Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 U4.3-201ENST00000621047 82 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
COPS7AQ9UBW8 AC244517.12-201ENST00000623581 663 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
COPS7AQ9UBW8 AL157786.1-207ENST00000627771 695 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
COPS7AQ9UBW8 TXLNGY-201ENST00000253320 7299 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
COPS7AQ9UBW8 TANK-201ENST00000259075 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
COPS7AQ9UBW8 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
COPS7AQ9UBW8 AC080100.1-201ENST00000624239 5356 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
COPS7AQ9UBW8 EDDM3A-201ENST00000326842 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
COPS7AQ9UBW8 RNU6-486P-201ENST00000363116 107 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
COPS7AQ9UBW8 SNORD116-8-201ENST00000384365 95 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
COPS7AQ9UBW8 MIR218-1-201ENST00000384999 110 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
COPS7AQ9UBW8 MIR27B-201ENST00000385129 97 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
COPS7AQ9UBW8 CIR1P3-201ENST00000405137 479 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
COPS7AQ9UBW8 Y_RNA.623-201ENST00000411128 95 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
COPS7AQ9UBW8 RNU6-195P-201ENST00000411352 109 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
COPS7AQ9UBW8 AL365338.1-201ENST00000422282 858 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
COPS7AQ9UBW8 AL157884.2-201ENST00000424177 551 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
COPS7AQ9UBW8 ISCA1P6-201ENST00000427740 390 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
COPS7AQ9UBW8 AL139397.1-201ENST00000430456 644 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
COPS7AQ9UBW8 RPS15AP9-201ENST00000439856 381 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
COPS7AQ9UBW8 AL441989.1-201ENST00000454204 382 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
COPS7AQ9UBW8 MTCYBP1-201ENST00000454315 1119 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
COPS7AQ9UBW8 LINC00894-208ENST00000455777 284 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
COPS7AQ9UBW8 RNU7-26P-201ENST00000458980 63 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
COPS7AQ9UBW8 AC020703.1-201ENST00000505051 521 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
COPS7AQ9UBW8 AC116562.3-201ENST00000506136 177 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
COPS7AQ9UBW8 RN7SKP24-201ENST00000515888 284 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
COPS7AQ9UBW8 RNA5SP112-201ENST00000515937 99 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
COPS7AQ9UBW8 RNU6-685P-201ENST00000517088 95 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
COPS7AQ9UBW8 AC090796.1-201ENST00000520370 567 ntTSL 4 BASIC2.36□□□□□ -2.03
COPS7AQ9UBW8 AC021242.2-203ENST00000521842 687 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
COPS7AQ9UBW8 AC025871.1-201ENST00000523935 443 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
COPS7AQ9UBW8 AC068587.5-201ENST00000528506 175 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
COPS7AQ9UBW8 AL136146.2-201ENST00000534594 494 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
COPS7AQ9UBW8 AC007834.2-201ENST00000536310 343 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
COPS7AQ9UBW8 EMP1-206ENST00000537612 505 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
COPS7AQ9UBW8 AC107023.1-201ENST00000552757 356 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
COPS7AQ9UBW8 MIR5571-201ENST00000577998 113 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
COPS7AQ9UBW8 MIR4658-201ENST00000584344 65 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
COPS7AQ9UBW8 AC121247.2-201ENST00000604776 136 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
COPS7AQ9UBW8 AC005696.2-201ENST00000610120 626 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
COPS7AQ9UBW8 AL449363.1-201ENST00000617815 186 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
COPS7AQ9UBW8 MIR6852-201ENST00000621699 66 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
COPS7AQ9UBW8 AC025034.2-201ENST00000623264 286 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
COPS7AQ9UBW8 AC093648.1-201ENST00000623546 606 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
COPS7AQ9UBW8 MIR6733-201ENST00000635723 61 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
COPS7AQ9UBW8 RGPD6-201ENST00000329516 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
COPS7AQ9UBW8 SAMD9L-201ENST00000318238 7134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
COPS7AQ9UBW8 AC093536.2-201ENST00000565257 1406 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
COPS7AQ9UBW8 SNORD3E-201ENST00000362899 217 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
COPS7AQ9UBW8 RNA5SP68-201ENST00000363885 119 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
COPS7AQ9UBW8 TRAV41-201ENST00000390468 336 ntAPPRIS P1 BASIC2.35□□□□□ -2.03
COPS7AQ9UBW8 UBE2V1P2-201ENST00000397758 440 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
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COPS7AQ9UBW8 AC002456.1-203ENST00000412669 449 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
COPS7AQ9UBW8 AL157709.1-201ENST00000412695 424 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
COPS7AQ9UBW8 LINC01412-201ENST00000413525 362 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
COPS7AQ9UBW8 BX276092.3-201ENST00000424182 230 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
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COPS7AQ9UBW8 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
COPS7AQ9UBW8 AL627311.1-201ENST00000431514 115 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
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COPS7AQ9UBW8 AC018437.1-201ENST00000492214 406 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
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COPS7AQ9UBW8 AL138889.2-201ENST00000603883 242 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
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COPS7AQ9UBW8 RNU6-91P-201ENST00000607774 107 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
COPS7AQ9UBW8 AC069294.1-201ENST00000608397 350 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
COPS7AQ9UBW8 USP12-203ENST00000620323 349 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
COPS7AQ9UBW8 AC023490.3-201ENST00000621762 358 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
COPS7AQ9UBW8 AC010297.1-201ENST00000623948 149 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
COPS7AQ9UBW8 AC110994.2-201ENST00000635481 492 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
COPS7AQ9UBW8 AP000550.4-201ENST00000639507 358 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
COPS7AQ9UBW8 SERPINI2-202ENST00000461846 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
COPS7AQ9UBW8 QSER1-204ENST00000527788 5052 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
COPS7AQ9UBW8 CKAP2P1-201ENST00000555477 2049 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
COPS7AQ9UBW8 OR5K1-202ENST00000642057 3466 ntAPPRIS P1 BASIC2.35□□□□□ -2.03
COPS7AQ9UBW8 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
COPS7AQ9UBW8 FGF7-201ENST00000267843 5467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
COPS7AQ9UBW8 TMPRSS11A-201ENST00000334830 3054 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
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