Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

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Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 ATG5-207ENST00000613993 733 ntTSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.12
PTPRKQ15262 AC021755.4-201ENST00000616620 456 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
PTPRKQ15262 AL445264.1-201ENST00000621719 171 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
PTPRKQ15262 AL031601.2-202ENST00000622650 282 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
PTPRKQ15262 AL138955.1-201ENST00000622881 1040 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
PTPRKQ15262 AC231657.1-201ENST00000624313 397 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
PTPRKQ15262 PTP4A2-219ENST00000626355 606 ntTSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
PTPRKQ15262 AL359851.1-201ENST00000569460 4997 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
PTPRKQ15262 HTN1-201ENST00000246896 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
PTPRKQ15262 RNU6-952P-201ENST00000391164 108 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PTPRKQ15262 MTCO1P56-201ENST00000401674 224 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PTPRKQ15262 AL161449.1-201ENST00000414531 1199 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PTPRKQ15262 AC019070.1-201ENST00000415008 1024 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PTPRKQ15262 LINC02559-201ENST00000420391 188 ntTSL 2 BASIC1.77□□□□□ -2.13
PTPRKQ15262 AL451054.2-201ENST00000420896 202 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PTPRKQ15262 EIF4EP4-201ENST00000424916 578 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PTPRKQ15262 AC098831.1-201ENST00000440661 216 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PTPRKQ15262 IPO7P1-201ENST00000442031 636 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PTPRKQ15262 RNA5SP476-201ENST00000516613 103 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PTPRKQ15262 AC087664.2-201ENST00000522898 551 ntTSL 4 BASIC1.77□□□□□ -2.13
PTPRKQ15262 AC087897.1-201ENST00000550134 156 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PTPRKQ15262 AC005951.2-201ENST00000576282 495 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PTPRKQ15262 BBIP1P1-201ENST00000602999 279 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PTPRKQ15262 AL139344.1-201ENST00000605228 195 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PTPRKQ15262 AL021997.1-201ENST00000605757 193 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PTPRKQ15262 AL158211.2-201ENST00000607282 395 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PTPRKQ15262 AC110491.1-201ENST00000562191 2010 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PTPRKQ15262 MTND5P30-201ENST00000452896 1731 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PTPRKQ15262 Y_RNA.458-201ENST00000384240 102 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PTPRKQ15262 SNORD23.1-201ENST00000408212 104 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PTPRKQ15262 AL080284.1-201ENST00000434493 442 ntTSL 2 BASIC1.76□□□□□ -2.13
PTPRKQ15262 AC006042.4-201ENST00000451066 692 ntTSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
PTPRKQ15262 AL356270.1-201ENST00000456587 522 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
PTPRKQ15262 RPS27P21-201ENST00000486977 252 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PTPRKQ15262 AC093852.1-201ENST00000503587 266 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PTPRKQ15262 AC090857.2-201ENST00000526362 723 ntTSL 2 BASIC1.76□□□□□ -2.13
PTPRKQ15262 IMMP1LP2-201ENST00000552954 492 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PTPRKQ15262 AL359212.1-201ENST00000556608 614 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PTPRKQ15262 AC026474.1-201ENST00000562422 428 ntTSL 2 BASIC1.76□□□□□ -2.13
PTPRKQ15262 AC079411.1-201ENST00000565441 795 ntTSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
PTPRKQ15262 MIR1273G-201ENST00000577677 100 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PTPRKQ15262 AL353997.4-201ENST00000586196 166 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PTPRKQ15262 AC099785.1-201ENST00000605697 437 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PTPRKQ15262 SDR42E1P2-201ENST00000614861 481 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PTPRKQ15262 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PTPRKQ15262 GPR22-201ENST00000304402 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
PTPRKQ15262 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
PTPRKQ15262 RNU6-1207P-201ENST00000384343 107 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PTPRKQ15262 AL590084.2-201ENST00000401481 382 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PTPRKQ15262 SPATA17-AS1-201ENST00000415765 420 ntTSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
PTPRKQ15262 CYCSP48-201ENST00000417124 323 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PTPRKQ15262 SNRPEP9-201ENST00000436794 238 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PTPRKQ15262 RPL18AP17-201ENST00000455326 198 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PTPRKQ15262 RNU7-136P-201ENST00000458819 69 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PTPRKQ15262 RNA5SP290-201ENST00000517133 127 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PTPRKQ15262 AL138976.2-201ENST00000563989 694 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PTPRKQ15262 AC087463.2-201ENST00000565943 472 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
PTPRKQ15262 AL357094.1-201ENST00000603845 844 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PTPRKQ15262 PCF11-AS1-201ENST00000602322 1516 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PTPRKQ15262 TFEC-204ENST00000457268 6309 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
PTPRKQ15262 SNORA3A-201ENST00000364113 130 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PTPRKQ15262 RNU6-343P-201ENST00000364709 104 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PTPRKQ15262 RNU1-39P-201ENST00000383897 165 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PTPRKQ15262 MIR218-1-201ENST00000384999 110 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PTPRKQ15262 AL355497.1-201ENST00000406262 551 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PTPRKQ15262 AL162726.4-201ENST00000422010 673 ntTSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
PTPRKQ15262 AC013262.1-201ENST00000426710 252 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PTPRKQ15262 AL157387.1-201ENST00000436077 335 ntTSL 2 BASIC1.74□□□□□ -2.13
PTPRKQ15262 AL121769.1-201ENST00000469473 401 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PTPRKQ15262 AC021382.1-201ENST00000483523 359 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PTPRKQ15262 AL365273.2-201ENST00000491114 492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
PTPRKQ15262 LINC02118-202ENST00000510583 419 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
PTPRKQ15262 MIR514B-201ENST00000516774 80 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PTPRKQ15262 CYCSP26-201ENST00000534107 320 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PTPRKQ15262 OR6C7P-201ENST00000547875 934 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PTPRKQ15262 AC104072.1-201ENST00000568817 668 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PTPRKQ15262 AL391813.1-201ENST00000603098 260 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
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PTPRKQ15262 AP003485.1-201ENST00000625093 753 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PTPRKQ15262 PARPBP-203ENST00000392911 1916 ntTSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
PTPRKQ15262 SNORA63.3-201ENST00000362682 132 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PTPRKQ15262 Y_RNA.245-201ENST00000364493 95 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PTPRKQ15262 RNU6-432P-201ENST00000384196 109 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PTPRKQ15262 AL356421.1-201ENST00000403255 413 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PTPRKQ15262 U6atac.2-201ENST00000408644 118 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PTPRKQ15262 RN7SKP158-201ENST00000410453 326 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PTPRKQ15262 HMGN1P14-201ENST00000412459 517 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PTPRKQ15262 AL356277.2-201ENST00000421318 441 ntTSL 2 BASIC1.74□□□□□ -2.13
PTPRKQ15262 PGBD4P6-201ENST00000421501 610 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PTPRKQ15262 AC113331.1-201ENST00000428160 869 ntTSL 2 BASIC1.74□□□□□ -2.13
PTPRKQ15262 NCOA7-AS1-201ENST00000429007 501 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
PTPRKQ15262 LINC02095-201ENST00000430908 346 ntTSL 2 BASIC1.74□□□□□ -2.13
PTPRKQ15262 AC104653.2-201ENST00000435407 416 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
PTPRKQ15262 OR5H14-201ENST00000437310 1080 ntAPPRIS P1 BASIC1.74□□□□□ -2.13
PTPRKQ15262 AC016691.1-201ENST00000441321 413 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
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