Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 AL591034.2-201ENST00000402839 359 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SYCP1Q15431 USP9YP6-201ENST00000413550 854 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SYCP1Q15431 LINC01676-201ENST00000420901 410 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
SYCP1Q15431 BX510359.4-201ENST00000423750 193 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SYCP1Q15431 USP9YP24-201ENST00000434374 697 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SYCP1Q15431 AC006458.1-201ENST00000445093 653 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
SYCP1Q15431 AC009299.3-202ENST00000445372 538 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
SYCP1Q15431 OR6C5P-201ENST00000452388 923 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SYCP1Q15431 FABP5P15-201ENST00000453566 214 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SYCP1Q15431 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SYCP1Q15431 RPL37P6-201ENST00000460682 294 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SYCP1Q15431 CNOT10-AS1-201ENST00000475395 466 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
SYCP1Q15431 AC114912.1-201ENST00000503394 546 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
SYCP1Q15431 AC093809.1-201ENST00000509155 340 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SYCP1Q15431 AP003355.1-201ENST00000518956 587 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SYCP1Q15431 AP003049.1-201ENST00000529418 457 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SYCP1Q15431 AC023538.1-201ENST00000534576 736 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SYCP1Q15431 AC012170.3-201ENST00000560159 297 ntTSL 2 BASIC1.71□□□□□ -2.14
SYCP1Q15431 MIR3198-2-201ENST00000577868 80 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SYCP1Q15431 MIR4255-201ENST00000579351 72 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SYCP1Q15431 AC108479.2-201ENST00000617314 601 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SYCP1Q15431 OR8H2-202ENST00000618136 1038 ntAPPRIS ALT1 BASIC1.71□□□□□ -2.14
SYCP1Q15431 SEMG2-201ENST00000372769 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
SYCP1Q15431 NACAP2-201ENST00000318548 624 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SYCP1Q15431 snoZ40.1-201ENST00000364540 72 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SYCP1Q15431 RNU6-744P-201ENST00000365557 107 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SYCP1Q15431 TXNDC8-203ENST00000374511 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
SYCP1Q15431 RNU6-1316P-201ENST00000384242 108 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SYCP1Q15431 TRAV40-201ENST00000390467 317 ntAPPRIS P1 BASIC1.7□□□□□ -2.14
SYCP1Q15431 AL033519.2-201ENST00000403958 392 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SYCP1Q15431 AL021407.1-201ENST00000404531 386 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SYCP1Q15431 MIR1302-8-201ENST00000408342 128 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SYCP1Q15431 RNU6-955P-201ENST00000410497 104 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SYCP1Q15431 RPL21P24-201ENST00000413752 448 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SYCP1Q15431 TEX41-202ENST00000414256 604 ntTSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
SYCP1Q15431 AL161909.2-201ENST00000417577 409 ntTSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
SYCP1Q15431 TIMM9P2-201ENST00000419324 266 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SYCP1Q15431 AC007098.1-201ENST00000420122 367 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SYCP1Q15431 AC073311.1-201ENST00000420146 505 ntTSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
SYCP1Q15431 EIF4EP2-201ENST00000422816 654 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SYCP1Q15431 FAR2P3-204ENST00000434661 444 ntTSL 2 BASIC1.7□□□□□ -2.14
SYCP1Q15431 AL353706.1-201ENST00000436728 494 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SYCP1Q15431 EHHADH-202ENST00000440662 656 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
SYCP1Q15431 AC092001.1-201ENST00000453012 261 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SYCP1Q15431 AL163540.1-201ENST00000485382 386 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SYCP1Q15431 MTCYBP35-201ENST00000503630 1137 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SYCP1Q15431 AC093012.1-203ENST00000548437 450 ntTSL 2 BASIC1.7□□□□□ -2.14
SYCP1Q15431 AC093012.1-202ENST00000549403 582 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SYCP1Q15431 AL157938.2-201ENST00000587264 894 ntTSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
SYCP1Q15431 AC022150.3-201ENST00000599143 880 ntTSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
