Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 SEMG1-201ENST00000372781 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
PDCD1Q15116 DTNA-208ENST00000554864 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
PDCD1Q15116 AC066616.2-201ENST00000559334 1481 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PDCD1Q15116 STON1-GTF2A1L-202ENST00000394754 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
PDCD1Q15116 LRFN5-204ENST00000554171 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
PDCD1Q15116 MIR448-201ENST00000362131 111 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PDCD1Q15116 Y_RNA.5-201ENST00000362334 102 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PDCD1Q15116 Y_RNA.126-201ENST00000363382 111 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PDCD1Q15116 RNU6-336P-201ENST00000364891 107 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PDCD1Q15116 SNORD6-201ENST00000365444 73 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PDCD1Q15116 LINC00862-202ENST00000367356 759 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
PDCD1Q15116 RNU6-639P-201ENST00000384074 107 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PDCD1Q15116 Y_RNA.428-201ENST00000384078 102 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PDCD1Q15116 RNA5SP36-201ENST00000410197 133 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PDCD1Q15116 RN7SKP27-201ENST00000410684 333 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PDCD1Q15116 PMCHL1-202ENST00000423102 261 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PDCD1Q15116 AC099799.1-201ENST00000439809 192 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PDCD1Q15116 AC010099.1-201ENST00000455434 375 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PDCD1Q15116 UQCRHP4-201ENST00000471686 272 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PDCD1Q15116 AC069499.1-201ENST00000489433 509 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PDCD1Q15116 RPS29P20-201ENST00000489592 171 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PDCD1Q15116 AC116655.1-201ENST00000508324 901 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PDCD1Q15116 SNORA31.1-201ENST00000515993 133 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PDCD1Q15116 SNORA31.5-201ENST00000516190 133 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PDCD1Q15116 MRPL49P2-201ENST00000521066 465 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PDCD1Q15116 AP000867.2-201ENST00000532468 320 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PDCD1Q15116 AC006064.5-201ENST00000541782 248 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PDCD1Q15116 MTCO3P13-201ENST00000577757 781 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PDCD1Q15116 ZFP30-209ENST00000589018 444 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
PDCD1Q15116 AC016925.2-201ENST00000605108 242 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PDCD1Q15116 AL355802.3-201ENST00000607571 545 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PDCD1Q15116 AC114781.5-201ENST00000615297 108 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PDCD1Q15116 AC097478.4-201ENST00000615968 522 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
PDCD1Q15116 WDR49-201ENST00000308378 2594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
PDCD1Q15116 MTND5P30-201ENST00000452896 1731 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PDCD1Q15116 AL591441.1-201ENST00000618108 2247 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
PDCD1Q15116 PREPL-206ENST00000409936 5212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
PDCD1Q15116 TECRL-202ENST00000507440 2876 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
PDCD1Q15116 BCLAF1-214ENST00000531224 7263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
PDCD1Q15116 EMSY-210ENST00000529032 6848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
PDCD1Q15116 KLHL13-208ENST00000541812 3102 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
PDCD1Q15116 OXR1-206ENST00000449762 2621 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
PDCD1Q15116 ANKRD28-215ENST00000624145 6383 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
PDCD1Q15116 AL158163.1-201ENST00000603915 1649 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PDCD1Q15116 CCDC102B-201ENST00000360242 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
PDCD1Q15116 CD36-221ENST00000534394 1741 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
PDCD1Q15116 LINC00971-202ENST00000484892 7308 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
PDCD1Q15116 MGAT4A-204ENST00000414521 3709 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
PDCD1Q15116 RNA5SP388-201ENST00000362584 119 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PDCD1Q15116 SNORA22B-201ENST00000383876 138 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PDCD1Q15116 RNU6-198P-201ENST00000384258 104 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PDCD1Q15116 MIR606-201ENST00000384851 96 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PDCD1Q15116 RNU6-1077P-201ENST00000410506 102 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PDCD1Q15116 AC096664.2-201ENST00000411843 406 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PDCD1Q15116 AC245291.1-201ENST00000419501 328 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PDCD1Q15116 AL669831.2-201ENST00000422528 456 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
PDCD1Q15116 CEP57L1P1-201ENST00000430943 1201 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PDCD1Q15116 HMGN2P20-201ENST00000437531 273 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PDCD1Q15116 AL136369.1-201ENST00000437825 244 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
PDCD1Q15116 CYCSP32-201ENST00000440548 321 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PDCD1Q15116 LINC01162-201ENST00000447262 447 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
PDCD1Q15116 AL356859.1-201ENST00000449180 414 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
PDCD1Q15116 AL591504.1-201ENST00000450681 414 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
PDCD1Q15116 IGKV2D-30-201ENST00000474213 395 ntAPPRIS P1 BASIC3.59□□□□□ -1.83
PDCD1Q15116 RPL17P19-201ENST00000489069 552 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PDCD1Q15116 LINC02494-201ENST00000509824 427 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
PDCD1Q15116 AC006499.6-201ENST00000511169 607 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PDCD1Q15116 RNU6-1045P-201ENST00000516321 107 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PDCD1Q15116 SNORA31.18-201ENST00000517043 134 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PDCD1Q15116 SNORD116.3-201ENST00000517176 78 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PDCD1Q15116 RN7SKP295-201ENST00000517264 153 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PDCD1Q15116 SPTY2D1-AS1-203ENST00000542172 331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
PDCD1Q15116 LINC02095-202ENST00000543512 323 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
PDCD1Q15116 AC063950.1-201ENST00000552036 308 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PDCD1Q15116 ARF4P1-201ENST00000605447 541 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PDCD1Q15116 MIR432-201ENST00000606207 94 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PDCD1Q15116 AC012603.1-201ENST00000606424 528 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PDCD1Q15116 AC016747.2-202ENST00000607743 332 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
PDCD1Q15116 AC064801.1-201ENST00000612025 407 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PDCD1Q15116 AC083806.3-201ENST00000614016 455 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PDCD1Q15116 IPO11-202ENST00000409296 3564 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.84
PDCD1Q15116 DMD-230ENST00000620040 13746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.84
PDCD1Q15116 MYOT-201ENST00000239926 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
PDCD1Q15116 HAUS6P2-201ENST00000433254 2404 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
PDCD1Q15116 EFR3A-208ENST00000637848 2547 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.84
PDCD1Q15116 RFX7-201ENST00000559447 10426 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PDCD1Q15116 MGA-202ENST00000545763 11413 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PDCD1Q15116 UBE3AP2-201ENST00000429033 2259 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PDCD1Q15116 ABCC9-201ENST00000261200 8293 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PDCD1Q15116 FAM126A-204ENST00000432176 13177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
PDCD1Q15116 RPAP2-203ENST00000610020 16993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
PDCD1Q15116 TAB3-204ENST00000378932 3698 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
PDCD1Q15116 Y_RNA.132-201ENST00000363421 102 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PDCD1Q15116 RNA5SP513-201ENST00000364648 118 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PDCD1Q15116 RNA5SP479-201ENST00000364858 117 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PDCD1Q15116 RNU1-115P-201ENST00000365329 160 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PDCD1Q15116 RNU1-64P-201ENST00000365443 163 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PDCD1Q15116 RNA5SP366-201ENST00000365454 123 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PDCD1Q15116 RNU6-1160P-201ENST00000384546 104 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PDCD1Q15116 BTF3L4P2-201ENST00000392798 346 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
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