Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 AC025755.1-201ENST00000521306 278 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 LINC02442-202ENST00000540761 382 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 LINC02095-202ENST00000543512 323 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 MTND6P33-201ENST00000571794 183 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 B3GNTL1P2-201ENST00000603673 288 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 AC079587.1-201ENST00000603846 277 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 AP000787.2-201ENST00000604432 568 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 BRDTP1-201ENST00000605735 677 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 AC011476.5-201ENST00000615594 130 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 uc_338.13-201ENST00000618243 179 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 AL360181.4-201ENST00000621752 134 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 AC006065.5-201ENST00000623427 349 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 GYPB-216ENST00000638448 363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 ZMYND11-217ENST00000627286 3914 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 ERBIN-212ENST00000508515 4374 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 PLCL1-203ENST00000437704 5979 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 ZNF208-207ENST00000609966 3653 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 TARID-205ENST00000607033 2960 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 GMNC-201ENST00000442080 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 AC092650.1-201ENST00000447571 1808 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 CDH8-205ENST00000577730 8009 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 NFIB-203ENST00000380934 2142 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 IPO11-202ENST00000409296 3564 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 SLCO1B1-201ENST00000256958 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 SLAIN2-205ENST00000512093 4219 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 LINC01239-202ENST00000436786 2347 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 MUC7-201ENST00000304887 2443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 KCNJ1-202ENST00000324036 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 BTAF1-204ENST00000544642 6938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 SYTL2-217ENST00000528231 3536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 RNU1-108P-201ENST00000362556 161 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 Y_RNA.33-201ENST00000362591 102 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 RNU5A-1-201ENST00000362698 116 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 RNU6-395P-201ENST00000365662 106 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 RNY1P5-201ENST00000383890 115 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 MIR301A-201ENST00000385261 86 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 SNORA11F-201ENST00000408237 128 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 RNU6-1025P-201ENST00000410629 104 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 RNU6-651P-201ENST00000411040 105 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 LINC00894-201ENST00000413076 403 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 NCKAP5-IT1-201ENST00000416437 554 ntTSL 4 BASIC3.45□□□□□ -1.86
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FOXE3Q13461 AC004552.1-201ENST00000419089 348 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
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FOXE3Q13461 AC021713.1-201ENST00000526554 510 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
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FOXE3Q13461 AC012531.5-201ENST00000611375 151 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 AL590240.4-201ENST00000616908 390 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
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FOXE3Q13461 AC090617.7-201ENST00000623952 126 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
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FOXE3Q13461 CYP3A4-201ENST00000336411 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
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FOXE3Q13461 ADGRL2-208ENST00000370725 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 DLG1-217ENST00000452595 3053 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 FKTN-201ENST00000223528 7364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
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FOXE3Q13461 AC138969.1-213ENST00000331436 462 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 RNU6-290P-201ENST00000365212 101 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 LIMS1-AS1-201ENST00000411710 477 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 AC093382.1-201ENST00000413311 379 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 LINC01048-201ENST00000414480 511 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 AL158156.1-201ENST00000422509 473 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 MTATP6P4-201ENST00000427725 675 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 HMGN2P7-201ENST00000456186 273 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 RPL21P104-201ENST00000464143 478 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 AC078817.1-201ENST00000492623 435 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 RPL7P47-201ENST00000497299 556 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 AC108145.1-201ENST00000503770 153 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 SEPT14P8-201ENST00000508026 178 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 RNA5SP154-201ENST00000516193 111 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 SNORA70.14-201ENST00000516205 110 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 MTND5P41-201ENST00000517498 206 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 CASP1P1-201ENST00000526345 212 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 KIRREL3-AS2-201ENST00000532988 492 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
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