Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 AC027309.3-201ENST00000623419 351 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
CCDC85BQ15834 PCNP-208ENST00000627393 136 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
CCDC85BQ15834 IFI44L-201ENST00000370751 5874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
CCDC85BQ15834 USP8P1-201ENST00000494673 3183 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
CCDC85BQ15834 FAM208A-202ENST00000431842 7119 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
CCDC85BQ15834 AL672167.1-203ENST00000641299 2975 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
CCDC85BQ15834 CYLC1-201ENST00000329312 2106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
CCDC85BQ15834 AC079062.1-203ENST00000581862 3610 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
CCDC85BQ15834 PIGN-242ENST00000640145 4505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
CCDC85BQ15834 HSP90AA4P-202ENST00000506915 2228 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CCDC85BQ15834 CEP120-203ENST00000328236 4710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
CCDC85BQ15834 PRKAA2-202ENST00000610361 9280 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
CCDC85BQ15834 RASGEF1B-207ENST00000509081 3016 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
CCDC85BQ15834 CD80-201ENST00000264246 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
CCDC85BQ15834 PPP1R9A-201ENST00000289495 3983 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
CCDC85BQ15834 U3.6-201ENST00000363622 211 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CCDC85BQ15834 RNA5SP72-201ENST00000364442 117 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CCDC85BQ15834 RNA5SP189-201ENST00000364920 115 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CCDC85BQ15834 MIR325-201ENST00000385260 98 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CCDC85BQ15834 RNU6-1197P-201ENST00000391183 107 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CCDC85BQ15834 SAR1AP2-201ENST00000392696 594 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CCDC85BQ15834 RPL21P1-201ENST00000399532 476 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CCDC85BQ15834 SNORA57.3-201ENST00000411095 141 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CCDC85BQ15834 MTND3P9-201ENST00000429526 346 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CCDC85BQ15834 AC008080.3-201ENST00000440074 380 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
CCDC85BQ15834 ABCF2P2-201ENST00000450549 296 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CCDC85BQ15834 GYPA-208ENST00000512064 441 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
CCDC85BQ15834 RNU1-95P-201ENST00000516357 160 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CCDC85BQ15834 RNU1-128P-201ENST00000516704 160 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CCDC85BQ15834 AC068880.3-201ENST00000519185 179 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
CCDC85BQ15834 AC022882.1-201ENST00000532142 501 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CCDC85BQ15834 LINC02095-202ENST00000543512 323 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
CCDC85BQ15834 AC073525.1-201ENST00000549762 543 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
CCDC85BQ15834 AC091043.1-201ENST00000579830 453 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
CCDC85BQ15834 MIR5195-201ENST00000583555 115 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CCDC85BQ15834 STARD13-AS-221ENST00000608197 604 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
CCDC85BQ15834 AC009318.2-201ENST00000610917 651 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CCDC85BQ15834 AL021997.2-201ENST00000615674 271 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CCDC85BQ15834 NCBP1-205ENST00000629069 249 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
CCDC85BQ15834 U4.7-201ENST00000638126 106 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CCDC85BQ15834 GYPB-216ENST00000638448 363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
CCDC85BQ15834 CNOT1-201ENST00000317147 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
CCDC85BQ15834 ZPLD1-202ENST00000466937 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
CCDC85BQ15834 OR1C1-202ENST00000641256 3719 ntAPPRIS P1 BASIC4.5□□□□□ -1.69
CCDC85BQ15834 LRIF1-203ENST00000494675 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
CCDC85BQ15834 BMPR1B-203ENST00000440890 5388 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
CCDC85BQ15834 DMD-207ENST00000378677 13932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
CCDC85BQ15834 FAM49B-212ENST00000519110 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
