Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 MTND4LP5-201ENST00000605152 292 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
GPS1Q13098 AC123912.5-201ENST00000605470 343 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
GPS1Q13098 RMST_7.1-201ENST00000621935 268 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
GPS1Q13098 OR4C16-201ENST00000623907 933 ntAPPRIS P1 BASIC3.32□□□□□ -1.88
GPS1Q13098 AL161912.2-201ENST00000565707 3007 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
GPS1Q13098 PHF6-201ENST00000332070 4759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
GPS1Q13098 SOCS4-201ENST00000339298 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
GPS1Q13098 RAPGEF6-210ENST00000512052 3535 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
GPS1Q13098 CDC27-207ENST00000531206 3177 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
GPS1Q13098 EVI2A-201ENST00000247270 1860 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
GPS1Q13098 MTND5P7-201ENST00000413558 1798 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
GPS1Q13098 MTRNR2L10-201ENST00000545075 1530 ntAPPRIS P1 BASIC3.31□□□□□ -1.88
GPS1Q13098 U3.6-201ENST00000363622 211 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
GPS1Q13098 Y_RNA.529-201ENST00000384586 119 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
GPS1Q13098 TRAJ31-201ENST00000390506 57 ntAPPRIS P1 BASIC3.31□□□□□ -1.88
GPS1Q13098 RNA5SP252-201ENST00000391131 119 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
GPS1Q13098 AL356057.2-201ENST00000403318 432 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
GPS1Q13098 SNORA11-201ENST00000408789 128 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
GPS1Q13098 MORN2-203ENST00000409131 544 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
GPS1Q13098 NDUFS5P4-201ENST00000412983 318 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
GPS1Q13098 AL160162.1-202ENST00000417654 244 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
GPS1Q13098 PGBD4P6-201ENST00000421501 610 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
GPS1Q13098 ATP6V0E1P4-201ENST00000427294 242 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
GPS1Q13098 AC233279.1-201ENST00000455300 423 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
GPS1Q13098 AC093663.1-201ENST00000497190 394 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
GPS1Q13098 LINC02146-201ENST00000504244 509 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
GPS1Q13098 AC010265.1-201ENST00000513509 211 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
GPS1Q13098 AC087854.1-201ENST00000519706 414 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
GPS1Q13098 LINC02293-201ENST00000548335 574 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
GPS1Q13098 AC025423.5-201ENST00000550230 219 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
GPS1Q13098 AC120045.1-201ENST00000563502 251 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
GPS1Q13098 LINC02164-201ENST00000566684 272 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
GPS1Q13098 AC139426.2-201ENST00000568289 251 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
GPS1Q13098 AC087463.1-201ENST00000568541 556 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
GPS1Q13098 AP001496.1-201ENST00000579113 471 ntTSL 4 BASIC3.31□□□□□ -1.88
GPS1Q13098 MIR4429-201ENST00000580105 73 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
GPS1Q13098 MIR3922-201ENST00000585192 84 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
GPS1Q13098 AL512625.3-207ENST00000609749 477 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
GPS1Q13098 AL132765.2-201ENST00000610812 351 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
GPS1Q13098 AL157817.1-201ENST00000614264 790 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
GPS1Q13098 DAOA-AS1_2.1-201ENST00000614829 187 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
GPS1Q13098 AL138726.1-201ENST00000614873 333 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
GPS1Q13098 SMAD5-AS1_2.1-201ENST00000617906 131 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
GPS1Q13098 MAGI2-AS3-224ENST00000619135 205 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
GPS1Q13098 AC104971.4-201ENST00000622763 249 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
GPS1Q13098 AC112487.2-201ENST00000637950 304 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
GPS1Q13098 CLOCK-201ENST00000309964 10304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
GPS1Q13098 SNX10-209ENST00000619420 2361 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
GPS1Q13098 HMGN5-201ENST00000358130 2126 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
GPS1Q13098 NBEAL1-203ENST00000449802 10938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
GPS1Q13098 MAPK10-362ENST00000641864 4484 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
GPS1Q13098 CDK1-209ENST00000614696 1884 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
GPS1Q13098 RHOT1-204ENST00000394692 2960 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
GPS1Q13098 P2RY13-201ENST00000325602 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
GPS1Q13098 EYS-204ENST00000370621 10485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
GPS1Q13098 ROS1-202ENST00000368508 7435 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
GPS1Q13098 ZCCHC10-201ENST00000324170 2178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
GPS1Q13098 Y_RNA.212-201ENST00000364177 102 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
GPS1Q13098 Y_RNA.356-201ENST00000365475 113 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
GPS1Q13098 MIR23B-201ENST00000384832 97 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
GPS1Q13098 MIR34A-201ENST00000385130 110 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
GPS1Q13098 MIR670-201ENST00000390142 98 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
GPS1Q13098 RPL5P18-201ENST00000406671 891 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
GPS1Q13098 NCOR1P3-201ENST00000420479 303 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
GPS1Q13098 AP003025.1-201ENST00000421650 149 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
GPS1Q13098 AC091286.1-201ENST00000431233 461 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
GPS1Q13098 AC092573.2-202ENST00000437243 336 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
GPS1Q13098 AL359672.1-201ENST00000442302 409 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
GPS1Q13098 AC104472.2-201ENST00000469035 601 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
GPS1Q13098 AC026801.1-201ENST00000497178 464 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
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GPS1Q13098 LIAS-206ENST00000513731 826 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
GPS1Q13098 RNU6-1332P-201ENST00000516666 104 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
GPS1Q13098 COPS8P3-201ENST00000526024 482 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
GPS1Q13098 AP005597.4-201ENST00000526762 229 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
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GPS1Q13098 RPS3AP23-202ENST00000574601 686 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
GPS1Q13098 C8orf59P2-201ENST00000603441 271 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
GPS1Q13098 RNU6-85P-201ENST00000605989 107 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
GPS1Q13098 AC099778.2-201ENST00000610904 211 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
GPS1Q13098 UBE2E2-206ENST00000613545 282 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
GPS1Q13098 uc_338.15-201ENST00000615470 191 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
GPS1Q13098 AL359697.1-201ENST00000624879 587 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
GPS1Q13098 TEX41-300ENST00000631048 69 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
GPS1Q13098 NUDT12-201ENST00000230792 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
GPS1Q13098 ZNF826P-207ENST00000622273 1910 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
GPS1Q13098 PALMD-205ENST00000615664 1844 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
GPS1Q13098 MKLN1-201ENST00000352689 11156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
GPS1Q13098 PRKACB-201ENST00000370680 1914 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
GPS1Q13098 RNU6-128P-201ENST00000383976 107 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
GPS1Q13098 RNU6-198P-201ENST00000384258 104 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
GPS1Q13098 EIF4EBP2P3-201ENST00000403144 334 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
GPS1Q13098 RPL7P37-201ENST00000425095 738 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
GPS1Q13098 TOMM20P4-201ENST00000427861 435 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
GPS1Q13098 MTND3P23-201ENST00000431980 347 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
GPS1Q13098 HMGN2P31-201ENST00000432430 273 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
GPS1Q13098 AL159987.2-201ENST00000432754 307 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
GPS1Q13098 RPL32P28-201ENST00000443577 397 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
GPS1Q13098 MTCO1P29-201ENST00000496868 288 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
GPS1Q13098 AC008526.1-201ENST00000509149 338 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
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