Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 CPHL1P-203ENST00000471823 523 ntTSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
XRCC4Q13426 AC011005.2-201ENST00000487324 359 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
XRCC4Q13426 MTCO3P27-201ENST00000514397 196 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
XRCC4Q13426 RNY4P37-201ENST00000516225 96 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
XRCC4Q13426 AP003355.1-201ENST00000518956 587 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
XRCC4Q13426 ELOC-204ENST00000519487 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.64□□□□□ -2.15
XRCC4Q13426 NARSP2-202ENST00000522022 349 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
XRCC4Q13426 AL133153.1-201ENST00000557756 303 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
XRCC4Q13426 AC015813.2-201ENST00000578794 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
XRCC4Q13426 AC099785.1-201ENST00000605697 437 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
XRCC4Q13426 AC090186.1-201ENST00000605991 572 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
XRCC4Q13426 uc_338.5-201ENST00000611839 155 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
XRCC4Q13426 GS1-279B7.1-204ENST00000641809 378 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
XRCC4Q13426 CEP57L1-201ENST00000359793 2515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
XRCC4Q13426 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
XRCC4Q13426 RNU1-17P-201ENST00000363022 152 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
XRCC4Q13426 AL359634.1-202ENST00000404721 284 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
XRCC4Q13426 MRPL30-202ENST00000409145 562 ntTSL 2 BASIC1.63□□□□□ -2.15
XRCC4Q13426 TEX41-202ENST00000414256 604 ntTSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
XRCC4Q13426 AL161909.2-201ENST00000417577 409 ntTSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
XRCC4Q13426 UBE2V1P4-201ENST00000425374 344 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
XRCC4Q13426 RAB3GAP1-202ENST00000425393 1139 ntTSL 2 BASIC1.63□□□□□ -2.15
XRCC4Q13426 AL050338.2-202ENST00000431609 956 ntTSL 2 BASIC1.63□□□□□ -2.15
XRCC4Q13426 EHHADH-202ENST00000440662 656 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
XRCC4Q13426 AL161937.1-201ENST00000444478 425 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
XRCC4Q13426 AL353148.1-203ENST00000452286 665 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
XRCC4Q13426 AL359915.2-203ENST00000457043 540 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
XRCC4Q13426 LEKR1-206ENST00000483177 546 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
XRCC4Q13426 AC023194.1-201ENST00000493084 308 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
XRCC4Q13426 AC139453.3-201ENST00000493276 369 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
XRCC4Q13426 BMPR1B-AS1-201ENST00000510795 511 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
XRCC4Q13426 SNORA31.3-201ENST00000516029 96 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
XRCC4Q13426 AC007991.3-201ENST00000517623 502 ntTSL 4 BASIC1.63□□□□□ -2.15
XRCC4Q13426 UTP23-205ENST00000520733 369 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
XRCC4Q13426 AC005832.3-201ENST00000537929 631 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
XRCC4Q13426 AC027458.1-201ENST00000563639 613 ntTSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
XRCC4Q13426 AC060771.1-201ENST00000582031 164 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
XRCC4Q13426 AC012593.1-213ENST00000587255 510 ntTSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
XRCC4Q13426 AC021171.1-201ENST00000603137 706 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
XRCC4Q13426 DPPA3P3-201ENST00000603842 430 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
XRCC4Q13426 AL670379.10-201ENST00000604330 253 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
XRCC4Q13426 AL670379.9-201ENST00000605428 253 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
XRCC4Q13426 AC103810.8-201ENST00000607347 118 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
XRCC4Q13426 LINC01206-214ENST00000610910 456 ntTSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
XRCC4Q13426 AL359314.1-201ENST00000616913 261 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
XRCC4Q13426 OR8H2-202ENST00000618136 1038 ntAPPRIS ALT1 BASIC1.63□□□□□ -2.15
XRCC4Q13426 SKIL-202ENST00000413427 2702 ntTSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
XRCC4Q13426 TRIQK-201ENST00000378861 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
XRCC4Q13426 TDRD15-202ENST00000622654 5805 ntAPPRIS P1 BASIC1.63□□□□□ -2.15
XRCC4Q13426 CFHR4-204ENST00000608469 1601 ntTSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
