEMA3BQ13214 OR6C1-202ENST00000642104 2055 ntAPPRIS P1 BASIC3.33□□□□□ -1.88
SEMA3BQ13214 RNU6-270P-201ENST00000364131 105 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SEMA3BQ13214 Y_RNA.356-201ENST00000365475 113 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SEMA3BQ13214 RNU6-301P-201ENST00000384277 107 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SEMA3BQ13214 Y_RNA.480-201ENST00000384364 102 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SEMA3BQ13214 Y_RNA.529-201ENST00000384586 119 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SEMA3BQ13214 AP000567.1-201ENST00000406413 156 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SEMA3BQ13214 CYCSP33-201ENST00000414485 327 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SEMA3BQ13214 RPL7P10-201ENST00000417407 739 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SEMA3BQ13214 MTND3P23-201ENST00000431980 347 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SEMA3BQ13214 AL033504.1-204ENST00000434985 413 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
SEMA3BQ13214 RPL7P43-201ENST00000478876 753 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SEMA3BQ13214 AC006445.1-201ENST00000491925 405 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SEMA3BQ13214 AC110799.1-201ENST00000509098 449 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
SEMA3BQ13214 AC006445.2-201ENST00000510061 472 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SEMA3BQ13214 AC025871.1-201ENST00000523935 443 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
SEMA3BQ13214 CYCSP27-201ENST00000527643 293 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SEMA3BQ13214 AP002004.1-207ENST00000531371 526 ntTSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
SEMA3BQ13214 AP001318.2-201ENST00000533378 492 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
SEMA3BQ13214 AC046158.1-201ENST00000563408 719 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
SEMA3BQ13214 MAFTRR-204ENST00000568389 506 ntTSL 4 BASIC3.33□□□□□ -1.88
SEMA3BQ13214 RPS3AP23-202ENST00000574601 686 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SEMA3BQ13214 MIR4672-201ENST00000583126 81 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SEMA3BQ13214 MIR5692C1-201ENST00000585309 91 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SEMA3BQ13214 HSPE1P7-201ENST00000604681 321 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SEMA3BQ13214 HNRNPDLP4-201ENST00000605144 301 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SEMA3BQ13214 ESRRAP2-204ENST00000606337 280 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
SEMA3BQ13214 AC022017.1-201ENST00000608793 559 ntTSL 4 BASIC3.33□□□□□ -1.88
SEMA3BQ13214 CRISP3-204ENST00000433368 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
SEMA3BQ13214 POLK-217ENST00000515295 1438 ntTSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
SEMA3BQ13214 PRKACB-219ENST00000614872 4306 ntTSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
SEMA3BQ13214 DDX60L-207ENST00000505890 4568 ntTSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
SEMA3BQ13214 FAM35BP-202ENST00000497389 3337 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SEMA3BQ13214 LUZP2-208ENST00000620308 4981 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
SEMA3BQ13214 MARCH7-202ENST00000409175 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
SEMA3BQ13214 EVI5-201ENST00000370331 7403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
SEMA3BQ13214 OR4M1-202ENST00000641200 3493 ntAPPRIS P1 BASIC3.32□□□□□ -1.88
SEMA3BQ13214 EXOC6-203ENST00000371552 3564 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
SEMA3BQ13214 RNU6-266P-201ENST00000364225 107 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SEMA3BQ13214 RNU1-140P-201ENST00000365040 165 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SEMA3BQ13214 SPRR2E-201ENST00000368750 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
SEMA3BQ13214 SNORA1.3-201ENST00000384676 136 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SEMA3BQ13214 RPS4XP3-201ENST00000398541 413 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SEMA3BQ13214 AL592148.1-201ENST00000413568 445 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SEMA3BQ13214 AC097662.1-205ENST00000433324 241 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
SEMA3BQ13214 MTND4LP16-201ENST00000440828 295 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SEMA3BQ13214 RPS4XP22-201ENST00000480755 780 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SEMA3BQ13214 HMGB1P30-201ENST00000492455 606 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SEMA3BQ13214 PLCXD2-AS1-201ENST00000493131 491 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
SEMA3BQ13214 AC121154.1-201ENST00000507299 430 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
SEMA3BQ13214 MTND3P22-201ENST00000510932 243 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SEMA3BQ13214 OR56A5-202ENST00000532411 942 ntAPPRIS P1 BASIC3.32□□□□□ -1.88
SEMA3BQ13214 AMZ2P1-203ENST00000565833 850 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SEMA3BQ13214 AC005668.1-201ENST00000571142 476 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SEMA3BQ13214 AP001496.1-201ENST00000579113 471 ntTSL 4 BASIC3.32□□□□□ -1.88
SEMA3BQ13214 MIR3672-201ENST00000584290 82 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SEMA3BQ13214 AC243960.4-201ENST00000600532 288 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SEMA3BQ13214 AC006023.1-201ENST00000603944 259 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SEMA3BQ13214 AL033523.1-201ENST00000605153 153 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SEMA3BQ13214 uc_338.5-201ENST00000611839 155 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SEMA3BQ13214 MIR7106-201ENST00000612419 65 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SEMA3BQ13214 AC009233.1-201ENST00000616477 371 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SEMA3BQ13214 TPTEP1-208ENST00000636884 213 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SEMA3BQ13214 AC112487.2-201ENST00000637950 304 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SEMA3BQ13214 LINC00890-202ENST00000569275 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
SEMA3BQ13214 PRKACB-201ENST00000370680 1914 ntTSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
SEMA3BQ13214 AC022336.2-201ENST00000568966 2538 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SEMA3BQ13214 ZNF280C-201ENST00000370978 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
SEMA3BQ13214 TMEM59-205ENST00000371348 1911 ntTSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
SEMA3BQ13214 MIR412-201ENST00000362142 91 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SEMA3BQ13214 Y_RNA.184-201ENST00000363884 108 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SEMA3BQ13214 RNU6-1013P-201ENST00000384180 107 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SEMA3BQ13214 RNU6-1035P-201ENST00000384477 107 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SEMA3BQ13214 SNORA44-201ENST00000384584 132 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SEMA3BQ13214 MT-TD-201ENST00000387419 68 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SEMA3BQ13214 SNORA40C-201ENST00000391285 128 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SEMA3BQ13214 MIR450B-201ENST00000401182 78 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SEMA3BQ13214 AL138885.1-201ENST00000405921 675 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SEMA3BQ13214 AC241644.2-201ENST00000426504 480 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
SEMA3BQ13214 GYPB-201ENST00000429670 239 ntTSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
SEMA3BQ13214 HMGB1P18-201ENST00000438801 619 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SEMA3BQ13214 BRK1P2-201ENST00000442875 223 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SEMA3BQ13214 AL035634.1-201ENST00000446768 372 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
SEMA3BQ13214 AL109763.1-201ENST00000455391 461 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
SEMA3BQ13214 AL583843.1-201ENST00000456070 346 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.9 ms