SYCP1Q15431 AC021171.1-201ENST00000603137 706 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SYCP1Q15431 AL713866.2-201ENST00000603579 219 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SYCP1Q15431 BX248123.2-201ENST00000606318 124 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SYCP1Q15431 AC068506.1-202ENST00000613388 545 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
SYCP1Q15431 LINC02246-204ENST00000625278 740 ntTSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
SYCP1Q15431 ZNF260-203ENST00000588993 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
SYCP1Q15431 CDC27P3-201ENST00000635418 1910 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SYCP1Q15431 RNU6-512P-201ENST00000364438 103 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SYCP1Q15431 Y_RNA.578-201ENST00000390903 88 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SYCP1Q15431 MAST4-AS1-201ENST00000451496 777 ntTSL 2 BASIC1.69□□□□□ -2.14
SYCP1Q15431 KATNBL1P6-201ENST00000453433 915 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SYCP1Q15431 AL024497.2-201ENST00000457081 317 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
SYCP1Q15431 AL354824.2-201ENST00000458004 446 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
SYCP1Q15431 AC139453.3-201ENST00000493276 369 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SYCP1Q15431 AC104137.1-201ENST00000503625 385 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
SYCP1Q15431 AKIRIN2P1-201ENST00000505898 352 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SYCP1Q15431 AC010261.1-201ENST00000514411 457 ntTSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
SYCP1Q15431 RN7SKP258-201ENST00000517151 304 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SYCP1Q15431 AC106038.1-203ENST00000522132 362 ntTSL 2 BASIC1.69□□□□□ -2.14
SYCP1Q15431 DEFB131D-201ENST00000526803 184 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SYCP1Q15431 ARL2BPP2-201ENST00000550907 489 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SYCP1Q15431 AL132657.2-201ENST00000564417 358 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SYCP1Q15431 AL356432.3-201ENST00000568952 465 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SYCP1Q15431 AC126365.2-201ENST00000580630 379 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SYCP1Q15431 SNRPGP17-201ENST00000603780 214 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SYCP1Q15431 AL357054.2-201ENST00000607644 423 ntTSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
SYCP1Q15431 RGS13-201ENST00000391995 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
SYCP1Q15431 Y_RNA.508-201ENST00000384502 114 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SYCP1Q15431 MIR1283-2-201ENST00000408621 87 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SYCP1Q15431 AL590705.2-201ENST00000420204 281 ntTSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
SYCP1Q15431 RAB3GAP1-202ENST00000425393 1139 ntTSL 2 BASIC1.68□□□□□ -2.14
SYCP1Q15431 ISCA1P1-201ENST00000426679 387 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SYCP1Q15431 LINC01680-201ENST00000434983 299 ntTSL 2 BASIC1.68□□□□□ -2.14
SYCP1Q15431 LINC01758-201ENST00000448001 458 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
SYCP1Q15431 AL390961.3-201ENST00000458171 485 ntTSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
SYCP1Q15431 AC112771.1-201ENST00000463581 102 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SYCP1Q15431 AC011005.2-201ENST00000487324 359 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SYCP1Q15431 FAM206BP-201ENST00000510179 541 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SYCP1Q15431 AC024589.1-201ENST00000512207 263 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SYCP1Q15431 MTCO3P27-201ENST00000514397 196 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SYCP1Q15431 Y_RNA.675-201ENST00000516389 149 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SYCP1Q15431 ELOC-204ENST00000519487 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.68□□□□□ -2.14
SYCP1Q15431 AC021451.1-201ENST00000523498 1129 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SYCP1Q15431 HMSD-204ENST00000526932 162 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
SYCP1Q15431 AC007450.1-201ENST00000536492 188 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
SYCP1Q15431 AC087894.1-201ENST00000538359 518 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SYCP1Q15431 AC079598.5-201ENST00000547460 117 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SYCP1Q15431 AL512347.1-201ENST00000566420 503 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SYCP1Q15431 AC060771.1-201ENST00000582031 164 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SYCP1Q15431 LINC01899-203ENST00000584810 337 ntTSL 2 BASIC1.68□□□□□ -2.14
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