Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 MIR1-2-201ENST00000384961 85 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ALCAMQ13740 MIR627-201ENST00000384979 97 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ALCAMQ13740 MIR454-201ENST00000390180 115 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ALCAMQ13740 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ALCAMQ13740 FO393413.1-201ENST00000402892 195 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ALCAMQ13740 AC083900.1-201ENST00000421964 469 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
ALCAMQ13740 U51244.1-201ENST00000423120 374 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
ALCAMQ13740 AC026355.1-201ENST00000423466 587 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
ALCAMQ13740 MYL8P-204ENST00000431574 518 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ALCAMQ13740 AC018693.1-201ENST00000442829 550 ntTSL 4 BASIC2.81□□□□□ -1.96
ALCAMQ13740 RPL39P40-201ENST00000445481 146 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ALCAMQ13740 AC092001.1-201ENST00000453012 261 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ALCAMQ13740 RNU7-182P-201ENST00000459009 62 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ALCAMQ13740 AC074033.2-201ENST00000480669 535 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
ALCAMQ13740 RPL23AP70-201ENST00000483361 460 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ALCAMQ13740 SRIP1-201ENST00000489235 288 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ALCAMQ13740 AC010493.1-201ENST00000513479 292 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ALCAMQ13740 RNU6-581P-201ENST00000516214 105 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ALCAMQ13740 SNORD27.1-201ENST00000516319 72 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ALCAMQ13740 RNU6-685P-201ENST00000517088 95 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ALCAMQ13740 COX6CP5-201ENST00000527162 228 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ALCAMQ13740 AC018904.1-201ENST00000560594 542 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
ALCAMQ13740 LINC2194-202ENST00000567624 506 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
ALCAMQ13740 AC091152.3-201ENST00000604227 325 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ALCAMQ13740 AL589743.7-201ENST00000612637 233 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ALCAMQ13740 AC009509.4-201ENST00000619202 509 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ALCAMQ13740 AC009161.2-201ENST00000624626 138 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ALCAMQ13740 ZNF680-202ENST00000447137 2159 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
ALCAMQ13740 SMARCAD1-206ENST00000509418 2348 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
ALCAMQ13740 AMY2B-208ENST00000610648 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
ALCAMQ13740 RGS13-204ENST00000543215 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
ALCAMQ13740 SPAG11A-202ENST00000326625 445 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
ALCAMQ13740 Y_RNA.51-201ENST00000362725 102 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ALCAMQ13740 SNORD56.5-201ENST00000364281 72 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ALCAMQ13740 RNU6-1280P-201ENST00000365211 107 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ALCAMQ13740 RNU6-898P-201ENST00000365627 104 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ALCAMQ13740 RNU6-1083P-201ENST00000384022 107 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ALCAMQ13740 RNU6-19P-201ENST00000384718 107 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ALCAMQ13740 MIR27B-201ENST00000385129 97 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ALCAMQ13740 TRAV34-201ENST00000390461 349 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
ALCAMQ13740 PTGES3P4-201ENST00000426243 356 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ALCAMQ13740 RPS15AP7-201ENST00000439294 405 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ALCAMQ13740 RPL21P2-201ENST00000440049 481 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ALCAMQ13740 LAMTOR5P1-201ENST00000444290 270 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ALCAMQ13740 AL109933.2-201ENST00000452651 260 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ALCAMQ13740 OFD1P4Y-201ENST00000455273 1179 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ALCAMQ13740 AL583843.1-201ENST00000456070 346 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ALCAMQ13740 SRI-210ENST00000490437 570 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
ALCAMQ13740 AC022493.1-201ENST00000492984 337 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ALCAMQ13740 AC074131.1-201ENST00000514662 253 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
ALCAMQ13740 AP002963.1-201ENST00000530590 184 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ALCAMQ13740 AC087260.1-201ENST00000546118 401 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
ALCAMQ13740 SUB1P2-201ENST00000556401 297 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ALCAMQ13740 AC044798.1-201ENST00000565146 418 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
ALCAMQ13740 OR1M4P-201ENST00000589199 287 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ALCAMQ13740 GPR171-203ENST00000617554 960 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
ALCAMQ13740 SEPT14P19-203ENST00000633205 211 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ALCAMQ13740 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
ALCAMQ13740 CDC27P3-201ENST00000635418 1910 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ALCAMQ13740 TPTE2-203ENST00000390680 1558 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
ALCAMQ13740 RNU6-1287P-201ENST00000362914 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ALCAMQ13740 RNU6-1060P-201ENST00000384664 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ALCAMQ13740 MIR196B-201ENST00000384852 84 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ALCAMQ13740 MIR147B-201ENST00000390185 80 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ALCAMQ13740 SNORA26.7-201ENST00000391288 122 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ALCAMQ13740 DEFB108C-201ENST00000400154 252 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ALCAMQ13740 AL513475.1-201ENST00000406602 315 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ALCAMQ13740 ATP13A5-AS1-201ENST00000414634 476 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
ALCAMQ13740 OR6C66P-201ENST00000414917 930 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ALCAMQ13740 AC003092.1-201ENST00000415536 639 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
ALCAMQ13740 AC007463.1-201ENST00000416534 734 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
ALCAMQ13740 AL354733.1-203ENST00000417672 495 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
ALCAMQ13740 LINC00368-201ENST00000422994 650 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
ALCAMQ13740 MTCYBP5-201ENST00000423752 1135 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ALCAMQ13740 AC241644.2-201ENST00000426504 480 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
ALCAMQ13740 MAGEA8-AS1-201ENST00000427671 476 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
ALCAMQ13740 AC079799.1-201ENST00000430696 331 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
ALCAMQ13740 AC005019.2-201ENST00000434321 359 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
ALCAMQ13740 AC069540.2-201ENST00000441776 351 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
ALCAMQ13740 AC132479.1-201ENST00000449160 144 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ALCAMQ13740 AL359915.2-203ENST00000457043 540 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
ALCAMQ13740 AC046136.1-201ENST00000459855 533 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
ALCAMQ13740 AC107626.1-201ENST00000471084 183 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ALCAMQ13740 FAM92A1P2-202ENST00000504766 877 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ALCAMQ13740 LINC02101-201ENST00000505861 725 ntTSL 4 BASIC2.79□□□□□ -1.96
ALCAMQ13740 AC005920.2-201ENST00000509833 332 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
ALCAMQ13740 AC117522.2-201ENST00000510049 657 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ALCAMQ13740 AC108727.1-201ENST00000513802 393 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
ALCAMQ13740 AC112206.3-201ENST00000514578 389 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ALCAMQ13740 AC025524.1-201ENST00000518489 606 ntTSL 4 BASIC2.79□□□□□ -1.96
ALCAMQ13740 AC022784.2-201ENST00000521298 328 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
ALCAMQ13740 AC108471.2-204ENST00000526807 784 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
ALCAMQ13740 AC022039.1-201ENST00000527110 488 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
ALCAMQ13740 OR5BN1P-201ENST00000532955 829 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ALCAMQ13740 AL138889.2-201ENST00000603883 242 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ALCAMQ13740 AC245008.1-201ENST00000608123 476 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ALCAMQ13740 AL359962.2-201ENST00000610044 303 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
ALCAMQ13740 AL359740.1-201ENST00000624340 592 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ALCAMQ13740 DNAH14-210ENST00000439375 13548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
ALCAMQ13740 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
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