Protein–RNA interactions for Protein: Q13061

TRDN, Triadin, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDNQ13061 AC015712.3-201ENST00000559380 164 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TRDNQ13061 AC021739.1-201ENST00000559631 174 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TRDNQ13061 MIR4285-201ENST00000581001 85 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TRDNQ13061 AP005901.2-201ENST00000581690 525 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
TRDNQ13061 AL157938.2-201ENST00000587264 894 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
TRDNQ13061 MTCYBP22-201ENST00000603788 447 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TRDNQ13061 AC091152.3-201ENST00000604227 325 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TRDNQ13061 AC009233.1-201ENST00000616477 371 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TRDNQ13061 AL356596.1-201ENST00000624230 379 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TRDNQ13061 SEPT14P19-202ENST00000632397 370 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
TRDNQ13061 RNU6-621P-201ENST00000364752 109 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TRDNQ13061 RNU6-658P-201ENST00000384606 106 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TRDNQ13061 AC093019.2-201ENST00000432294 384 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
TRDNQ13061 AL138830.1-201ENST00000435802 402 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
TRDNQ13061 LINC01510-201ENST00000441991 468 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
TRDNQ13061 PTENP1-201ENST00000447117 1215 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TRDNQ13061 AC099566.1-212ENST00000451675 799 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
TRDNQ13061 USP9YP10-201ENST00000454868 628 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TRDNQ13061 GUCA1C-203ENST00000471108 633 ntTSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.11
TRDNQ13061 AC117503.1-201ENST00000472241 394 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TRDNQ13061 HMGB1P35-201ENST00000503360 598 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TRDNQ13061 AC026719.1-201ENST00000506059 456 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
TRDNQ13061 BMPR1B-AS1-201ENST00000510795 511 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
TRDNQ13061 AC006199.1-201ENST00000548728 219 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TRDNQ13061 PSMA4-205ENST00000558281 773 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
TRDNQ13061 AL354943.1-201ENST00000572103 781 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TRDNQ13061 AL078605.1-201ENST00000603529 500 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TRDNQ13061 AL158042.1-201ENST00000605338 460 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TRDNQ13061 TP73-AS1.1-201ENST00000611447 161 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TRDNQ13061 uc_338.5-201ENST00000611839 155 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TRDNQ13061 AC079416.3-201ENST00000624479 549 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TRDNQ13061 AC092125.1-201ENST00000562568 1995 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TRDNQ13061 SHOC2-201ENST00000265277 3691 ntTSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.12
TRDNQ13061 RNU1-17P-201ENST00000363022 152 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TRDNQ13061 RNU6-1167P-201ENST00000363227 94 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TRDNQ13061 MIR19A-201ENST00000384878 82 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TRDNQ13061 MIR517C-201ENST00000385103 95 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TRDNQ13061 SNORA67.5-201ENST00000391036 107 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TRDNQ13061 RNA5SP212-201ENST00000391223 107 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TRDNQ13061 AC068050.1-201ENST00000394891 380 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TRDNQ13061 MRPL30-202ENST00000409145 562 ntTSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
TRDNQ13061 AL359704.1-201ENST00000411586 781 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TRDNQ13061 DNAJA1P2-201ENST00000421360 1197 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TRDNQ13061 AC009313.1-201ENST00000425470 503 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
TRDNQ13061 RPL36AP53-201ENST00000432891 316 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TRDNQ13061 AL161651.1-201ENST00000440882 223 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TRDNQ13061 AL358794.1-201ENST00000445689 381 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TRDNQ13061 ELOCP30-201ENST00000447108 299 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TRDNQ13061 AC020550.1-201ENST00000447385 163 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TRDNQ13061 AC008154.1-201ENST00000453087 327 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
TRDNQ13061 AF129075.1-201ENST00000457162 794 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
TRDNQ13061 AL390961.3-201ENST00000458171 485 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
TRDNQ13061 RNU6-927P-201ENST00000516199 100 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TRDNQ13061 AC009712.1-201ENST00000564938 316 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TRDNQ13061 MIR3167-201ENST00000579623 85 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TRDNQ13061 AC009977.1-201ENST00000586015 570 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TRDNQ13061 SEPT7P9-203ENST00000604116 343 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TRDNQ13061 AC009269.6-201ENST00000621778 588 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TRDNQ13061 AL049777.1-201ENST00000622740 518 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TRDNQ13061 AP000720.1-201ENST00000625091 483 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TRDNQ13061 PCMTD1P7-201ENST00000634506 357 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TRDNQ13061 AC009975.1-201ENST00000634588 2698 ntTSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
TRDNQ13061 AP000648.3-201ENST00000623539 4507 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TRDNQ13061 STARD6-201ENST00000307844 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
TRDNQ13061 RNU6-223P-201ENST00000362830 107 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TRDNQ13061 SNORA8-201ENST00000384574 139 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TRDNQ13061 RNU6-748P-201ENST00000384648 107 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TRDNQ13061 CISD1P1-201ENST00000393907 327 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TRDNQ13061 MTATP6P20-201ENST00000414147 562 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TRDNQ13061 AL513185.2-201ENST00000425543 193 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TRDNQ13061 AC244035.1-201ENST00000430042 390 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TRDNQ13061 AC013269.3-201ENST00000450486 444 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
TRDNQ13061 AMD1P1-201ENST00000457220 922 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TRDNQ13061 AL049829.1-201ENST00000465411 156 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TRDNQ13061 AC023790.1-201ENST00000482174 347 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TRDNQ13061 C4orf33-204ENST00000502887 1126 ntTSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
TRDNQ13061 AC109454.3-201ENST00000512748 669 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
TRDNQ13061 RNU6-581P-201ENST00000516214 105 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TRDNQ13061 RNU6-64P-201ENST00000517119 105 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TRDNQ13061 NARSP2-202ENST00000522022 349 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
TRDNQ13061 LINC01919-202ENST00000579506 384 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
TRDNQ13061 ZNF573-209ENST00000585724 453 ntTSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
TRDNQ13061 BNIP3P25-201ENST00000596023 559 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TRDNQ13061 AC012594.1-269ENST00000600489 628 ntTSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
TRDNQ13061 AC004987.4-201ENST00000603383 338 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TRDNQ13061 AL161798.1-201ENST00000604630 131 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TRDNQ13061 AC025754.2-201ENST00000606491 432 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TRDNQ13061 AC097468.3-201ENST00000607956 456 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TRDNQ13061 DPY19L1-208ENST00000612226 607 ntTSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
TRDNQ13061 AC244517.7-201ENST00000625144 398 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
TRDNQ13061 AC097655.1-201ENST00000635075 318 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TRDNQ13061 AL391597.2-201ENST00000635698 479 ntTSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
TRDNQ13061 MTND5P33-201ENST00000571250 1450 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TRDNQ13061 ZNF29P-201ENST00000225587 168 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
TRDNQ13061 SNORA4.1-201ENST00000364263 144 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
TRDNQ13061 RNU6-1176P-201ENST00000390955 107 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
TRDNQ13061 CXADR-203ENST00000400165 603 ntTSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
TRDNQ13061 AC073311.1-201ENST00000420146 505 ntTSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
TRDNQ13061 AC016710.1-201ENST00000421326 466 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
TRDNQ13061 BX005214.1-201ENST00000427327 476 ntTSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.3 ms