Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 AC138649.3-201ENST00000622154 254 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
LRRTM2O43300 FRG1KP-201ENST00000623592 341 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
LRRTM2O43300 AC010297.1-201ENST00000623948 149 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
LRRTM2O43300 AK9-203ENST00000368948 2478 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
LRRTM2O43300 AC080100.1-201ENST00000624239 5356 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
LRRTM2O43300 TEX9-207ENST00000560582 2005 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
LRRTM2O43300 RNU6-1097P-201ENST00000363586 107 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
LRRTM2O43300 RNU6-884P-201ENST00000363889 107 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
LRRTM2O43300 RNU6-259P-201ENST00000383999 107 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
LRRTM2O43300 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
LRRTM2O43300 RNU6-750P-201ENST00000390946 107 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
LRRTM2O43300 RPS4XP7-201ENST00000406274 780 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
LRRTM2O43300 LINC00301-202ENST00000412599 772 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
LRRTM2O43300 RPS12P24-201ENST00000412619 387 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
LRRTM2O43300 MTCO3P41-201ENST00000414801 328 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
LRRTM2O43300 AC104651.1-201ENST00000427559 735 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
LRRTM2O43300 AC018693.1-201ENST00000442829 550 ntTSL 4 BASIC2.44□□□□□ -2.02
LRRTM2O43300 OSTCP8-201ENST00000445117 448 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
LRRTM2O43300 PLS1-AS1-201ENST00000485338 346 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
LRRTM2O43300 HMGB1P29-201ENST00000505659 499 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
LRRTM2O43300 AC008549.1-201ENST00000512900 643 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
LRRTM2O43300 RNU6-410P-201ENST00000517006 107 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
LRRTM2O43300 AC044798.1-201ENST00000565146 418 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
LRRTM2O43300 PWRN1-209ENST00000568019 359 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
LRRTM2O43300 AL049779.4-201ENST00000604500 156 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
LRRTM2O43300 ZNFX1-AS1_2.1-201ENST00000610973 93 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
LRRTM2O43300 AC130324.3-201ENST00000614165 542 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
LRRTM2O43300 AC244093.3-201ENST00000615419 411 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
LRRTM2O43300 AC008781.3-201ENST00000622826 335 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
LRRTM2O43300 AC103710.2-202ENST00000641454 2853 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
LRRTM2O43300 OR51A7-202ENST00000641490 2186 ntAPPRIS P1 BASIC2.44□□□□□ -2.02
LRRTM2O43300 LIPI-203ENST00000536861 1529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
LRRTM2O43300 ZNF117-204ENST00000620222 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
LRRTM2O43300 ECT2-211ENST00000441497 2825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
LRRTM2O43300 CFHR4-204ENST00000608469 1601 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
LRRTM2O43300 SLC4A7-201ENST00000295736 7757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
LRRTM2O43300 AC080128.1-201ENST00000474389 1917 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
LRRTM2O43300 DNAH7-201ENST00000312428 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
LRRTM2O43300 RNU6-512P-201ENST00000364438 103 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
LRRTM2O43300 DEFA7P-201ENST00000382676 285 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
LRRTM2O43300 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
LRRTM2O43300 FGFR1OP2P1-201ENST00000395943 500 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
LRRTM2O43300 RNU6ATAC16P-201ENST00000408591 138 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
LRRTM2O43300 AC080125.1-201ENST00000414888 684 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
LRRTM2O43300 AF241725.1-201ENST00000416182 480 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
LRRTM2O43300 SKA2P1-201ENST00000425592 390 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
LRRTM2O43300 CECR9-201ENST00000453421 199 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
LRRTM2O43300 AL133481.3-201ENST00000456546 333 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
LRRTM2O43300 RPS29P20-201ENST00000489592 171 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
LRRTM2O43300 RPL39P36-201ENST00000490784 156 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
