Protein–RNA interactions for Protein: Q14511

NEDD9, Enhancer of filamentation 1, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD9Q14511 AC104237.1-201ENST00000527443 539 ntTSL 4 BASIC3.22□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 AP005435.4-201ENST00000529514 284 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 AC109635.3-201ENST00000529536 185 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 AC068205.1-204ENST00000532989 481 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 LINC01495-202ENST00000534135 343 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 AC092747.1-201ENST00000538920 351 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 AL512310.1-201ENST00000548639 172 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 RPL23AP84-201ENST00000571193 464 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 AC008521.1-201ENST00000587471 187 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 AC104365.1-201ENST00000588835 394 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 AC104763.2-201ENST00000604179 382 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 ATP1B3P1-201ENST00000605365 821 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 AL365204.3-201ENST00000612448 685 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 ATM-228ENST00000639240 498 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 ATM-230ENST00000640388 578 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 MBNL3-205ENST00000370857 8760 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 MTND5P17-201ENST00000418405 1603 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 LCOR-205ENST00000421806 16004 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 AL589740.1-207ENST00000607823 1962 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 AGTR1-204ENST00000418473 2071 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.89
NEDD9Q14511 Y_RNA.89-201ENST00000363031 102 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
NEDD9Q14511 RNU6-996P-201ENST00000365438 107 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
NEDD9Q14511 MDM2-208ENST00000393410 732 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
NEDD9Q14511 MIR1277-201ENST00000408536 78 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
NEDD9Q14511 MTND1P2-201ENST00000430604 821 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
NEDD9Q14511 LINC00844-201ENST00000432535 477 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
NEDD9Q14511 DDX3P2-201ENST00000446138 111 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
NEDD9Q14511 NFU1P2-201ENST00000448700 469 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
NEDD9Q14511 NHS-AS1-201ENST00000452788 366 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
NEDD9Q14511 IFT74-AS1-201ENST00000456198 405 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
NEDD9Q14511 AL160162.1-201ENST00000456715 442 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
NEDD9Q14511 RNU7-182P-201ENST00000459009 62 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
NEDD9Q14511 AC092944.1-205ENST00000494885 517 ntTSL 4 BASIC3.21□□□□□ -1.9
NEDD9Q14511 AC074124.1-201ENST00000502368 375 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
NEDD9Q14511 AC117522.3-201ENST00000507974 584 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
NEDD9Q14511 RNU6-123P-201ENST00000516163 102 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
NEDD9Q14511 RNU6-927P-201ENST00000516199 100 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
NEDD9Q14511 OR5BN1P-201ENST00000532955 829 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
NEDD9Q14511 AHI1-217ENST00000534469 680 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
NEDD9Q14511 AL133241.1-201ENST00000556832 487 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
NEDD9Q14511 AC026462.2-201ENST00000565771 286 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
NEDD9Q14511 FOPNL-205ENST00000573429 646 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
NEDD9Q14511 AC002545.1-201ENST00000592511 181 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
NEDD9Q14511 BNIP3P30-201ENST00000601184 574 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
NEDD9Q14511 RBM11P1-201ENST00000604951 799 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
NEDD9Q14511 AL158032.1-201ENST00000605401 106 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
NEDD9Q14511 AC010338.1-201ENST00000621823 717 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
NEDD9Q14511 EFCAB5-213ENST00000638539 168 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
NEDD9Q14511 MUC7-202ENST00000413702 2540 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC3.2□□□□□ -1.9
NEDD9Q14511 RNU6-534P-201ENST00000364877 106 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
NEDD9Q14511 CD24P4-201ENST00000382840 243 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
NEDD9Q14511 MIR181B1-201ENST00000385240 110 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
NEDD9Q14511 SNORA11.2-201ENST00000408318 127 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
NEDD9Q14511 RNU6-1068P-201ENST00000410958 103 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
NEDD9Q14511 RPL36AP6-201ENST00000435770 321 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
NEDD9Q14511 MTND4P25-201ENST00000441039 533 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
NEDD9Q14511 AL136972.1-201ENST00000443471 351 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
NEDD9Q14511 CBWD4P-201ENST00000445695 655 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
NEDD9Q14511 AC073415.1-201ENST00000449240 153 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
NEDD9Q14511 AL024497.2-201ENST00000457081 317 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
NEDD9Q14511 RNU6-261P-201ENST00000459506 102 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
NEDD9Q14511 AC105389.2-201ENST00000506475 435 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
NEDD9Q14511 AC104806.1-201ENST00000508720 308 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
NEDD9Q14511 RN7SKP219-201ENST00000516825 296 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
NEDD9Q14511 CASP1P1-201ENST00000526345 212 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
NEDD9Q14511 CLEC2D-214ENST00000543300 399 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
NEDD9Q14511 CLEC2D-216ENST00000545918 288 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
NEDD9Q14511 AC078778.1-201ENST00000547177 735 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
NEDD9Q14511 PCLAF-207ENST00000559519 749 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
NEDD9Q14511 MIR3162-201ENST00000581818 82 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
NEDD9Q14511 AC034102.8-201ENST00000615146 484 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
NEDD9Q14511 C4orf22-209ENST00000621014 228 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
NEDD9Q14511 YWHAEP7-203ENST00000622054 312 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
NEDD9Q14511 MTND5P42-201ENST00000637720 498 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
NEDD9Q14511 LINC01376-202ENST00000424895 1949 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
NEDD9Q14511 THNSL1-201ENST00000376356 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
NEDD9Q14511 AC008568.2-201ENST00000623862 2313 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
NEDD9Q14511 FAM214A-201ENST00000261844 4217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
NEDD9Q14511 AMY2B-208ENST00000610648 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
NEDD9Q14511 AP003122.5-201ENST00000527668 3766 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
NEDD9Q14511 TMEM232-201ENST00000455884 2501 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
NEDD9Q14511 AL137003.2-201ENST00000606924 2538 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
NEDD9Q14511 RNU6-512P-201ENST00000364438 103 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
NEDD9Q14511 Y_RNA.255-201ENST00000364581 97 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
NEDD9Q14511 Y_RNA.295-201ENST00000364918 102 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
NEDD9Q14511 MIR325-201ENST00000385260 98 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
NEDD9Q14511 RNA5SP184-201ENST00000411071 108 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
NEDD9Q14511 RPS12P24-201ENST00000412619 387 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
NEDD9Q14511 USP9YP6-201ENST00000413550 854 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
NEDD9Q14511 AC007919.1-201ENST00000429380 217 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
NEDD9Q14511 AC000111.3-201ENST00000433478 193 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
NEDD9Q14511 AC092573.2-201ENST00000434546 243 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
NEDD9Q14511 AL157882.1-201ENST00000447148 429 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
NEDD9Q14511 AL136164.1-201ENST00000456795 352 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
NEDD9Q14511 AC046136.1-201ENST00000459855 533 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
NEDD9Q14511 AC008571.1-201ENST00000467232 300 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
NEDD9Q14511 GMFBP1-201ENST00000467831 427 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
NEDD9Q14511 AL163973.1-201ENST00000484753 577 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
NEDD9Q14511 MTAPP1-201ENST00000489154 819 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
NEDD9Q14511 AC104304.1-201ENST00000505797 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
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