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| SEMA3A | Q14563 | MDM2-205 | ENST00000348801 | 798 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.41 | □□□□□ -1.86 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RNU6-799P-201 | ENST00000363567 | 107 nt | BASIC | 3.41 | □□□□□ -1.86 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RNU6-38P-201 | ENST00000384085 | 107 nt | BASIC | 3.41 | □□□□□ -1.86 | | |
| SEMA3A | Q14563 | CD3D-202 | ENST00000392884 | 476 nt | TSL 2 BASIC | 3.41 | □□□□□ -1.86 | | |
| SEMA3A | Q14563 | DEFB110-202 | ENST00000393660 | 189 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 3.41 | □□□□□ -1.86 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AL606923.1-201 | ENST00000406616 | 190 nt | BASIC | 3.41 | □□□□□ -1.86 | | |
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| SEMA3A | Q14563 | Z99755.1-201 | ENST00000414048 | 380 nt | BASIC | 3.41 | □□□□□ -1.86 | | |
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| SEMA3A | Q14563 | Z82205.1-201 | ENST00000428456 | 297 nt | BASIC | 3.41 | □□□□□ -1.86 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AL591212.2-201 | ENST00000433923 | 257 nt | BASIC | 3.41 | □□□□□ -1.86 | | |
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| SEMA3A | Q14563 | RN7SKP282-201 | ENST00000516824 | 299 nt | BASIC | 3.41 | □□□□□ -1.86 | | |
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| SEMA3A | Q14563 | AL138889.2-201 | ENST00000603883 | 242 nt | BASIC | 3.41 | □□□□□ -1.86 | | |
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| SEMA3A | Q14563 | AC093913.1-201 | ENST00000614178 | 329 nt | BASIC | 3.41 | □□□□□ -1.86 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC034102.8-201 | ENST00000615146 | 484 nt | BASIC | 3.41 | □□□□□ -1.86 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AP001486.3-201 | ENST00000615334 | 372 nt | BASIC | 3.41 | □□□□□ -1.86 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC090971.5-201 | ENST00000621102 | 293 nt | BASIC | 3.41 | □□□□□ -1.86 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC006355.2-201 | ENST00000629240 | 317 nt | TSL 3 BASIC | 3.41 | □□□□□ -1.86 | | |
| SEMA3A | Q14563 | MACC1-205 | ENST00000589011 | 2686 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 3.41 | □□□□□ -1.86 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AL356274.2-201 | ENST00000624379 | 3752 nt | BASIC | 3.41 | □□□□□ -1.86 | | |
| SEMA3A | Q14563 | FBXO11-201 | ENST00000402508 | 3844 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.41 | □□□□□ -1.86 | | |
| SEMA3A | Q14563 | SUGT1-201 | ENST00000310528 | 14131 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 3.41 | □□□□□ -1.86 | | |
| SEMA3A | Q14563 | ABCC9-202 | ENST00000261201 | 4650 nt | APPRIS ALT1 TSL 5 BASIC | 3.41 | □□□□□ -1.86 | | |
| SEMA3A | Q14563 | MME-211 | ENST00000492661 | 2854 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 3.41 | □□□□□ -1.86 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC091564.4-201 | ENST00000533934 | 2194 nt | BASIC | 3.41 | □□□□□ -1.86 | | |
| SEMA3A | Q14563 | KCNH7-204 | ENST00000618399 | 3713 nt | TSL 5 BASIC | 3.41 | □□□□□ -1.86 | | |
| SEMA3A | Q14563 | MTND4P27-201 | ENST00000450813 | 1354 nt | BASIC | 3.4 | □□□□□ -1.86 | | |
| SEMA3A | Q14563 | ZBTB26-202 | ENST00000373656 | 4443 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.4 | □□□□□ -1.86 | | |
| SEMA3A | Q14563 | MBNL1-223 | ENST00000498502 | 5258 nt | TSL 5 BASIC | 3.4 | □□□□□ -1.87 | | |
| SEMA3A | Q14563 | SYCP2-201 | ENST00000357552 | 5567 nt | APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC | 3.4 | □□□□□ -1.87 | | |
| SEMA3A | Q14563 | LINC00587-201 | ENST00000374801 | 590 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.4 | □□□□□ -1.87 | | |
| SEMA3A | Q14563 | Y_RNA.387-201 | ENST00000383918 | 102 nt | BASIC | 3.4 | □□□□□ -1.87 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RNU6-1027P-201 | ENST00000383998 | 107 nt | BASIC | 3.4 | □□□□□ -1.87 | | |
| SEMA3A | Q14563 | MS4A4E-201 | ENST00000398984 | 479 nt | TSL 5 BASIC | 3.4 | □□□□□ -1.87 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RNU4-46P-201 | ENST00000410818 | 138 nt | BASIC | 3.4 | □□□□□ -1.87 | | |
