Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 LINC02484-201ENST00000513843 546 ntTSL 5 BASIC0.9□□□□□ -2.27
PTPRDP23468 RNU6-581P-201ENST00000516214 105 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
PTPRDP23468 AP003497.1-201ENST00000528472 562 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
PTPRDP23468 AC243960.4-201ENST00000600532 288 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
PTPRDP23468 AC091057.3-201ENST00000602684 733 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
PTPRDP23468 SNRPGP17-201ENST00000603780 214 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
PTPRDP23468 AL020996.3-201ENST00000606617 222 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
PTPRDP23468 AC005332.6-201ENST00000613178 446 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
PTPRDP23468 AL596245.1-201ENST00000618994 362 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
PTPRDP23468 AC132825.7-201ENST00000638744 335 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
PTPRDP23468 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.9□□□□□ -2.27
PTPRDP23468 Y_RNA.25-201ENST00000362528 102 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
PTPRDP23468 RNU5E-8P-201ENST00000363502 116 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
PTPRDP23468 SNORD114-2-201ENST00000363953 78 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
PTPRDP23468 SUGT1P1-201ENST00000379514 476 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
PTPRDP23468 TRAJ32-201ENST00000390505 66 ntAPPRIS P1 BASIC0.89□□□□□ -2.27
PTPRDP23468 RNU6-516P-201ENST00000411381 104 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
PTPRDP23468 KRTAP25-1-201ENST00000416044 370 ntAPPRIS P1 BASIC0.89□□□□□ -2.27
PTPRDP23468 AF212831.1-201ENST00000430064 377 ntTSL 3 BASIC0.89□□□□□ -2.27
PTPRDP23468 AL024508.1-201ENST00000432477 505 ntTSL 2 BASIC0.89□□□□□ -2.27
PTPRDP23468 AL353743.2-202ENST00000439544 473 ntTSL 3 BASIC0.89□□□□□ -2.27
PTPRDP23468 AC008869.1-201ENST00000510938 442 ntTSL 2 BASIC0.89□□□□□ -2.27
PTPRDP23468 AC025575.1-201ENST00000548497 544 ntTSL 4 BASIC0.89□□□□□ -2.27
PTPRDP23468 AL359212.1-201ENST00000556608 614 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
PTPRDP23468 PCLAF-207ENST00000559519 749 ntTSL 2 BASIC0.89□□□□□ -2.27
PTPRDP23468 AC012170.3-201ENST00000560159 297 ntTSL 2 BASIC0.89□□□□□ -2.27
PTPRDP23468 AC010900.2-201ENST00000604508 210 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
PTPRDP23468 AL118508.4-201ENST00000624142 1176 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
PTPRDP23468 DDX43P2-201ENST00000604753 1354 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
PTPRDP23468 OR13C4-201ENST00000277216 957 ntAPPRIS P1 BASIC0.89□□□□□ -2.27
PTPRDP23468 RNU6-1280P-201ENST00000365211 107 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
PTPRDP23468 MIR218-1-201ENST00000384999 110 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
PTPRDP23468 AC244453.4-201ENST00000419150 388 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
PTPRDP23468 AC082650.1-201ENST00000503542 575 ntTSL 4 BASIC0.89□□□□□ -2.27
PTPRDP23468 LINC02472-201ENST00000512268 575 ntTSL 2 BASIC0.89□□□□□ -2.27
PTPRDP23468 AP003181.1-201ENST00000528811 445 ntTSL 3 BASIC0.89□□□□□ -2.27
PTPRDP23468 AP000753.2-201ENST00000540307 423 ntTSL 3 BASIC0.89□□□□□ -2.27
PTPRDP23468 AC011712.1-201ENST00000588959 234 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
PTPRDP23468 AL450270.1-201ENST00000606160 391 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
PTPRDP23468 AC253576.2-201ENST00000618815 580 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
PTPRDP23468 AP003476.1-201ENST00000623984 516 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
PTPRDP23468 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC0.89□□□□□ -2.27
PTPRDP23468 MUC15-204ENST00000527569 1386 ntTSL 1 (best) BASIC0.88□□□□□ -2.27
PTPRDP23468 AC009541.1-201ENST00000438279 2662 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
PTPRDP23468 RNU5E-1-201ENST00000362477 120 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
PTPRDP23468 SNORA8-201ENST00000384574 139 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
PTPRDP23468 MTCO1P56-201ENST00000401674 224 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
PTPRDP23468 AL591034.2-201ENST00000402839 359 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
PTPRDP23468 AL365434.1-201ENST00000412362 380 ntTSL 3 BASIC0.88□□□□□ -2.27
PTPRDP23468 AL162254.1-202ENST00000419604 497 ntTSL 5 BASIC0.88□□□□□ -2.27
PTPRDP23468 AC097463.2-201ENST00000421074 142 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
