Protein–RNA interactions for Protein: Q13956

PDE6H, Retinal cone rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6HQ13956 MAST4-AS1-201ENST00000451496 777 ntTSL 2 BASIC1.02□□□□□ -2.25
PDE6HQ13956 GUCA1C-203ENST00000471108 633 ntTSL 2 BASIC1.02□□□□□ -2.25
PDE6HQ13956 AC082650.1-201ENST00000503542 575 ntTSL 4 BASIC1.02□□□□□ -2.25
PDE6HQ13956 AC021146.2-201ENST00000504736 556 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
PDE6HQ13956 FAM92A1P2-202ENST00000504766 877 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
PDE6HQ13956 TMEM161B-210ENST00000511218 1351 ntTSL 2 BASIC1.02□□□□□ -2.25
PDE6HQ13956 RNU6-970P-201ENST00000516312 107 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
PDE6HQ13956 RNU6-678P-201ENST00000516832 109 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
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PDE6HQ13956 AC025871.1-202ENST00000518819 432 ntTSL 3 BASIC1.02□□□□□ -2.25
PDE6HQ13956 CA1-215ENST00000522389 551 ntTSL 3 BASIC1.02□□□□□ -2.25
PDE6HQ13956 OR8K2P-201ENST00000524645 927 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
PDE6HQ13956 AP000776.1-201ENST00000530032 1663 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
PDE6HQ13956 OR5B19P-201ENST00000531766 928 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
PDE6HQ13956 NDUFA5P6-201ENST00000542110 379 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
PDE6HQ13956 HSBP1P1-201ENST00000555205 166 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
PDE6HQ13956 PSMA3P-201ENST00000555485 635 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
PDE6HQ13956 AC026474.1-201ENST00000562422 428 ntTSL 2 BASIC1.02□□□□□ -2.25
PDE6HQ13956 MIR4285-201ENST00000581001 85 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
PDE6HQ13956 AC060771.1-201ENST00000582031 164 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
PDE6HQ13956 ELOCP5-201ENST00000604924 333 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
PDE6HQ13956 AC138627.2-201ENST00000624202 601 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
PDE6HQ13956 FANCD2-213ENST00000625535 117 ntTSL 5 BASIC1.02□□□□□ -2.25
PDE6HQ13956 CD44-239ENST00000639002 528 ntTSL 1 (best) BASIC1.02□□□□□ -2.25
PDE6HQ13956 WWP1P1-201ENST00000466609 2769 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
PDE6HQ13956 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
PDE6HQ13956 RNU5E-1-201ENST00000362477 120 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
PDE6HQ13956 snoZ40.1-201ENST00000364540 72 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
PDE6HQ13956 AC127391.1-201ENST00000411737 98 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
PDE6HQ13956 AC003084.1-201ENST00000427030 435 ntTSL 5 BASIC1.01□□□□□ -2.25
PDE6HQ13956 AL451060.1-203ENST00000431307 362 ntTSL 3 BASIC1.01□□□□□ -2.25
PDE6HQ13956 HMGB3P12-201ENST00000438745 556 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
PDE6HQ13956 ELOCP30-201ENST00000447108 299 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
PDE6HQ13956 AC025947.1-201ENST00000447943 299 ntTSL 5 BASIC1.01□□□□□ -2.25
PDE6HQ13956 KATNBL1P6-201ENST00000453433 915 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
PDE6HQ13956 APOA2-205ENST00000468465 421 ntTSL 2 BASIC1.01□□□□□ -2.25
PDE6HQ13956 OARD1-209ENST00000471367 401 ntTSL 2 BASIC1.01□□□□□ -2.25
PDE6HQ13956 AC114912.1-201ENST00000503394 546 ntTSL 3 BASIC1.01□□□□□ -2.25
PDE6HQ13956 AC104137.1-201ENST00000503625 385 ntTSL 3 BASIC1.01□□□□□ -2.25
PDE6HQ13956 AC024589.1-201ENST00000512207 263 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
PDE6HQ13956 RN7SKP179-201ENST00000516126 217 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
PDE6HQ13956 AC007991.3-201ENST00000517623 502 ntTSL 4 BASIC1.01□□□□□ -2.25
PDE6HQ13956 UTP23-205ENST00000520733 369 ntTSL 3 BASIC1.01□□□□□ -2.25
PDE6HQ13956 AC021451.1-201ENST00000523498 1129 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
PDE6HQ13956 DEFB131D-201ENST00000526803 184 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
PDE6HQ13956 AC136188.1-201ENST00000546770 342 ntTSL 3 BASIC1.01□□□□□ -2.25
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PDE6HQ13956 LINC02211-204ENST00000642024 1070 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
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PDE6HQ13956 AC091812.1-201ENST00000432235 1948 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
PDE6HQ13956 FGF7-202ENST00000560270 1688 ntTSL 1 (best) BASIC1□□□□□ -2.25
PDE6HQ13956 TBC1D15-210ENST00000485960 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1□□□□□ -2.25
PDE6HQ13956 RNU1-57P-201ENST00000384491 166 ntBASIC1□□□□□ -2.25
PDE6HQ13956 CISD1P1-201ENST00000393907 327 ntBASIC1□□□□□ -2.25
PDE6HQ13956 RN7SKP51-201ENST00000410781 304 ntBASIC1□□□□□ -2.25
PDE6HQ13956 AL121904.1-202ENST00000416638 656 ntTSL 5 BASIC1□□□□□ -2.25
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PDE6HQ13956 LINC01676-201ENST00000420901 410 ntTSL 3 BASIC1□□□□□ -2.25
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PDE6HQ13956 AL161937.1-201ENST00000444478 425 ntTSL 3 BASIC1□□□□□ -2.25
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PDE6HQ13956 AC006512.1-201ENST00000468816 291 ntBASIC1□□□□□ -2.25
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PDE6HQ13956 AC026780.2-201ENST00000503489 730 ntTSL 5 BASIC1□□□□□ -2.25
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PDE6HQ13956 LINC02384-205ENST00000539404 785 ntTSL 3 BASIC1□□□□□ -2.25
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PDE6HQ13956 AL132657.2-201ENST00000564417 358 ntBASIC1□□□□□ -2.25
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PDE6HQ13956 AC015813.2-201ENST00000578794 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1□□□□□ -2.25
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PDE6HQ13956 SOX2-OT-224ENST00000595313 716 ntTSL 5 BASIC1□□□□□ -2.25
PDE6HQ13956 AC104819.3-201ENST00000603264 540 ntTSL 4 BASIC1□□□□□ -2.25
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PDE6HQ13956 MIR6134-201ENST00000617606 109 ntBASIC1□□□□□ -2.25
PDE6HQ13956 AC104985.3-201ENST00000623479 597 ntBASIC1□□□□□ -2.25
PDE6HQ13956 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1□□□□□ -2.25
PDE6HQ13956 AC242426.3-202ENST00000607149 2397 ntTSL 5 BASIC1□□□□□ -2.25
PDE6HQ13956 RGS13-201ENST00000391995 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.99□□□□□ -2.25
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