Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 RBM11P1-201ENST00000604951 799 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
FOXO1Q12778 AL670379.9-201ENST00000605428 253 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
FOXO1Q12778 ATP5A1P2-202ENST00000616464 443 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
FOXO1Q12778 MFSD8-233ENST00000641482 4860 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
FOXO1Q12778 CNOT6L-201ENST00000504123 8843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.17□□□□□ -1.9
FOXO1Q12778 MTRNR2L10-201ENST00000545075 1530 ntAPPRIS P1 BASIC3.17□□□□□ -1.9
FOXO1Q12778 SNX10-209ENST00000619420 2361 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
FOXO1Q12778 MGAT4C-210ENST00000620241 3194 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.16□□□□□ -1.9
FOXO1Q12778 ARHGAP12-201ENST00000311380 4625 ntTSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
FOXO1Q12778 ZNF519P1-201ENST00000449011 1626 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
FOXO1Q12778 AC138393.1-203ENST00000327086 343 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
FOXO1Q12778 RNU6-748P-201ENST00000384648 107 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
FOXO1Q12778 AC009411.1-202ENST00000412424 548 ntTSL 4 BASIC3.16□□□□□ -1.9
FOXO1Q12778 TTTY8-202ENST00000426035 518 ntTSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
FOXO1Q12778 AC006989.1-201ENST00000427212 131 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
FOXO1Q12778 SRIP2-201ENST00000428470 166 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
FOXO1Q12778 MTND1P2-201ENST00000430604 821 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
FOXO1Q12778 ZEB1-AS1-204ENST00000450834 576 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
FOXO1Q12778 TTTY8B-202ENST00000455570 518 ntTSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
FOXO1Q12778 RPS27P29-201ENST00000463110 252 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
FOXO1Q12778 HMGN2P26-201ENST00000463169 339 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
FOXO1Q12778 RNU6-377P-201ENST00000515965 102 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
FOXO1Q12778 IGKV2-26-201ENST00000518305 343 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
FOXO1Q12778 AP006245.1-201ENST00000522549 120 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
FOXO1Q12778 AC023050.3-201ENST00000541142 333 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
FOXO1Q12778 AL049775.2-201ENST00000557547 558 ntTSL 4 BASIC3.16□□□□□ -1.9
FOXO1Q12778 AL133383.1-201ENST00000569292 901 ntTSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
FOXO1Q12778 AC007598.2-201ENST00000569490 539 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
FOXO1Q12778 AC009163.5-201ENST00000575421 637 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
FOXO1Q12778 AC104564.2-201ENST00000581240 270 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
FOXO1Q12778 AC015911.6-201ENST00000588445 457 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
FOXO1Q12778 AP001972.3-202ENST00000603012 375 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
FOXO1Q12778 APOOP1-201ENST00000604695 592 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
FOXO1Q12778 MIR663AHG-231ENST00000609044 590 ntTSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
FOXO1Q12778 Z69720.2-201ENST00000624755 279 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
FOXO1Q12778 C6orf10-202ENST00000375015 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
FOXO1Q12778 AC073073.2-201ENST00000609827 2578 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
FOXO1Q12778 PRB2-201ENST00000389362 1429 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
FOXO1Q12778 ROCK2-203ENST00000401753 4017 ntTSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
FOXO1Q12778 ZNF280D-201ENST00000267807 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
FOXO1Q12778 PWAR6-201ENST00000552334 4618 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
FOXO1Q12778 MTND5P27-201ENST00000428871 1720 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
FOXO1Q12778 NEB-201ENST00000172853 20634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
FOXO1Q12778 WRN-201ENST00000298139 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
FOXO1Q12778 AL356274.2-201ENST00000624379 3752 ntBASIC3.15□□□□□ -1.9
FOXO1Q12778 Y_RNA.100-201ENST00000363141 102 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
FOXO1Q12778 SNORA32.2-201ENST00000384049 122 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
FOXO1Q12778 AL117337.1-201ENST00000412789 444 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
FOXO1Q12778 MTND1P23-201ENST00000416931 372 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
FOXO1Q12778 RPL7P37-201ENST00000425095 738 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