PTPRDP23468 AL353706.1-201ENST00000436728 494 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
PTPRDP23468 MTND4P6-201ENST00000438297 472 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
PTPRDP23468 AC069549.1-201ENST00000451584 499 ntTSL 3 BASIC0.88□□□□□ -2.27
PTPRDP23468 AC092747.1-202ENST00000540595 380 ntTSL 5 BASIC0.88□□□□□ -2.27
PTPRDP23468 AP003781.1-201ENST00000543403 404 ntTSL 3 BASIC0.88□□□□□ -2.27
PTPRDP23468 AC093025.1-201ENST00000547795 569 ntTSL 2 BASIC0.88□□□□□ -2.27
PTPRDP23468 AL118556.1-201ENST00000555257 502 ntTSL 2 BASIC0.88□□□□□ -2.27
PTPRDP23468 AC005951.2-201ENST00000576282 495 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
PTPRDP23468 AC012213.3-201ENST00000577199 777 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
PTPRDP23468 MIR4789-201ENST00000577469 82 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
PTPRDP23468 AC002545.1-201ENST00000592511 181 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
PTPRDP23468 AC112191.3-201ENST00000604371 277 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
PTPRDP23468 AC009974.1-201ENST00000608881 455 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
PTPRDP23468 AC243773.3-201ENST00000613270 256 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
PTPRDP23468 TMEM154-204ENST00000613578 486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.88□□□□□ -2.27
PTPRDP23468 AL078604.3-201ENST00000615580 211 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
PTPRDP23468 RGS13-201ENST00000391995 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.87□□□□□ -2.27
PTPRDP23468 SNRPG-202ENST00000413456 398 ntTSL 3 BASIC0.87□□□□□ -2.27
PTPRDP23468 UBE2FP1-201ENST00000416536 447 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
PTPRDP23468 MTCO2P5-201ENST00000422621 426 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
PTPRDP23468 AL049637.1-201ENST00000424664 503 ntTSL 5 BASIC0.87□□□□□ -2.27
PTPRDP23468 ZFAND6P1-201ENST00000434138 605 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
PTPRDP23468 BBIP1-206ENST00000447005 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.87□□□□□ -2.27
PTPRDP23468 CHODL-AS1-201ENST00000447175 1117 ntTSL 2 BASIC0.87□□□□□ -2.27
PTPRDP23468 XACT-201ENST00000468762 497 ntTSL 5 BASIC0.87□□□□□ -2.27
PTPRDP23468 AC092925.1-201ENST00000470739 493 ntTSL 3 BASIC0.87□□□□□ -2.27
PTPRDP23468 RN7SKP258-201ENST00000517151 304 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
PTPRDP23468 AC104248.1-202ENST00000524134 486 ntTSL 5 BASIC0.87□□□□□ -2.27
PTPRDP23468 CYB5AP5-201ENST00000549779 389 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
PTPRDP23468 AL160236.1-201ENST00000556317 195 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
PTPRDP23468 MMP2-AS1-201ENST00000565307 593 ntTSL 4 BASIC0.87□□□□□ -2.27
PTPRDP23468 MIR3167-201ENST00000579623 85 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
PTPRDP23468 AC084824.4-201ENST00000620106 731 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
PTPRDP23468 AC013470.2-206ENST00000636804 771 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC0.87□□□□□ -2.27
PTPRDP23468 ATM-228ENST00000639240 498 ntTSL 5 BASIC0.87□□□□□ -2.27
PTPRDP23468 AC011604.2-202ENST00000540229 2451 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC0.87□□□□□ -2.27
PTPRDP23468 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.87□□□□□ -2.27
PTPRDP23468 ICE2P2-201ENST00000483823 2787 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
PTPRDP23468 ECT2-211ENST00000441497 2825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.87□□□□□ -2.27
PTPRDP23468 RNU1-58P-201ENST00000362413 163 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
PTPRDP23468 RNU6-486P-201ENST00000363116 107 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
PTPRDP23468 TPMTP2-201ENST00000414372 726 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
PTPRDP23468 RPL26P27-201ENST00000414397 437 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
PTPRDP23468 AC009310.1-201ENST00000414414 451 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
PTPRDP23468 AC092427.1-201ENST00000439177 601 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
PTPRDP23468 TMEM247-203ENST00000449601 741 ntTSL 1 (best) BASIC0.87□□□□□ -2.27
PTPRDP23468 MCCC1-AS1-201ENST00000471731 765 ntTSL 5 BASIC0.87□□□□□ -2.27
PTPRDP23468 AC018437.1-201ENST00000492214 406 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
PTPRDP23468 LINC02173-201ENST00000504132 521 ntTSL 2 BASIC0.87□□□□□ -2.27
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