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| FHL3 | Q13643 | AC004944.1-201 | ENST00000517807 | 3059 nt | BASIC | 3.17 | □□□□□ -1.9 | | |
| FHL3 | Q13643 | RXFP1-201 | ENST00000307765 | 3842 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.17 | □□□□□ -1.9 | | |
| FHL3 | Q13643 | PREPL-206 | ENST00000409936 | 5212 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.16 | □□□□□ -1.9 | | |
| FHL3 | Q13643 | HNRNPC-203 | ENST00000430246 | 4501 nt | APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC | 3.16 | □□□□□ -1.9 | | |
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| FHL3 | Q13643 | MYOT-201 | ENST00000239926 | 2337 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.16 | □□□□□ -1.9 | | |
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| FHL3 | Q13643 | AC091152.2-201 | ENST00000591628 | 2569 nt | BASIC | 3.15 | □□□□□ -1.9 | | |
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| FHL3 | Q13643 | AC100800.1-201 | ENST00000524252 | 2054 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.15 | □□□□□ -1.9 | | |
| FHL3 | Q13643 | MTCO1P12-201 | ENST00000414273 | 1543 nt | BASIC | 3.15 | □□□□□ -1.9 | | |
| FHL3 | Q13643 | FASTKD1-205 | ENST00000453929 | 2791 nt | TSL 2 BASIC | 3.15 | □□□□□ -1.9 | | |
| FHL3 | Q13643 | HERC5-203 | ENST00000508159 | 2243 nt | TSL 2 BASIC | 3.15 | □□□□□ -1.9 | | |
| FHL3 | Q13643 | KCNJ16-201 | ENST00000283936 | 4062 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.15 | □□□□□ -1.91 | | |
| FHL3 | Q13643 | ZC3H11A-214 | ENST00000639812 | 11825 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 3.15 | □□□□□ -1.91 | | |
| FHL3 | Q13643 | COPS2-202 | ENST00000388901 | 6628 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.15 | □□□□□ -1.91 | | |
| FHL3 | Q13643 | RNU1-15P-201 | ENST00000353977 | 144 nt | BASIC | 3.15 | □□□□□ -1.91 | | |
| FHL3 | Q13643 | RNU6-527P-201 | ENST00000363425 | 104 nt | BASIC | 3.15 | □□□□□ -1.91 | | |
| FHL3 | Q13643 | RNA5SP322-201 | ENST00000363617 | 119 nt | BASIC | 3.15 | □□□□□ -1.91 | | |
| FHL3 | Q13643 | RNU6-596P-201 | ENST00000365395 | 98 nt | BASIC | 3.15 | □□□□□ -1.91 | | |
| FHL3 | Q13643 | RNU6-790P-201 | ENST00000384479 | 105 nt | BASIC | 3.15 | □□□□□ -1.91 | | |
| FHL3 | Q13643 | SNORD73A-201 | ENST00000386062 | 65 nt | BASIC | 3.15 | □□□□□ -1.91 | | |
| FHL3 | Q13643 | TRAV9-2-201 | ENST00000390441 | 394 nt | APPRIS P1 BASIC | 3.15 | □□□□□ -1.91 | | |
| FHL3 | Q13643 | AL138878.1-201 | ENST00000405131 | 347 nt | BASIC | 3.15 | □□□□□ -1.91 | | |
| FHL3 | Q13643 | NT5C3A-205 | ENST00000409467 | 1032 nt | APPRIS ALT1 TSL 5 BASIC | 3.15 | □□□□□ -1.91 | | |
| FHL3 | Q13643 | AC096649.2-201 | ENST00000416186 | 393 nt | BASIC | 3.15 | □□□□□ -1.91 | | |
| FHL3 | Q13643 | AC097713.2-201 | ENST00000430199 | 356 nt | BASIC | 3.15 | □□□□□ -1.91 | | |
| FHL3 | Q13643 | SUMO1P3-201 | ENST00000439961 | 304 nt | BASIC | 3.15 | □□□□□ -1.91 | | |
| FHL3 | Q13643 | AC006011.1-201 | ENST00000442758 | 349 nt | BASIC | 3.15 | □□□□□ -1.91 | | |
| FHL3 | Q13643 | AL137792.2-201 | ENST00000443484 | 235 nt | BASIC | 3.15 | □□□□□ -1.91 | | |
| FHL3 | Q13643 | AC095032.1-201 | ENST00000444810 | 527 nt | TSL 3 BASIC | 3.15 | □□□□□ -1.91 | | |
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| FHL3 | Q13643 | AC133134.1-201 | ENST00000466800 | 359 nt | BASIC | 3.15 | □□□□□ -1.91 | | |
| FHL3 | Q13643 | AC018437.1-201 | ENST00000492214 | 406 nt | BASIC | 3.15 | □□□□□ -1.91 | | |
| FHL3 | Q13643 | RPL29P14-201 | ENST00000495837 | 428 nt | BASIC | 3.15 | □□□□□ -1.91 | | |
| FHL3 | Q13643 | AC116655.1-201 | ENST00000508324 | 901 nt | BASIC | 3.15 | □□□□□ -1.91 | | |