Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

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Length 3,210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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CENPFP49454 AL445584.2-201ENST00000614030 616 ntTSL 5 BASIC-0.23□□□□□ -2.45
CENPFP49454 Y_RNA.246-201ENST00000364495 108 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
CENPFP49454 MIR506-201ENST00000384998 124 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
CENPFP49454 AC068533.3-201ENST00000435524 404 ntTSL 5 BASIC-0.24□□□□□ -2.45
CENPFP49454 TPMTP4-201ENST00000450749 678 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
CENPFP49454 AC108740.1-201ENST00000498629 225 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
CENPFP49454 AC022469.2-201ENST00000554759 396 ntTSL 5 BASIC-0.24□□□□□ -2.45
CENPFP49454 LINC02165-201ENST00000563061 443 ntTSL 3 BASIC-0.24□□□□□ -2.45
CENPFP49454 RNU6-1077P-201ENST00000410506 102 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
CENPFP49454 HMGN2P21-201ENST00000447764 270 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
CENPFP49454 LINC01495-202ENST00000534135 343 ntTSL 2 BASIC-0.24□□□□□ -2.45
CENPFP49454 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
CENPFP49454 DCAF17-212ENST00000611110 975 ntTSL 1 (best) BASIC-0.24□□□□□ -2.45
CENPFP49454 AL161423.1-201ENST00000613700 262 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
CENPFP49454 RNU6-152P-201ENST00000384037 107 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
CENPFP49454 SNAP23-203ENST00000397138 477 ntTSL 1 (best) BASIC-0.25□□□□□ -2.45
CENPFP49454 AC096531.1-201ENST00000419107 107 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
CENPFP49454 AL353777.1-201ENST00000425552 326 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
CENPFP49454 RPL18AP17-201ENST00000455326 198 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
CENPFP49454 SNORD126-201ENST00000459475 77 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
CENPFP49454 AP001025.1-201ENST00000486139 332 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
CENPFP49454 AC124854.1-202ENST00000513779 339 ntTSL 3 BASIC-0.25□□□□□ -2.45
CENPFP49454 SNORA31.13-201ENST00000516624 135 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
CENPFP49454 SNORA31.18-201ENST00000517043 134 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
CENPFP49454 LINC02562-201ENST00000561705 785 ntTSL 2 BASIC-0.25□□□□□ -2.45
CENPFP49454 AC126407.1-201ENST00000563044 566 ntTSL 4 BASIC-0.25□□□□□ -2.45
CENPFP49454 AC136618.2-201ENST00000575091 400 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
CENPFP49454 AC008739.2-201ENST00000597006 317 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
CENPFP49454 AL121992.2-201ENST00000606262 256 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
CENPFP49454 AP002791.1-201ENST00000623291 381 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
CENPFP49454 AC110079.1-202ENST00000635213 138 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
CENPFP49454 Y_RNA.146-201ENST00000363549 102 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
CENPFP49454 SNORD114-9-201ENST00000364370 72 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
CENPFP49454 RNU6-968P-201ENST00000384076 107 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
CENPFP49454 AL138737.1-202ENST00000418834 876 ntTSL 3 BASIC-0.25□□□□□ -2.45
CENPFP49454 HSPE1P13-201ENST00000451143 297 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
CENPFP49454 MTATP6P7-201ENST00000453315 681 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
CENPFP49454 MIR3165-201ENST00000579874 75 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
CENPFP49454 AC025594.3-201ENST00000613068 790 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
CENPFP49454 Y_RNA.86-201ENST00000363020 111 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
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CENPFP49454 AP003122.4-201ENST00000530980 758 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
CENPFP49454 AC012414.6-201ENST00000568241 401 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
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CENPFP49454 MIR4512-201ENST00000583257 77 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
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CENPFP49454 AC008443.7-201ENST00000622195 246 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
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CENPFP49454 AL158834.1-201ENST00000419441 466 ntTSL 5 BASIC-0.28□□□□□ -2.45
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CENPFP49454 RNU1-61P-201ENST00000516107 151 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
CENPFP49454 RNA5SP227-201ENST00000516184 113 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
CENPFP49454 AL450336.1-201ENST00000605180 586 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
CENPFP49454 AC021506.2-201ENST00000612354 169 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
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CENPFP49454 ARPC3P5-201ENST00000448802 534 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
CENPFP49454 AC022493.2-201ENST00000506122 481 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
CENPFP49454 SNORA51.2-201ENST00000364595 132 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
CENPFP49454 MIR19B1-201ENST00000384829 87 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
CENPFP49454 RNU6-272P-201ENST00000411028 104 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
CENPFP49454 ZFAND6P1-201ENST00000434138 605 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
CENPFP49454 ANKRD26P4-201ENST00000455755 950 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
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CENPFP49454 AL591926.4-201ENST00000616895 298 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
CENPFP49454 AL589655.1-201ENST00000405398 482 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
CENPFP49454 LINC01866-201ENST00000421181 201 ntTSL 3 BASIC-0.3□□□□□ -2.46
CENPFP49454 GS1-594A7.3-201ENST00000421585 574 ntTSL 2 BASIC-0.3□□□□□ -2.46
CENPFP49454 MTND4P20-201ENST00000424125 869 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
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