Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 TTTY8-202ENST00000426035 518 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
SIX1Q15475 AL592045.1-201ENST00000429867 352 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SIX1Q15475 AC012445.1-201ENST00000442831 607 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
SIX1Q15475 AC108938.1-201ENST00000451204 136 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SIX1Q15475 LINC01201-202ENST00000451431 401 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
SIX1Q15475 AC069549.1-201ENST00000451584 499 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
SIX1Q15475 CECR9-201ENST00000453421 199 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SIX1Q15475 NDUFAF4P4-201ENST00000454883 502 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SIX1Q15475 TTTY8B-202ENST00000455570 518 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
SIX1Q15475 LINC01323-201ENST00000486767 576 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
SIX1Q15475 AC009646.1-201ENST00000510455 318 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SIX1Q15475 RNU6-123P-201ENST00000516163 102 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SIX1Q15475 RNU6-314P-201ENST00000516574 104 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SIX1Q15475 RNU6-928P-201ENST00000516876 104 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SIX1Q15475 RNU6-56P-201ENST00000516986 93 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SIX1Q15475 RNU6-685P-201ENST00000517088 95 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SIX1Q15475 CLEC2D-214ENST00000543300 399 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
SIX1Q15475 CLEC2D-216ENST00000545918 288 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
SIX1Q15475 ADI1P3-201ENST00000549509 470 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SIX1Q15475 AC079907.1-201ENST00000552707 374 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
SIX1Q15475 BNIP3P9-201ENST00000603714 553 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SIX1Q15475 U4.5-201ENST00000617137 123 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SIX1Q15475 AC011155.2-201ENST00000623202 216 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SIX1Q15475 AL160394.1-201ENST00000624765 724 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SIX1Q15475 SEPT14P19-202ENST00000632397 370 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
SIX1Q15475 AC068137.3-201ENST00000639191 341 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SIX1Q15475 AC073869.6-201ENST00000640656 341 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SIX1Q15475 N4BP2L2-211ENST00000504114 2513 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
SIX1Q15475 RGS18-201ENST00000367460 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
SIX1Q15475 MTND4P5-201ENST00000435821 1374 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SIX1Q15475 CASC1-205ENST00000545133 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
SIX1Q15475 CEP57L1-216ENST00000521522 2259 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
SIX1Q15475 RNU6-1085P-201ENST00000363576 107 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SIX1Q15475 Y_RNA.372-201ENST00000365599 102 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SIX1Q15475 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SIX1Q15475 RNU6-517P-201ENST00000384362 110 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SIX1Q15475 Y_RNA.481-201ENST00000384373 102 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SIX1Q15475 RNU6-1158P-201ENST00000391167 107 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SIX1Q15475 AP000473.1-201ENST00000413645 550 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
SIX1Q15475 AL356134.1-201ENST00000419815 373 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
SIX1Q15475 AL160272.1-201ENST00000421509 521 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
SIX1Q15475 AL445123.1-201ENST00000422023 446 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
SIX1Q15475 AC093151.3-203ENST00000422305 514 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
SIX1Q15475 AL355674.1-201ENST00000423681 648 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
SIX1Q15475 LINC02541-201ENST00000427157 327 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
SIX1Q15475 MAGEA8-AS1-201ENST00000427671 476 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
SIX1Q15475 ARL5AP4-201ENST00000430731 512 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SIX1Q15475 GPM6BP2-201ENST00000432046 144 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SIX1Q15475 LINC00844-201ENST00000432535 477 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
SIX1Q15475 AL591704.1-201ENST00000432574 275 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SIX1Q15475 MTND1P4-201ENST00000435196 415 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SIX1Q15475 AC007179.2-207ENST00000435557 556 ntTSL 4 BASIC2.48□□□□□ -2.01
SIX1Q15475 GPM6BP1-201ENST00000446387 144 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SIX1Q15475 AP000431.2-201ENST00000450653 790 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
SIX1Q15475 FDX1P2-201ENST00000450769 375 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SIX1Q15475 LINC00571-203ENST00000454060 525 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
SIX1Q15475 RPS29P15-201ENST00000458329 171 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SIX1Q15475 RNU7-63P-201ENST00000459054 62 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SIX1Q15475 AC006512.1-201ENST00000468816 291 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SIX1Q15475 RPL23AP45-201ENST00000476406 468 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SIX1Q15475 LINC02377-201ENST00000500169 450 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
SIX1Q15475 RBBP4P6-201ENST00000508098 202 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SIX1Q15475 Y_RNA.693-201ENST00000516641 110 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SIX1Q15475 RNA5SP503-201ENST00000517047 117 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SIX1Q15475 AC104383.1-201ENST00000530297 370 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SIX1Q15475 RANP3-201ENST00000530970 276 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SIX1Q15475 AL512310.1-201ENST00000548639 172 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SIX1Q15475 AC021979.1-201ENST00000553822 336 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
SIX1Q15475 HMGB1P33-201ENST00000563485 527 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SIX1Q15475 MIR4298-201ENST00000584380 73 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SIX1Q15475 AC005357.2-201ENST00000586473 583 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
SIX1Q15475 AC008752.3-201ENST00000588113 712 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SIX1Q15475 AC004805.2-201ENST00000605382 482 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SIX1Q15475 MIR15A-201ENST00000607334 83 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SIX1Q15475 FTX_3.1-201ENST00000610451 147 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SIX1Q15475 LINC01002-215ENST00000632203 314 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
SIX1Q15475 U6.114-201ENST00000636407 96 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SIX1Q15475 Z99571.1-201ENST00000636677 394 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SIX1Q15475 ECT2-211ENST00000441497 2825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
SIX1Q15475 AC103993.1-201ENST00000521500 1584 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
SIX1Q15475 OR4M1-202ENST00000641200 3493 ntAPPRIS P1 BASIC2.48□□□□□ -2.01
SIX1Q15475 AC027514.1-201ENST00000588561 1603 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SIX1Q15475 C5orf46-201ENST00000318315 506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
SIX1Q15475 MIR449A-201ENST00000362113 91 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SIX1Q15475 RNU6-1322P-201ENST00000364309 107 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SIX1Q15475 Y_RNA.381-201ENST00000365666 102 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SIX1Q15475 RNU6-1029P-201ENST00000384109 107 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SIX1Q15475 RNU6-780P-201ENST00000391030 104 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SIX1Q15475 AL359511.1-201ENST00000402970 211 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SIX1Q15475 MTCYBP5-201ENST00000423752 1135 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SIX1Q15475 MTCO3P30-201ENST00000426425 670 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SIX1Q15475 CALM2P2-201ENST00000428512 440 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SIX1Q15475 C8orf59P1-201ENST00000429930 303 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SIX1Q15475 AC005160.1-201ENST00000432405 381 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
SIX1Q15475 AL606489.2-201ENST00000433886 234 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SIX1Q15475 AL122017.1-201ENST00000435858 784 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
SIX1Q15475 SNRPEP9-201ENST00000436794 238 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SIX1Q15475 DPPA3P1-201ENST00000448050 469 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SIX1Q15475 AL109933.2-201ENST00000452651 260 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SIX1Q15475 RPS3P1-201ENST00000456781 192 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.6 ms