Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 RNY3P4-201ENST00000384428 101 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
FOXE3Q13461 MIR513A2-201ENST00000385249 127 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
FOXE3Q13461 MIR3065-201ENST00000390137 79 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
FOXE3Q13461 SNORA12.2-201ENST00000391040 156 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
FOXE3Q13461 RN7SKP51-201ENST00000410781 304 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
FOXE3Q13461 Y_RNA.626-201ENST00000411288 95 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
FOXE3Q13461 TMSB10P2-201ENST00000416049 131 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
FOXE3Q13461 AL136084.2-202ENST00000433997 353 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
FOXE3Q13461 BX679664.1-201ENST00000434429 253 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
FOXE3Q13461 RPL26P6-201ENST00000440913 438 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
FOXE3Q13461 TPT1P12-201ENST00000448968 492 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
FOXE3Q13461 LINC01032-201ENST00000451690 276 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
FOXE3Q13461 U8.21-201ENST00000459536 136 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
FOXE3Q13461 RN7SL41P-201ENST00000476144 297 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
FOXE3Q13461 AC098851.1-201ENST00000476561 570 ntTSL 4 BASIC3.48□□□□□ -1.85
FOXE3Q13461 AC092059.1-201ENST00000485347 429 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
FOXE3Q13461 RN7SL812P-201ENST00000493791 279 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
FOXE3Q13461 LINC02017-201ENST00000496829 474 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
FOXE3Q13461 AC092440.1-201ENST00000512563 571 ntTSL 4 BASIC3.48□□□□□ -1.85
FOXE3Q13461 ABCA17P-206ENST00000512848 467 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
FOXE3Q13461 AC010420.1-201ENST00000515077 509 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
FOXE3Q13461 RNU2-58P-201ENST00000516403 183 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
FOXE3Q13461 AC091144.1-201ENST00000519573 138 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
FOXE3Q13461 AP004242.1-201ENST00000533701 349 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
FOXE3Q13461 MRPS36P4-201ENST00000534436 298 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
FOXE3Q13461 TMEM106C-220ENST00000552561 810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
FOXE3Q13461 AL355095.1-201ENST00000554451 539 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
FOXE3Q13461 AL157871.3-201ENST00000557231 293 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
FOXE3Q13461 Y_RNA.772-201ENST00000606692 102 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
FOXE3Q13461 MIR378J-201ENST00000611988 109 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
FOXE3Q13461 AC004852.3-201ENST00000614131 326 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
FOXE3Q13461 BPY2B-204ENST00000615850 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
FOXE3Q13461 BPY2C-204ENST00000618574 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
FOXE3Q13461 CNOT2-231ENST00000551483 4753 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
FOXE3Q13461 CNOT10-206ENST00000454516 2760 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
FOXE3Q13461 AC011266.1-201ENST00000624119 3569 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
FOXE3Q13461 AC021355.1-202ENST00000519996 1633 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
FOXE3Q13461 ENPP2-202ENST00000259486 3233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
FOXE3Q13461 LINC02431-201ENST00000503929 3601 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
FOXE3Q13461 NCAPGP1-201ENST00000505112 1814 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
FOXE3Q13461 IQCH-206ENST00000546225 3112 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
FOXE3Q13461 C5orf63-205ENST00000535381 5680 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
FOXE3Q13461 ITCH-202ENST00000374864 6401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
FOXE3Q13461 RNU6-704P-201ENST00000364162 103 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
FOXE3Q13461 RNA5SP509-201ENST00000364577 119 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
FOXE3Q13461 SNORD6-201ENST00000365444 73 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
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FOXE3Q13461 MIR613-201ENST00000385248 95 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
FOXE3Q13461 U3.22-201ENST00000391120 215 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
FOXE3Q13461 MTCYBP2-201ENST00000407745 171 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
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FOXE3Q13461 LINC02331-201ENST00000418927 602 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
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FOXE3Q13461 AL392046.1-203ENST00000450106 651 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
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FOXE3Q13461 snoU13.3-201ENST00000459441 104 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
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FOXE3Q13461 AC008694.2-201ENST00000517591 306 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
FOXE3Q13461 AC113192.5-201ENST00000528779 486 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
FOXE3Q13461 MDM2-232ENST00000544561 213 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
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FOXE3Q13461 GHR-213ENST00000622294 4312 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
FOXE3Q13461 SLC10A2-201ENST00000245312 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
FOXE3Q13461 OSBPL6-201ENST00000190611 10513 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
FOXE3Q13461 GPR34-201ENST00000378138 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
FOXE3Q13461 AC007785.2-201ENST00000598627 1916 ntBASIC3.46□□□□□ -1.85
FOXE3Q13461 WAC-221ENST00000628285 2740 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 MAP3K19-203ENST00000375845 4369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 ZNF382-203ENST00000435416 3865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 LCA5L-218ENST00000485895 2551 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 MIR448-201ENST00000362131 111 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 RNU6-858P-201ENST00000362436 107 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 RNY4P28-201ENST00000365281 93 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 RNU1-63P-201ENST00000383902 164 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 AL360169.1-201ENST00000435116 143 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 AL161618.1-201ENST00000438738 761 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 AC135371.1-201ENST00000446964 453 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 HSPE1P25-201ENST00000455484 251 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 AC092919.1-201ENST00000467896 229 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 AC011276.1-201ENST00000469688 323 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 RN7SL303P-201ENST00000469773 251 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 AC109925.1-201ENST00000478069 331 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 ZCCHC10-206ENST00000509008 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 RNU6-1012P-201ENST00000516606 109 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 RNA5SP73-201ENST00000516744 108 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 RNU6-612P-201ENST00000516909 102 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
FOXE3Q13461 RNU6-143P-201ENST00000516942 93 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
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