Protein–RNA interactions for Protein: Q15361

TTF1, Transcription termination factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF1Q15361 RNA5SP31-201ENST00000411144 127 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
TTF1Q15361 UBE2Q2P12-201ENST00000414573 204 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
TTF1Q15361 MTND1P23-201ENST00000416931 372 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
TTF1Q15361 RPL7P10-201ENST00000417407 739 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
TTF1Q15361 U51244.1-201ENST00000423120 374 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
TTF1Q15361 AL583843.1-201ENST00000456070 346 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
TTF1Q15361 HMGN1P18-201ENST00000457642 277 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
TTF1Q15361 AC121764.3-201ENST00000465946 384 ntTSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
TTF1Q15361 PLCH1-AS2-201ENST00000472913 408 ntTSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
TTF1Q15361 CFAP44-AS1-201ENST00000473329 396 ntTSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
TTF1Q15361 RPS29P25-201ENST00000481709 171 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
TTF1Q15361 Y_RNA.654-201ENST00000497848 106 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
TTF1Q15361 MIR892C-201ENST00000516410 77 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
TTF1Q15361 FAM92A-209ENST00000519679 538 ntTSL 4 BASIC3.87□□□□□ -1.79
TTF1Q15361 AL133241.1-201ENST00000556832 487 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
TTF1Q15361 MIR5583-1-201ENST00000580941 59 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
TTF1Q15361 AC012493.2-201ENST00000595083 291 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
TTF1Q15361 AC073539.2-201ENST00000597113 165 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
TTF1Q15361 ESRRAP2-204ENST00000606337 280 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
TTF1Q15361 ADARB1-213ENST00000611195 159 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
TTF1Q15361 RMST_3.1-201ENST00000611651 109 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
TTF1Q15361 uc_338.25-201ENST00000613756 156 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
TTF1Q15361 5S_rRNA.12-201ENST00000617631 107 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
TTF1Q15361 AC018692.3-201ENST00000623929 123 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
TTF1Q15361 ABCD2-201ENST00000308666 6238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
TTF1Q15361 FILIP1L-206ENST00000471562 2854 ntTSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
TTF1Q15361 ACTR6-212ENST00000552376 1659 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
TTF1Q15361 IL1RL1-204ENST00000409584 2693 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
TTF1Q15361 ZNF705G-201ENST00000400156 3644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
TTF1Q15361 MUC7-202ENST00000413702 2540 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC3.86□□□□□ -1.79
TTF1Q15361 RNU1-75P-201ENST00000347264 129 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
TTF1Q15361 RNU1-105P-201ENST00000363470 161 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
TTF1Q15361 RNU4-20P-201ENST00000365601 151 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
TTF1Q15361 SNORA75B-201ENST00000384053 137 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
TTF1Q15361 SNORA7.4-201ENST00000384249 137 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
TTF1Q15361 MIR491-201ENST00000384877 84 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
TTF1Q15361 TRAV39-201ENST00000390466 331 ntAPPRIS P1 BASIC3.86□□□□□ -1.79
TTF1Q15361 RPS4XP7-201ENST00000406274 780 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
TTF1Q15361 RNU6-607P-201ENST00000411283 108 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
TTF1Q15361 BPY2DP-201ENST00000422208 265 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
TTF1Q15361 SRIP2-201ENST00000428470 166 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
TTF1Q15361 RPL23AP83-201ENST00000434984 473 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
TTF1Q15361 MTCO3P18-201ENST00000440206 761 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
TTF1Q15361 CYCSP32-201ENST00000440548 321 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
TTF1Q15361 AC098831.1-201ENST00000440661 216 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
TTF1Q15361 PLCXD2-AS1-201ENST00000493131 491 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
TTF1Q15361 PRDX4P1-201ENST00000507189 574 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
TTF1Q15361 AC097375.2-201ENST00000510416 579 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
TTF1Q15361 AC092747.1-202ENST00000540595 380 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
TTF1Q15361 LINC00933-203ENST00000559812 219 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
TTF1Q15361 AC234778.2-201ENST00000566241 354 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
TTF1Q15361 LRRC37A5P-203ENST00000580181 585 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
TTF1Q15361 HMGN2P15-201ENST00000585707 270 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
TTF1Q15361 RNU6-89P-201ENST00000606519 100 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
TTF1Q15361 RMST_4.1-201ENST00000616886 107 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
TTF1Q15361 AC244517.5-202ENST00000623741 500 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
TTF1Q15361 AGTR1-204ENST00000418473 2071 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
TTF1Q15361 ZBED5-201ENST00000413761 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
TTF1Q15361 SLC8A1-207ENST00000406785 20987 ntTSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
TTF1Q15361 ROCK1P1-203ENST00000608049 2457 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
TTF1Q15361 OSTN-202ENST00000445281 3134 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
TTF1Q15361 ZNF280C-201ENST00000370978 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
TTF1Q15361 NEB-204ENST00000409198 20637 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
TTF1Q15361 RNA5SP139-201ENST00000364340 117 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
TTF1Q15361 BX682237.1-201ENST00000415016 335 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
TTF1Q15361 AC009161.1-201ENST00000417306 376 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
TTF1Q15361 AL355989.1-202ENST00000419406 408 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
TTF1Q15361 AL159169.1-201ENST00000421119 127 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
TTF1Q15361 LINC01402-201ENST00000422226 279 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
TTF1Q15361 BX679664.1-201ENST00000434429 253 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
TTF1Q15361 AL135923.2-201ENST00000435444 501 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
TTF1Q15361 AL049830.2-201ENST00000480072 201 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
TTF1Q15361 RPS29P20-201ENST00000489592 171 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
TTF1Q15361 CCDC34P1-201ENST00000507441 517 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
TTF1Q15361 MTND3P25-201ENST00000509243 135 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
TTF1Q15361 HIGD1AP13-201ENST00000509878 289 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
TTF1Q15361 RNU6-189P-201ENST00000516120 101 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
TTF1Q15361 AC078814.3-201ENST00000553036 491 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
TTF1Q15361 OR11H5P-201ENST00000554039 926 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
TTF1Q15361 DNAJC8P1-201ENST00000554535 372 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
TTF1Q15361 C8orf59-212ENST00000615697 483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
TTF1Q15361 AL031601.2-202ENST00000622650 282 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
TTF1Q15361 DCUN1D1-208ENST00000632685 3147 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
TTF1Q15361 GABRG2-229ENST00000641017 3628 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
TTF1Q15361 RNU6-799P-201ENST00000363567 107 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
TTF1Q15361 SNORD14B-201ENST00000364533 90 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
TTF1Q15361 EIF4EBP2P3-201ENST00000403144 334 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
TTF1Q15361 POLHP1-201ENST00000411806 470 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
TTF1Q15361 AC245291.1-201ENST00000419501 328 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
TTF1Q15361 ZFY-AS1-202ENST00000431145 419 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
TTF1Q15361 AC115115.1-201ENST00000449927 248 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
TTF1Q15361 AC098820.1-201ENST00000453157 512 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
TTF1Q15361 AC006539.3-201ENST00000454258 129 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
TTF1Q15361 BTF3P15-201ENST00000455606 336 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
TTF1Q15361 AL136097.1-201ENST00000456945 913 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
TTF1Q15361 RNU6-1208P-201ENST00000459588 107 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
TTF1Q15361 LINC00971-201ENST00000482721 535 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
TTF1Q15361 RNU6-358P-201ENST00000516564 75 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
TTF1Q15361 AC069113.1-201ENST00000517763 267 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
TTF1Q15361 AC022634.1-201ENST00000520765 532 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.1 ms