LRRTM2O43300 LNX1-AS1-202ENST00000510785 550 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
LRRTM2O43300 AC093206.1-201ENST00000515364 497 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
LRRTM2O43300 RNA5SP290-201ENST00000517133 127 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
LRRTM2O43300 MTCYBP20-201ENST00000524239 1129 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
LRRTM2O43300 AP003122.3-201ENST00000526316 255 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
LRRTM2O43300 AC084851.1-201ENST00000529105 249 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
LRRTM2O43300 AC092746.1-201ENST00000542819 562 ntTSL 4 BASIC2.43□□□□□ -2.02
LRRTM2O43300 EIF1P4-201ENST00000572664 335 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
LRRTM2O43300 AC004223.2-201ENST00000590309 544 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
LRRTM2O43300 AC174048.1-201ENST00000603389 144 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
LRRTM2O43300 AC025449.1-201ENST00000603896 529 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
LRRTM2O43300 AC022893.3-201ENST00000607665 437 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
LRRTM2O43300 AC013562.2-201ENST00000611632 603 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
LRRTM2O43300 AC009161.2-201ENST00000624626 138 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
LRRTM2O43300 SEPT14P19-202ENST00000632397 370 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
LRRTM2O43300 MTND4P27-201ENST00000450813 1354 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
LRRTM2O43300 MTND5P29-201ENST00000458676 1807 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
LRRTM2O43300 TAB3-205ENST00000378933 6671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
LRRTM2O43300 AC103993.1-201ENST00000521500 1584 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
LRRTM2O43300 EDDM3A-201ENST00000326842 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
LRRTM2O43300 MIR6073-201ENST00000352083 89 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
LRRTM2O43300 RNU6-778P-201ENST00000363269 103 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
LRRTM2O43300 RNU6-288P-201ENST00000363690 104 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
LRRTM2O43300 RNY1P12-201ENST00000364251 105 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
LRRTM2O43300 Y_RNA.245-201ENST00000364493 95 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
LRRTM2O43300 AKAP14-203ENST00000371425 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
LRRTM2O43300 SNORA75B-201ENST00000384053 137 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
LRRTM2O43300 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
LRRTM2O43300 SNORA67.4-201ENST00000384688 142 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
LRRTM2O43300 AL139039.1-201ENST00000401900 692 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
LRRTM2O43300 GSTA9P-201ENST00000406231 611 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
LRRTM2O43300 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
LRRTM2O43300 AC006150.1-201ENST00000412014 263 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
LRRTM2O43300 AC096649.2-201ENST00000416186 393 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
LRRTM2O43300 BTF3L4P3-201ENST00000418879 476 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
LRRTM2O43300 AL353193.1-201ENST00000421444 268 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
LRRTM2O43300 AL451074.3-201ENST00000437709 472 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
LRRTM2O43300 AC079781.2-201ENST00000446424 169 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
LRRTM2O43300 RPS27P27-201ENST00000498779 255 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
LRRTM2O43300 AC117522.1-201ENST00000509821 380 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
LRRTM2O43300 AC108078.2-201ENST00000510750 236 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
LRRTM2O43300 AC009902.1-201ENST00000519351 183 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
LRRTM2O43300 RPL7P20-201ENST00000520308 745 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
LRRTM2O43300 FAM92A1P1-201ENST00000528023 890 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
LRRTM2O43300 TRAV1-1-201ENST00000542354 392 ntAPPRIS P1 BASIC2.42□□□□□ -2.02
LRRTM2O43300 AL355076.2-202ENST00000553754 574 ntTSL 4 BASIC2.42□□□□□ -2.02
LRRTM2O43300 SUB1P2-201ENST00000556401 297 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
LRRTM2O43300 AL359212.1-201ENST00000556608 614 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
LRRTM2O43300 DISC1FP1-204ENST00000563681 466 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
LRRTM2O43300 AC098848.2-201ENST00000588023 330 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.3 ms