Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 ECT2-204ENST00000392692 4158 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 OTOGL-202ENST00000458043 8083 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 MIR412-201ENST00000362142 91 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 RNU6-37P-201ENST00000362692 107 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 RNU6-11P-201ENST00000364234 107 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 RNA5SP51-201ENST00000364750 119 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 RNU6-7-201ENST00000364784 107 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 RNU6-8-201ENST00000365467 107 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 ADGRL2-203ENST00000370713 5382 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 RNU6-25P-201ENST00000383873 107 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 RNU6-1-201ENST00000383898 107 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 RNU6-48P-201ENST00000384161 107 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 RNU6-36P-201ENST00000384172 107 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 RNU6-4P-201ENST00000384205 107 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 RNU6-5P-201ENST00000384238 107 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 RNU6-3P-201ENST00000384314 107 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 RNU6-16P-201ENST00000384385 107 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 RNU6-15P-201ENST00000384534 107 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 RNU6-2-201ENST00000384627 107 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 RNU6-29P-201ENST00000384637 107 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 RNU6-9-201ENST00000384776 107 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 RNU6-33P-201ENST00000384793 107 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 DEFB116-201ENST00000400549 309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 MIR1251-201ENST00000408552 70 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 AL592466.1-201ENST00000428346 307 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 TRAPPC2P8-201ENST00000440676 396 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 AL353752.1-201ENST00000454946 260 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 AL445465.2-201ENST00000455530 461 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 AC010469.1-201ENST00000463864 576 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 AC069499.1-201ENST00000489433 509 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 AC108022.1-201ENST00000493466 478 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 SCARNA14-201ENST00000516903 136 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 AC095350.2-201ENST00000544034 201 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 SUB1P3-201ENST00000564581 315 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 AC012493.2-201ENST00000595083 291 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 VN1R107P-201ENST00000601784 209 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 RNU6-6P-201ENST00000606623 107 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 AC007792.1-201ENST00000623023 402 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 LINC02246-205ENST00000627623 417 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 AP003481.1-201ENST00000637808 351 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 ABCA12-202ENST00000389661 7005 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 KMO-204ENST00000366559 5261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 RANBP6-201ENST00000259569 4576 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 TAB3-203ENST00000378930 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 CACNB4-257ENST00000637547 7658 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 LINC00283-201ENST00000430111 1947 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 CDK1-209ENST00000614696 1884 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 TRDN-206ENST00000628709 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 MIR448-201ENST00000362131 111 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 RNU6-99P-201ENST00000364721 107 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 SET-203ENST00000372688 801 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 Y_RNA.574-201ENST00000384766 95 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 AL513475.1-201ENST00000406602 315 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 RNU6-174P-201ENST00000410406 106 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 Z85995.1-201ENST00000415547 335 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 PGBD4P6-201ENST00000421501 610 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 COTL1P1-201ENST00000422309 375 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 RBMY1KP-201ENST00000423480 476 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 UTS2B-203ENST00000427544 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 AC108059.2-201ENST00000434626 151 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 HMGB1P12-201ENST00000438594 598 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 AL591501.1-201ENST00000439992 495 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 SNORD105B-201ENST00000458770 79 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 RNU6-1037P-201ENST00000459571 107 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 AC098851.1-201ENST00000476561 570 ntTSL 4 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 AC091976.1-202ENST00000509211 630 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 LINC01256-201ENST00000513270 508 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 RNU4-77P-201ENST00000516692 156 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 AC021713.1-201ENST00000526554 510 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 AC026992.1-202ENST00000558454 421 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 AC092138.1-201ENST00000568659 472 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 AF001550.1-201ENST00000572747 573 ntTSL 4 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 AL355598.1-201ENST00000604169 202 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 AC136601.2-201ENST00000604356 474 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 PRR13P7-201ENST00000605538 430 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 AL713922.2-201ENST00000619384 716 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SF3B2Q13435 CKAP5-201ENST00000312055 6532 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SF3B2Q13435 AC104662.3-202ENST00000507794 4055 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SF3B2Q13435 ZSCAN26-204ENST00000614088 2321 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SF3B2Q13435 CNTN6-201ENST00000350110 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
SF3B2Q13435 CD80-201ENST00000264246 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
SF3B2Q13435 TMEM71-201ENST00000356838 1993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
SF3B2Q13435 RNU6-596P-201ENST00000365395 98 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SF3B2Q13435 TRAJ16-201ENST00000390521 60 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SF3B2Q13435 Y_RNA.618-201ENST00000410949 107 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SF3B2Q13435 EI24P1-201ENST00000416584 867 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SF3B2Q13435 AL096701.2-201ENST00000416920 238 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SF3B2Q13435 NDUFB4P7-201ENST00000423198 363 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SF3B2Q13435 AL590383.1-201ENST00000428602 75 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SF3B2Q13435 AC005326.1-201ENST00000429197 123 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SF3B2Q13435 FABP5P15-201ENST00000453566 214 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SF3B2Q13435 SPAG11B-206ENST00000458665 444 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SF3B2Q13435 AC025518.1-201ENST00000479856 347 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SF3B2Q13435 AC022447.4-201ENST00000504053 364 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SF3B2Q13435 RNU6-475P-201ENST00000516073 104 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SF3B2Q13435 RNA5SP291-201ENST00000517222 105 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SF3B2Q13435 CBX3P8-201ENST00000532412 525 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SF3B2Q13435 AC004024.1-201ENST00000549244 247 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SF3B2Q13435 AL359232.1-201ENST00000556361 442 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SF3B2Q13435 AC244505.7-201ENST00000599675 272 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
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