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| SEMA3A | Q14563 | AC090952.1-201 | ENST00000424242 | 446 nt | TSL 3 BASIC | 3.4 | □□□□□ -1.87 | | |
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| SEMA3A | Q14563 | AL162395.1-201 | ENST00000457882 | 422 nt | BASIC | 3.4 | □□□□□ -1.87 | | |
| SEMA3A | Q14563 | Y_RNA.639-201 | ENST00000458981 | 102 nt | BASIC | 3.4 | □□□□□ -1.87 | | |
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| SEMA3A | Q14563 | AC087588.1-201 | ENST00000462203 | 316 nt | BASIC | 3.4 | □□□□□ -1.87 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC027575.1-201 | ENST00000481064 | 460 nt | BASIC | 3.4 | □□□□□ -1.87 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RPS15AP34-201 | ENST00000487776 | 387 nt | BASIC | 3.4 | □□□□□ -1.87 | | |
| SEMA3A | Q14563 | LINC02146-201 | ENST00000504244 | 509 nt | TSL 3 BASIC | 3.4 | □□□□□ -1.87 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC110768.1-201 | ENST00000509222 | 400 nt | BASIC | 3.4 | □□□□□ -1.87 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RNU4-29P-201 | ENST00000515943 | 174 nt | BASIC | 3.4 | □□□□□ -1.87 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RNU6-1038P-201 | ENST00000516516 | 104 nt | BASIC | 3.4 | □□□□□ -1.87 | | |
| SEMA3A | Q14563 | IGKV2-26-201 | ENST00000518305 | 343 nt | BASIC | 3.4 | □□□□□ -1.87 | | |
| SEMA3A | Q14563 | NCRNA00250-201 | ENST00000519500 | 519 nt | TSL 4 BASIC | 3.4 | □□□□□ -1.87 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC124290.1-202 | ENST00000523342 | 387 nt | TSL 3 BASIC | 3.4 | □□□□□ -1.87 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC007458.1-201 | ENST00000542812 | 373 nt | BASIC | 3.4 | □□□□□ -1.87 | | |
| SEMA3A | Q14563 | LINC02300-201 | ENST00000549742 | 665 nt | TSL 4 BASIC | 3.4 | □□□□□ -1.87 | | |
| SEMA3A | Q14563 | G2E3-AS1-202 | ENST00000550118 | 609 nt | TSL 5 BASIC | 3.4 | □□□□□ -1.87 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC005476.1-201 | ENST00000554427 | 397 nt | BASIC | 3.4 | □□□□□ -1.87 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC023510.1-201 | ENST00000555862 | 490 nt | TSL 2 BASIC | 3.4 | □□□□□ -1.87 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC009145.1-201 | ENST00000563230 | 433 nt | TSL 3 BASIC | 3.4 | □□□□□ -1.87 | | |
| SEMA3A | Q14563 | MIR3942-201 | ENST00000585264 | 109 nt | BASIC | 3.4 | □□□□□ -1.87 | | |
| SEMA3A | Q14563 | IGKV1OR2-6-201 | ENST00000603485 | 277 nt | BASIC | 3.4 | □□□□□ -1.87 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC107294.1-201 | ENST00000609524 | 467 nt | BASIC | 3.4 | □□□□□ -1.87 | | |
| SEMA3A | Q14563 | LINC01002-215 | ENST00000632203 | 314 nt | TSL 5 BASIC | 3.4 | □□□□□ -1.87 | | |
| SEMA3A | Q14563 | IL33-203 | ENST00000456383 | 2501 nt | TSL 5 BASIC | 3.4 | □□□□□ -1.87 | | |
| SEMA3A | Q14563 | MME-216 | ENST00000615825 | 5523 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.4 | □□□□□ -1.87 | | |
| SEMA3A | Q14563 | TUSC7-203 | ENST00000477539 | 2415 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.4 | □□□□□ -1.87 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AKAP7-209 | ENST00000541650 | 2008 nt | TSL 5 BASIC | 3.39 | □□□□□ -1.87 | | |
| SEMA3A | Q14563 | LINC01592-202 | ENST00000518540 | 2367 nt | TSL 2 BASIC | 3.39 | □□□□□ -1.87 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC004972.1-201 | ENST00000623934 | 2209 nt | BASIC | 3.39 | □□□□□ -1.87 | | |
| SEMA3A | Q14563 | Y_RNA.31-201 | ENST00000362574 | 102 nt | BASIC | 3.39 | □□□□□ -1.87 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RNU6-552P-201 | ENST00000362869 | 119 nt | BASIC | 3.39 | □□□□□ -1.87 | | |
| SEMA3A | Q14563 | Y_RNA.167-201 | ENST00000363735 | 109 nt | BASIC | 3.39 | □□□□□ -1.87 | | |
| SEMA3A | Q14563 | Y_RNA.301-201 | ENST00000364990 | 103 nt | BASIC | 3.39 | □□□□□ -1.87 | | |
| SEMA3A | Q14563 | SNORA62.3-201 | ENST00000365110 | 153 nt | BASIC | 3.39 | □□□□□ -1.87 | | |
| SEMA3A | Q14563 | SNORA4.3-201 | ENST00000365564 | 137 nt | BASIC | 3.39 | □□□□□ -1.87 | | |
| SEMA3A | Q14563 | OR51A4-201 | ENST00000380373 | 1002 nt | APPRIS P1 BASIC | 3.39 | □□□□□ -1.87 | | |
| SEMA3A | Q14563 | Y_RNA.384-201 | ENST00000383909 | 102 nt | BASIC | 3.39 | □□□□□ -1.87 | | |