Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 AL445488.1-202ENST00000430623 545 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 AC087499.2-201ENST00000432861 149 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 AL135923.2-201ENST00000435444 501 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 AF274573.2-201ENST00000437772 520 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 AC009296.1-201ENST00000443146 155 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 AC025428.1-201ENST00000444137 403 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 AC104688.1-201ENST00000447158 419 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 HMGN2P10-201ENST00000448085 265 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 LINC01069-201ENST00000452933 546 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 AC006512.1-201ENST00000468816 291 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 RPL23AP70-201ENST00000483361 460 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 AC079382.1-201ENST00000493346 557 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 LINC02101-201ENST00000505861 725 ntTSL 4 BASIC2.45□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 AC092436.1-201ENST00000506450 503 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 RANP3-201ENST00000530970 276 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 AC022880.1-201ENST00000534017 973 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 NTS-203ENST00000551529 801 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 NACAP3-201ENST00000552100 481 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 AC025281.1-201ENST00000567026 265 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 AC103810.1-201ENST00000579873 453 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 AC016229.1-201ENST00000589242 487 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 AL035413.2-201ENST00000604801 525 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 AC006386.2-201ENST00000624491 75 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 AC012005.1-201ENST00000624575 75 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 U6.114-201ENST00000636407 96 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 U6.99-201ENST00000637524 83 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 AC068137.4-201ENST00000638485 296 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 ATM-228ENST00000639240 498 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 ATM-230ENST00000640388 578 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 FGF7-201ENST00000267843 5467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 TEX9-207ENST00000560582 2005 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 TRIQK-204ENST00000517858 1882 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 OGN-201ENST00000262551 2971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 GABRG2-209ENST00000638660 3799 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 SNORD3E-201ENST00000362899 217 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 RNU6-395P-201ENST00000365662 106 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 Y_RNA.381-201ENST00000365666 102 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 MDM4-202ENST00000367180 547 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 RNU6-116P-201ENST00000384042 109 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 MIR767-201ENST00000390228 109 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 RNA5SP111-201ENST00000411386 101 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 AL109947.1-201ENST00000423747 382 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 AC241644.2-201ENST00000426504 480 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 AL589986.2-201ENST00000429352 397 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 AL024508.1-201ENST00000432477 505 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 AC000111.3-201ENST00000433478 193 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 AC093083.1-201ENST00000438633 347 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 LINC01683-201ENST00000443479 412 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 AL360271.2-201ENST00000447710 161 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 AC104058.1-201ENST00000448028 297 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 AL118520.1-201ENST00000450770 291 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 UMAD1-204ENST00000482067 569 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 LINC01487-202ENST00000490497 423 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 RPL9P6-201ENST00000492764 598 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 EIF4EP3-201ENST00000498782 656 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 AC012055.2-201ENST00000504167 335 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 LAMTOR3P2-201ENST00000504479 232 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 MGC32805-203ENST00000506053 652 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 AC112206.3-201ENST00000514578 389 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 Y_RNA.655-201ENST00000515919 96 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 SUB1P1-201ENST00000524415 382 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 AP005435.4-201ENST00000529514 284 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 AP000462.2-203ENST00000540545 715 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 AC090607.4-201ENST00000558192 369 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 AC012100.2-201ENST00000558317 304 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 AC021739.1-201ENST00000559631 174 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 LARP7P3-201ENST00000579888 337 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 AC008752.3-201ENST00000588113 712 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 HULC.1-201ENST00000612720 240 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 AC005609.4-201ENST00000625071 447 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 ZNF117-204ENST00000620222 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 COPS2-203ENST00000542928 1580 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 SEL1L2-201ENST00000284951 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 MYOT-201ENST00000239926 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 OR4G2P-201ENST00000328113 903 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 RNU1-112P-201ENST00000364401 164 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 SET-203ENST00000372688 801 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 RNU6-1158P-201ENST00000391167 107 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 RNU6-193P-201ENST00000410977 107 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 AC004870.3-202ENST00000412996 432 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 UBE2V1P10-201ENST00000414685 269 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 AC007560.1-201ENST00000426912 237 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 AL596276.1-201ENST00000434465 418 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 AC107083.1-201ENST00000439643 279 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 CACYBPP2-201ENST00000453625 678 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 AL441989.1-201ENST00000454204 382 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 AL356010.1-201ENST00000456364 102 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 AP000852.1-201ENST00000472460 573 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 AC079943.1-201ENST00000491909 466 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 AC026801.1-201ENST00000497178 464 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 AC107401.1-201ENST00000503426 685 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 FAM92A1P2-202ENST00000504766 877 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 MTCO3P9-201ENST00000506989 781 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 AC114316.1-201ENST00000511323 278 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 RNA5SP282-201ENST00000516355 108 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 RNA5SP503-201ENST00000517047 117 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 MIR4703-201ENST00000577728 79 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 AP005120.1-201ENST00000579321 352 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 MIR548AC-201ENST00000585049 88 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
RBBP4Q09028 AC004223.2-201ENST00000590309 544 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.8 ms