FOXO1Q12778 AC005019.1-201ENST00000436455 431 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
FOXO1Q12778 AC073342.1-202ENST00000446192 457 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
FOXO1Q12778 AL354824.2-201ENST00000458004 446 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
FOXO1Q12778 RNU7-138P-201ENST00000459479 64 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
FOXO1Q12778 MED28P2-201ENST00000475771 317 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
FOXO1Q12778 MTCYBP18-201ENST00000501056 747 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
FOXO1Q12778 BMPR1B-AS1-201ENST00000510795 511 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
FOXO1Q12778 AC025465.4-201ENST00000513422 638 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
FOXO1Q12778 RNU2-27P-201ENST00000516185 142 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
FOXO1Q12778 SNORA74D-201ENST00000516404 141 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
FOXO1Q12778 SNORA43.2-201ENST00000516652 128 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
FOXO1Q12778 AC087854.1-201ENST00000519706 414 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
FOXO1Q12778 AC130469.1-201ENST00000597256 388 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
FOXO1Q12778 C9orf153-205ENST00000617985 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
FOXO1Q12778 AC009033.1-201ENST00000624279 431 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
FOXO1Q12778 MIR3529-201ENST00000637713 78 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
FOXO1Q12778 ADGRG2-206ENST00000360279 4702 ntTSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
FOXO1Q12778 MYOT-208ENST00000515645 1578 ntTSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.91
FOXO1Q12778 ZNF676-201ENST00000397121 2944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.91
FOXO1Q12778 DDX6-206ENST00000534980 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
FOXO1Q12778 NEB-218ENST00000603639 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
FOXO1Q12778 NEB-219ENST00000604864 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
FOXO1Q12778 ZNF626-204ENST00000612591 4404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
FOXO1Q12778 UTS2-202ENST00000361696 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
FOXO1Q12778 RNU6-78P-201ENST00000362897 107 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
FOXO1Q12778 RNU6-1083P-201ENST00000384022 107 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
FOXO1Q12778 AL162578.1-201ENST00000406202 378 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
FOXO1Q12778 UBE2Q2P12-201ENST00000414573 204 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
FOXO1Q12778 AL096701.2-201ENST00000416920 238 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
FOXO1Q12778 AC104332.2-201ENST00000429959 156 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
FOXO1Q12778 AL591043.1-201ENST00000432461 424 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
FOXO1Q12778 LINC00411-201ENST00000436722 461 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
FOXO1Q12778 AC124916.1-201ENST00000444020 547 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
FOXO1Q12778 RPS29P31-201ENST00000446147 164 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
FOXO1Q12778 GAS5-221ENST00000450589 632 ntTSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
FOXO1Q12778 AC087884.1-201ENST00000469738 328 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
FOXO1Q12778 RPL23AP45-201ENST00000476406 468 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
FOXO1Q12778 ODF2L-216ENST00000486215 311 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
FOXO1Q12778 Y_RNA.665-201ENST00000516177 98 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
FOXO1Q12778 RNA5SP380-201ENST00000517190 98 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
FOXO1Q12778 AC109479.2-201ENST00000517842 174 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
FOXO1Q12778 BTF3P12-201ENST00000519620 469 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
FOXO1Q12778 AC026333.2-201ENST00000542164 106 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
FOXO1Q12778 AC006518.2-202ENST00000544947 297 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
FOXO1Q12778 LINC02301-203ENST00000555798 789 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
FOXO1Q12778 UBE2Q2P8-201ENST00000560644 102 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
FOXO1Q12778 AC098617.1-215ENST00000594798 1152 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
FOXO1Q12778 AC010620.2-201ENST00000600135 313 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
FOXO1Q12778 AC008162.2-201ENST00000613352 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
FOXO1Q12778 AL442067.2-201ENST00000614033 363 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
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