XRCC4Q13426 MUC15-202ENST00000436318 3118 ntTSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
XRCC4Q13426 AC006026.1-201ENST00000444025 1803 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
XRCC4Q13426 snoZ40.1-201ENST00000364540 72 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
XRCC4Q13426 TXNDC8-203ENST00000374511 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
XRCC4Q13426 CD80-202ENST00000383669 771 ntTSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
XRCC4Q13426 MIR320A-201ENST00000385302 82 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
XRCC4Q13426 RNU6-482P-201ENST00000391068 107 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
XRCC4Q13426 AL591034.2-201ENST00000402839 359 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
XRCC4Q13426 FO680682.1-201ENST00000421261 345 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
XRCC4Q13426 ZNF736P11Y-201ENST00000442535 1213 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
XRCC4Q13426 AC017099.1-201ENST00000448261 1028 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
XRCC4Q13426 PAXBP1P1-201ENST00000449315 447 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
XRCC4Q13426 SSXP1-201ENST00000453640 473 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
XRCC4Q13426 FCF1P6-201ENST00000456841 595 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
XRCC4Q13426 RNU7-59P-201ENST00000459101 61 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
XRCC4Q13426 FO393415.2-201ENST00000480085 343 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
XRCC4Q13426 LRRC70-203ENST00000491184 703 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
XRCC4Q13426 AC084117.1-201ENST00000496975 270 ntTSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
XRCC4Q13426 RNU6-143P-201ENST00000516942 93 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
XRCC4Q13426 AP004607.1-201ENST00000524456 203 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
XRCC4Q13426 AC087894.1-201ENST00000538359 518 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
XRCC4Q13426 AL355076.2-202ENST00000553754 574 ntTSL 4 BASIC1.62□□□□□ -2.15
XRCC4Q13426 AC009101.2-201ENST00000564293 456 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
XRCC4Q13426 AL512347.1-201ENST00000566420 503 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
XRCC4Q13426 AL354943.1-201ENST00000572103 781 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
XRCC4Q13426 MIR4769-201ENST00000584126 77 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
XRCC4Q13426 EAF1-AS1-207ENST00000599742 772 ntTSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
XRCC4Q13426 AL133445.2-201ENST00000611191 527 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
XRCC4Q13426 AL158163.2-201ENST00000619110 700 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
XRCC4Q13426 AC068733.3-201ENST00000632757 269 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
XRCC4Q13426 AC092192.1-201ENST00000633154 1018 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
XRCC4Q13426 PCMTD1P7-201ENST00000634506 357 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
XRCC4Q13426 CD44-239ENST00000639002 528 ntTSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
XRCC4Q13426 FKTN-204ENST00000448551 1700 ntTSL 2 BASIC1.62□□□□□ -2.15
XRCC4Q13426 FGF7-202ENST00000560270 1688 ntTSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
XRCC4Q13426 MIPOL1-203ENST00000537471 5954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
XRCC4Q13426 AC103993.1-201ENST00000521500 1584 ntTSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
XRCC4Q13426 DLEU2_6.3-201ENST00000340052 136 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
XRCC4Q13426 RNU1-23P-201ENST00000363361 144 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
XRCC4Q13426 RNU6-188P-201ENST00000364207 107 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
XRCC4Q13426 RNU1-57P-201ENST00000384491 166 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
XRCC4Q13426 AC068050.1-201ENST00000394891 380 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
XRCC4Q13426 AL590084.1-201ENST00000407885 387 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
XRCC4Q13426 AL445669.1-201ENST00000426743 755 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
XRCC4Q13426 AC007879.4-201ENST00000440545 361 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
XRCC4Q13426 AC006458.1-201ENST00000445093 653 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
XRCC4Q13426 MTCO2P25-201ENST00000447065 681 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
XRCC4Q13426 USP9YP10-201ENST00000454868 628 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
XRCC4Q13426 LINC01075-201ENST00000455977 370 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
XRCC4Q13426 AC112492.4-201ENST00000456549 352 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.4 ms