Protein–RNA interactions for Protein: Q13523

PRPF4B, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4BQ13523 AC116562.3-201ENST00000506136 177 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PRPF4BQ13523 AC116655.1-201ENST00000508324 901 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PRPF4BQ13523 AC117460.1-201ENST00000508964 467 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PRPF4BQ13523 MTCO3P28-201ENST00000513351 515 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PRPF4BQ13523 RNU4-29P-201ENST00000515943 174 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PRPF4BQ13523 Y_RNA.695-201ENST00000516715 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PRPF4BQ13523 AC022360.2-201ENST00000522390 456 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PRPF4BQ13523 AC100768.1-201ENST00000525512 506 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PRPF4BQ13523 AP001646.1-201ENST00000527936 915 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PRPF4BQ13523 AC068587.5-201ENST00000528506 175 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PRPF4BQ13523 AP000462.3-201ENST00000545593 330 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PRPF4BQ13523 LINC02328-203ENST00000557195 682 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PRPF4BQ13523 AC009145.3-201ENST00000567386 476 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PRPF4BQ13523 LINC00907-210ENST00000593316 847 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PRPF4BQ13523 BX546450.2-201ENST00000602419 435 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PRPF4BQ13523 DEFB131E-202ENST00000602581 683 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PRPF4BQ13523 AC008121.1-201ENST00000603244 268 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PRPF4BQ13523 MIR98-201ENST00000606724 119 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PRPF4BQ13523 AC135507.1-201ENST00000607214 561 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PRPF4BQ13523 AC025034.2-201ENST00000623264 286 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PRPF4BQ13523 NANOGNB-202ENST00000640040 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PRPF4BQ13523 AC004944.1-201ENST00000517807 3059 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PRPF4BQ13523 AC093536.2-201ENST00000565257 1406 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PRPF4BQ13523 AC010329.5-201ENST00000623497 2174 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PRPF4BQ13523 ZBTB8OS-201ENST00000341885 312 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
PRPF4BQ13523 SNORD62.1-201ENST00000362541 86 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PRPF4BQ13523 RNU6-1083P-201ENST00000384022 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PRPF4BQ13523 RNU6-19P-201ENST00000384718 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PRPF4BQ13523 C1DP2-201ENST00000418167 426 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PRPF4BQ13523 U51244.1-201ENST00000423120 374 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
PRPF4BQ13523 GAS5-221ENST00000450589 632 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
PRPF4BQ13523 AC092666.1-201ENST00000492054 573 ntTSL 4 BASIC2.86□□□□□ -1.95
PRPF4BQ13523 RNA5SP282-201ENST00000516355 108 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PRPF4BQ13523 RNU1-104P-201ENST00000517280 175 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PRPF4BQ13523 AL132819.1-201ENST00000555595 208 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
PRPF4BQ13523 AC098848.2-201ENST00000588023 330 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PRPF4BQ13523 AC040904.1-201ENST00000590850 223 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PRPF4BQ13523 AC087752.4-201ENST00000605911 462 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PRPF4BQ13523 AC138649.3-201ENST00000622154 254 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PRPF4BQ13523 SKIL-203ENST00000426052 2757 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
PRPF4BQ13523 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
PRPF4BQ13523 SNORD3E-201ENST00000362899 217 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PRPF4BQ13523 RNU6-179P-201ENST00000363350 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PRPF4BQ13523 RNA5SP68-201ENST00000363885 119 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PRPF4BQ13523 RNU6-1280P-201ENST00000365211 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PRPF4BQ13523 RNU6-282P-201ENST00000365357 103 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PRPF4BQ13523 Y_RNA.367-201ENST00000365544 101 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PRPF4BQ13523 RNU6-74P-201ENST00000384235 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PRPF4BQ13523 AC007463.1-201ENST00000416534 734 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PRPF4BQ13523 PTGES3P4-201ENST00000426243 356 