| RUNX2 | Q13950 | TTN-AS1-243 | ENST00000591867 | 748 nt | TSL 5 BASIC | 3.06 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | BNIP3P25-201 | ENST00000596023 | 559 nt | BASIC | 3.06 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC008739.1-201 | ENST00000598137 | 575 nt | TSL 2 BASIC | 3.06 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL161756.2-201 | ENST00000604597 | 246 nt | BASIC | 3.06 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | ESRRAP2-204 | ENST00000606337 | 280 nt | TSL 5 BASIC | 3.06 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC096577.2-201 | ENST00000611455 | 153 nt | BASIC | 3.06 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC004852.3-201 | ENST00000614131 | 326 nt | BASIC | 3.06 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL157817.1-201 | ENST00000614264 | 790 nt | BASIC | 3.06 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL161629.2-201 | ENST00000615347 | 275 nt | BASIC | 3.06 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MIR7112-201 | ENST00000616126 | 65 nt | BASIC | 3.06 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | HOTTIP_4.1-201 | ENST00000618195 | 165 nt | BASIC | 3.06 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC073346.2-201 | ENST00000624724 | 2058 nt | BASIC | 3.06 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | KNTC1-205 | ENST00000450485 | 3655 nt | TSL 2 BASIC | 3.06 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | DPP10-205 | ENST00000410059 | 6278 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 3.06 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | CHD9-213 | ENST00000564845 | 11504 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.06 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | ZBTB26-202 | ENST00000373656 | 4443 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.05 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SLC8A1-207 | ENST00000406785 | 20987 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.05 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | DEFB107A-201 | ENST00000335021 | 389 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.05 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | DEFB107B-201 | ENST00000355602 | 389 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.05 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | Y_RNA.157-201 | ENST00000363638 | 102 nt | BASIC | 3.05 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-82P-201 | ENST00000363970 | 107 nt | BASIC | 3.05 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-434P-201 | ENST00000384376 | 107 nt | BASIC | 3.05 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MT-TL1-201 | ENST00000386347 | 75 nt | BASIC | 3.05 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | CD3D-202 | ENST00000392884 | 476 nt | TSL 2 BASIC | 3.05 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RPS4XP7-201 | ENST00000406274 | 780 nt | BASIC | 3.05 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | CTNNA2-204 | ENST00000409266 | 432 nt | TSL 3 BASIC | 3.05 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-373P-201 | ENST00000411247 | 98 nt | BASIC | 3.05 | □□□□□ -1.92 | | |
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| RUNX2 | Q13950 | HMGN2P30-201 | ENST00000423237 | 256 nt | BASIC | 3.05 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | LINC01774-201 | ENST00000453569 | 595 nt | TSL 2 BASIC | 3.05 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL583843.1-201 | ENST00000456070 | 346 nt | BASIC | 3.05 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU7-167P-201 | ENST00000459160 | 62 nt | BASIC | 3.05 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU7-66P-201 | ENST00000459469 | 62 nt | BASIC | 3.05 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC087884.1-201 | ENST00000469738 | 328 nt | BASIC | 3.05 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RN7SL601P-201 | ENST00000471221 | 293 nt | BASIC | 3.05 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | OARD1-209 | ENST00000471367 | 401 nt | TSL 2 BASIC | 3.05 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RPS27AP10-201 | ENST00000496103 | 208 nt | BASIC | 3.05 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | Y_RNA.654-201 | ENST00000497848 | 106 nt | BASIC | 3.05 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU1-103P-201 | ENST00000516502 | 125 nt | BASIC | 3.05 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-572P-201 | ENST00000516724 | 80 nt | BASIC | 3.05 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC136777.1-201 | ENST00000517765 | 369 nt | TSL 4 BASIC | 3.05 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RPL7P20-201 | ENST00000520308 | 745 nt | BASIC | 3.05 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | LYRM2-203 | ENST00000520318 | 677 nt | TSL 2 BASIC | 3.05 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC118273.2-201 | ENST00000532092 | 465 nt | BASIC | 3.05 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | CYCSP39-201 | ENST00000565821 | 309 nt | BASIC | 3.05 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RMST_4.1-201 | ENST00000616886 | 107 nt | BASIC | 3.05 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MIER3-203 | ENST00000381213 | 5198 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 3.05 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | DST-204 | ENST00000361203 | 22431 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 3.04 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SLC9C1-205 | ENST00000487372 | 3979 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 3.04 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | CATSPERB-201 | ENST00000256343 | 3623 nt | APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC | 3.04 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC093536.2-201 | ENST00000565257 | 1406 nt | BASIC | 3.04 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | NEBL-202 | ENST00000377122 | 9216 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.04 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | TFEC-203 | ENST00000393485 | 2704 nt | TSL 2 BASIC | 3.04 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | CEP85L-202 | ENST00000368488 | 7118 nt | TSL 5 BASIC | 3.04 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU1-75P-201 | ENST00000347264 | 129 nt | BASIC | 3.04 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | Y_RNA.86-201 | ENST00000363020 | 111 nt | BASIC | 3.04 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SNORD14B-201 | ENST00000364533 | 90 nt | BASIC | 3.04 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-1179P-201 | ENST00000384667 | 107 nt | BASIC | 3.04 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MIR491-201 | ENST00000384877 | 84 nt | BASIC | 3.04 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | POLHP1-201 | ENST00000411806 | 470 nt | BASIC | 3.04 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC138393.2-201 | ENST00000414742 | 246 nt | BASIC | 3.04 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | ACTR3BP6-201 | ENST00000422332 | 1241 nt | BASIC | 3.04 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | GYPB-201 | ENST00000429670 | 239 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.04 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL024508.1-201 | ENST00000432477 | 505 nt | TSL 2 BASIC | 3.04 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC098831.1-201 | ENST00000440661 | 216 nt | BASIC | 3.04 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | PRPS1P1-201 | ENST00000445305 | 876 nt | BASIC | 3.04 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | NRG3-AS1-201 | ENST00000448936 | 555 nt | TSL 2 BASIC | 3.04 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | NDUFB1P2-201 | ENST00000449477 | 176 nt | BASIC | 3.04 | □□□□□ -1.92 | | |
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| RUNX2 | Q13950 | AL590639.1-201 | ENST00000456484 | 337 nt | BASIC | 3.04 | □□□□□ -1.92 | | |
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| RUNX2 | Q13950 | AC104472.2-201 | ENST00000469035 | 601 nt | BASIC | 3.04 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AP000852.1-201 | ENST00000472460 | 573 nt | BASIC | 3.04 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RPS4XP22-201 | ENST00000480755 | 780 nt | BASIC | 3.04 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC011005.2-201 | ENST00000487324 | 359 nt | BASIC | 3.04 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC092185.1-201 | ENST00000491371 | 97 nt | BASIC | 3.04 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC008948.1-201 | ENST00000506058 | 325 nt | TSL 2 BASIC | 3.04 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC018710.1-201 | ENST00000506509 | 158 nt | BASIC | 3.04 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC107208.1-201 | ENST00000508265 | 519 nt | TSL 4 BASIC | 3.04 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SNORA20.3-201 | ENST00000516880 | 132 nt | BASIC | 3.04 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AF279873.4-202 | ENST00000521714 | 511 nt | TSL 2 BASIC | 3.04 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC106038.1-203 | ENST00000522132 | 362 nt | TSL 2 BASIC | 3.04 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | NACAP3-201 | ENST00000552100 | 481 nt | BASIC | 3.04 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MIR5692A1-201 | ENST00000580523 | 69 nt | BASIC | 3.04 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC012254.1-201 | ENST00000592747 | 200 nt | TSL 3 BASIC | 3.04 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | VN1R80P-201 | ENST00000597126 | 338 nt | BASIC | 3.04 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL683887.1-201 | ENST00000603401 | 287 nt | TSL 3 BASIC | 3.04 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL160281.1-201 | ENST00000605307 | 311 nt | BASIC | 3.04 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | CTHRC1P1-201 | ENST00000605383 | 469 nt | BASIC | 3.04 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC008162.2-201 | ENST00000613352 | 291 nt | APPRIS P1 TSL 3 BASIC | 3.04 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC103705.1-201 | ENST00000619013 | 241 nt | BASIC | 3.04 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL136221.1-201 | ENST00000621449 | 509 nt | BASIC | 3.04 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | PROX1-AS1-244 | ENST00000630355 | 599 nt | TSL 5 BASIC | 3.04 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | GYPB-216 | ENST00000638448 | 363 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.04 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | IL33-201 | ENST00000381434 | 2641 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.04 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | PRKACB-201 | ENST00000370680 | 1914 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.03 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | LINC01416-201 | ENST00000563553 | 2310 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.03 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC121333.1-201 | ENST00000567488 | 2709 nt | BASIC | 3.03 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | PHF6-205 | ENST00000625464 | 4434 nt | APPRIS ALT1 TSL 5 BASIC | 3.03 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RBBP8-202 | ENST00000360790 | 2962 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.03 | □□□□□ -1.92 | | |