Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 CATSPERB-201ENST00000256343 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
CNTN1Q12860 TAB3-205ENST00000378933 6671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
CNTN1Q12860 MTND5P17-201ENST00000418405 1603 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CNTN1Q12860 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
CNTN1Q12860 TAB2-201ENST00000367456 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
CNTN1Q12860 NACAP2-201ENST00000318548 624 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CNTN1Q12860 MT-CYB-201ENST00000361789 1141 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
CNTN1Q12860 Y_RNA.194-201ENST00000363985 102 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CNTN1Q12860 RNU6-658P-201ENST00000384606 106 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CNTN1Q12860 Y_RNA.559-201ENST00000384686 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CNTN1Q12860 SNORA67.4-201ENST00000384688 142 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CNTN1Q12860 MIR767-201ENST00000390228 109 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CNTN1Q12860 Y_RNA.582-201ENST00000391023 95 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CNTN1Q12860 RNA5SP354-201ENST00000391247 136 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CNTN1Q12860 TANK-204ENST00000403609 555 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
CNTN1Q12860 MYL8P-204ENST00000431574 518 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CNTN1Q12860 AL135923.2-201ENST00000435444 501 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
CNTN1Q12860 RPS15AP9-201ENST00000439856 381 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CNTN1Q12860 RPL23AP58-201ENST00000440453 469 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CNTN1Q12860 AC018693.1-201ENST00000442829 550 ntTSL 4 BASIC2.56□□□□□ -2
CNTN1Q12860 AL138830.2-202ENST00000446358 786 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
CNTN1Q12860 LINC01162-201ENST00000447262 447 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
CNTN1Q12860 MTATP6P7-201ENST00000453315 681 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CNTN1Q12860 CACYBPP2-201ENST00000453625 678 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CNTN1Q12860 AC110767.1-201ENST00000508374 239 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
CNTN1Q12860 RN7SKP24-201ENST00000515888 284 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CNTN1Q12860 SNORD27.1-201ENST00000516319 72 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CNTN1Q12860 SUB1P1-201ENST00000524415 382 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CNTN1Q12860 SUB1P2-201ENST00000556401 297 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CNTN1Q12860 AL157871.3-201ENST00000557231 293 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CNTN1Q12860 AC009145.1-201ENST00000563230 433 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
CNTN1Q12860 AC008521.1-201ENST00000587471 187 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CNTN1Q12860 AC007621.1-201ENST00000604544 437 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CNTN1Q12860 AC103591.3-201ENST00000608684 209 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CNTN1Q12860 CERS6-AS1-209ENST00000609766 642 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
CNTN1Q12860 AC013412.1-201ENST00000610687 192 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CNTN1Q12860 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
CNTN1Q12860 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
CNTN1Q12860 SNORA62.1-201ENST00000364287 154 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CNTN1Q12860 AKAP14-203ENST00000371425 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
CNTN1Q12860 AKR1C1-201ENST00000380859 858 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
CNTN1Q12860 OR5H15-201ENST00000383696 930 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CNTN1Q12860 SNORD21-201ENST00000383953 95 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CNTN1Q12860 Y_RNA.436-201ENST00000384097 102 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CNTN1Q12860 MIR454-201ENST00000390180 115 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CNTN1Q12860 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CNTN1Q12860 CISD1P1-201ENST00000393907 327 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CNTN1Q12860 PPP3R1-202ENST00000409377 684 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
CNTN1Q12860 RNU2-49P-201ENST00000410666 184 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CNTN1Q12860 RNA5SP508-201ENST00000411327 119 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CNTN1Q12860 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CNTN1Q12860 AC008440.2-201ENST00000413496 423 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
CNTN1Q12860 AL096701.2-201ENST00000416920 238 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CNTN1Q12860 AC007566.1-201ENST00000427458 643 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
CNTN1Q12860 RPS3AP17-201ENST00000472594 777 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CNTN1Q12860 RPL9P33-201ENST00000484311 566 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CNTN1Q12860 AC023194.1-201ENST00000493084 308 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CNTN1Q12860 AC091133.4-201ENST00000511142 308 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CNTN1Q12860 UQCRB-202ENST00000517523 515 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
CNTN1Q12860 AC109329.2-201ENST00000519658 482 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CNTN1Q12860 OR5AL2P-201ENST00000532185 920 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CNTN1Q12860 AC091047.1-201ENST00000533344 552 ntTSL 4 BASIC2.55□□□□□ -2
CNTN1Q12860 AC009063.1-201ENST00000563342 702 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CNTN1Q12860 AC007610.2-201ENST00000566770 666 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
CNTN1Q12860 AC025281.1-201ENST00000567026 265 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CNTN1Q12860 MIR1273C-201ENST00000578669 77 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CNTN1Q12860 AC008739.2-201ENST00000597006 317 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CNTN1Q12860 AC091805.2-201ENST00000603848 235 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CNTN1Q12860 NDUFA8P1-201ENST00000605525 367 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CNTN1Q12860 AC126118.1-201ENST00000607744 628 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CNTN1Q12860 AC013562.2-201ENST00000611632 603 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CNTN1Q12860 Z99129.1-201ENST00000612510 255 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CNTN1Q12860 AC011939.3-201ENST00000613686 466 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CNTN1Q12860 U4.3-201ENST00000621047 82 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CNTN1Q12860 AC009161.2-201ENST00000624626 138 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CNTN1Q12860 AC099654.7-201ENST00000635788 2127 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CNTN1Q12860 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
CNTN1Q12860 PSG8-202ENST00000401467 1686 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
CNTN1Q12860 ACTR6-212ENST00000552376 1659 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
CNTN1Q12860 SERPINI2-202ENST00000461846 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
CNTN1Q12860 Y_RNA.33-201ENST00000362591 102 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CNTN1Q12860 Y_RNA.318-201ENST00000365131 97 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CNTN1Q12860 SNORD115-7-201ENST00000365306 82 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CNTN1Q12860 RNU5A-6P-201ENST00000384136 116 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CNTN1Q12860 RNU6-1042P-201ENST00000384204 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CNTN1Q12860 Y_RNA.576-201ENST00000384781 102 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CNTN1Q12860 MIR518C-201ENST00000384822 101 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CNTN1Q12860 RNU6-1025P-201ENST00000410629 104 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CNTN1Q12860 RNU2-66P-201ENST00000410650 161 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CNTN1Q12860 RNU2-16P-201ENST00000410712 136 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CNTN1Q12860 RNU6-387P-201ENST00000411331 105 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CNTN1Q12860 AC104462.1-201ENST00000414565 447 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
CNTN1Q12860 ATP13A5-AS1-201ENST00000414634 476 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
CNTN1Q12860 AL031779.1-201ENST00000415663 330 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CNTN1Q12860 AC133106.1-201ENST00000419029 397 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
CNTN1Q12860 AL160275.3-201ENST00000423876 471 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CNTN1Q12860 AC098614.2-201ENST00000426040 255 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CNTN1Q12860 AL353612.1-201ENST00000428769 465 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
CNTN1Q12860 AC098831.1-201ENST00000440661 216 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CNTN1Q12860 BRK1P2-201ENST00000442875 223 ntBASIC2.54□□□□□ -2
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