Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 OARD1-209ENST00000471367 401 ntTSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
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GTF3C1Q12789 AC106892.1-201ENST00000491608 406 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
GTF3C1Q12789 AC105252.1-201ENST00000503089 286 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
GTF3C1Q12789 AC108078.1-201ENST00000508073 725 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
GTF3C1Q12789 AC010493.1-201ENST00000513479 292 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
GTF3C1Q12789 AC136619.2-201ENST00000563361 631 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
GTF3C1Q12789 AC103710.2-201ENST00000609912 942 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
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GTF3C1Q12789 AC103710.2-202ENST00000641454 2853 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
GTF3C1Q12789 PCDH11Y-203ENST00000362095 4220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
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GTF3C1Q12789 Y_RNA.559-201ENST00000384686 107 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
GTF3C1Q12789 MIR454-201ENST00000390180 115 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
GTF3C1Q12789 ZNF705D-201ENST00000400078 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.07
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GTF3C1Q12789 AC104462.1-201ENST00000414565 447 ntTSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.07
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GTF3C1Q12789 HMGN2P16-201ENST00000456802 261 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
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GTF3C1Q12789 RPL36AP53-201ENST00000432891 316 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
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GTF3C1Q12789 LINC02101-201ENST00000505861 725 ntTSL 4 BASIC2.08□□□□□ -2.08
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GTF3C1Q12789 LINC02055-204ENST00000521034 432 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
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GTF3C1Q12789 TRAV28-201ENST00000557548 323 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
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GTF3C1Q12789 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
GTF3C1Q12789 MTND5P6-201ENST00000422338 1798 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
GTF3C1Q12789 AC007256.1-201ENST00000392253 2765 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
GTF3C1Q12789 DDIAS-201ENST00000329143 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
GTF3C1Q12789 AL021368.2-201ENST00000606125 5352 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
GTF3C1Q12789 RNA5SP252-201ENST00000391131 119 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
GTF3C1Q12789 RNU6-332P-201ENST00000391193 108 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
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