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PRPF4BQ13523 LINC01626-201ENST00000431997 452 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PRPF4BQ13523 GPR143P-201ENST00000434155 205 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PRPF4BQ13523 AC073901.1-201ENST00000462471 408 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PRPF4BQ13523 UMAD1-204ENST00000482067 569 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PRPF4BQ13523 AC023194.1-201ENST00000493084 308 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PRPF4BQ13523 MTND4P2-201ENST00000507767 1203 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PRPF4BQ13523 AC104663.1-201ENST00000508555 557 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PRPF4BQ13523 AC112206.3-201ENST00000514578 389 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PRPF4BQ13523 AC103957.1-201ENST00000517681 503 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PRPF4BQ13523 MTND2P38-201ENST00000522536 667 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PRPF4BQ13523 OR4R1P-201ENST00000529879 463 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PRPF4BQ13523 AL356280.1-201ENST00000603614 379 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PRPF4BQ13523 AC245014.2-201ENST00000603689 287 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PRPF4BQ13523 AC246785.4-201ENST00000605374 287 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PRPF4BQ13523 MIR6817-201ENST00000615588 66 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PRPF4BQ13523 AKAP7-209ENST00000541650 2008 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PRPF4BQ13523 SHOC2-201ENST00000265277 3691 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
PRPF4BQ13523 C1orf141-203ENST00000371007 2153 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
PRPF4BQ13523 CLLU1-201ENST00000378485 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
PRPF4BQ13523 VBP1-204ENST00000625964 1547 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
PRPF4BQ13523 ANP32E-209ENST00000616917 2989 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
PRPF4BQ13523 TSGA10-205ENST00000410001 3036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
PRPF4BQ13523 OFD1P6Y-202ENST00000451061 2724 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PRPF4BQ13523 RNU6-348P-201ENST00000384386 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PRPF4BQ13523 MIR592-201ENST00000384959 97 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PRPF4BQ13523 LINC01040-201ENST00000425048 666 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
PRPF4BQ13523 MICF-203ENST00000432679 129 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PRPF4BQ13523 AL136234.1-201ENST00000437080 349 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
PRPF4BQ13523 AC011816.1-201ENST00000441346 546 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PRPF4BQ13523 NFIA-AS1-201ENST00000442027 384 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
PRPF4BQ13523 AC018693.1-201ENST00000442829 550 ntTSL 4 BASIC2.84□□□□□ -1.95
PRPF4BQ13523 KATNBL1P3-201ENST00000443475 909 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PRPF4BQ13523 AL118523.1-201ENST00000444436 480 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
PRPF4BQ13523 AC079448.1-201ENST00000449377 373 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PRPF4BQ13523 MTND1P27-201ENST00000451117 902 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PRPF4BQ13523 BTF3P15-201ENST00000455606 336 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PRPF4BQ13523 AL583843.1-201ENST00000456070 346 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PRPF4BQ13523 TSPY5P-202ENST00000456541 142 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
PRPF4BQ13523 AL359273.1-202ENST00000505585 905 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
PRPF4BQ13523 AC114781.4-201ENST00000513707 639 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PRPF4BQ13523 RNU6-410P-201ENST00000517006 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PRPF4BQ13523 ACA59.2-201ENST00000517061 156 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PRPF4BQ13523 RNU6-685P-201ENST00000517088 95 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PRPF4BQ13523 AC025524.1-201ENST00000518489 606 ntTSL 4 BASIC2.84□□□□□ -1.95
PRPF4BQ13523 AF117829.1-203ENST00000520306 421 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
PRPF4BQ13523 AC141273.1-201ENST00000565300 479 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
PRPF4BQ13523 AC025678.1-201ENST00000567861 338 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PRPF4BQ13523 AC119751.7-201ENST00000600494 245 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PRPF4BQ13523 AC098614.4-201ENST00000607601 462 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PRPF4BQ13523 GPR171-203ENST00000617554 960 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
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