CCDC85BQ15834 SNORD50.1-201ENST00000362987 71 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CCDC85BQ15834 Y_RNA.276-201ENST00000364732 109 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CCDC85BQ15834 RNU6-140P-201ENST00000384566 108 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CCDC85BQ15834 RNU6-713P-201ENST00000384761 107 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CCDC85BQ15834 MIR30B-201ENST00000384850 88 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CCDC85BQ15834 TRAV23DV6-201ENST00000390451 409 ntAPPRIS P1 BASIC4.49□□□□□ -1.69
CCDC85BQ15834 AL691449.1-201ENST00000426570 421 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CCDC85BQ15834 DYNLT3P2-201ENST00000442517 295 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CCDC85BQ15834 MIR4435-2HG-213ENST00000451884 423 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
CCDC85BQ15834 snoU109.2-201ENST00000459316 135 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CCDC85BQ15834 RPL30P5-201ENST00000494923 336 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CCDC85BQ15834 AC023141.12-201ENST00000512399 199 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CCDC85BQ15834 RNU1-103P-201ENST00000516502 125 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CCDC85BQ15834 AL163973.3-201ENST00000547093 430 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
CCDC85BQ15834 AL136038.2-201ENST00000553983 283 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
CCDC85BQ15834 AC062037.2-201ENST00000610137 73 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CCDC85BQ15834 MIR8062-201ENST00000621515 85 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CCDC85BQ15834 SCARNA4-202ENST00000625402 129 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CCDC85BQ15834 U6.99-201ENST00000637524 83 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CCDC85BQ15834 MTND5P7-201ENST00000413558 1798 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CCDC85BQ15834 FAM107B-229ENST00000622567 3510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
CCDC85BQ15834 LINC02432-202ENST00000509161 2839 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
CCDC85BQ15834 N4BP2L2-202ENST00000357505 2917 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
CCDC85BQ15834 ELF2-203ENST00000379550 3278 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CCDC85BQ15834 CENPE-202ENST00000380026 8241 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
CCDC85BQ15834 ZFHX4-207ENST00000521891 14019 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CCDC85BQ15834 UNC13C-201ENST00000260323 12946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CCDC85BQ15834 ZBED5-201ENST00000413761 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
CCDC85BQ15834 POSTN-210ENST00000541481 3113 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
CCDC85BQ15834 NUTM2B-AS1-213ENST00000619625 7611 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CCDC85BQ15834 MT-ND1-201ENST00000361390 956 ntAPPRIS P1 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CCDC85BQ15834 RNU6-874P-201ENST00000362390 105 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CCDC85BQ15834 SNORA5A-201ENST00000384111 134 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CCDC85BQ15834 RNU6-72P-201ENST00000384285 79 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CCDC85BQ15834 Y_RNA.551-201ENST00000384661 102 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CCDC85BQ15834 RN7SKP156-201ENST00000410308 342 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CCDC85BQ15834 RPL21P91-201ENST00000429231 479 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CCDC85BQ15834 AL512844.2-201ENST00000433990 593 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CCDC85BQ15834 PCNPP5-201ENST00000452246 481 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CCDC85BQ15834 AC079354.2-201ENST00000453523 154 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CCDC85BQ15834 AL354824.2-201ENST00000458004 446 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CCDC85BQ15834 RPS29P27-201ENST00000463711 170 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CCDC85BQ15834 RPL30P10-201ENST00000488148 337 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CCDC85BQ15834 AC109927.1-202ENST00000511951 282 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CCDC85BQ15834 RPL23AP94-201ENST00000512518 302 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CCDC85BQ15834 AP001189.6-201ENST00000528781 831 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
CCDC85BQ15834 AC092747.1-201ENST00000538920 351 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CCDC85BQ15834 MIR4782-201ENST00000577987 79 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CCDC85BQ15834 Z84484.1-202ENST00000612718 60 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CCDC85BQ15834 AL513314.2-204ENST00000619187 459 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CCDC85BQ15834 AC090617.7-201ENST00000623952 126 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CCDC85BQ15834 ATF7IP2-202ENST00000356427 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
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