Protein–RNA interactions for Protein: Q13496

MTM1, Myotubularin, humanhuman

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTM1Q13496 RN7SKP289-201ENST00000517244 295 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
MTM1Q13496 AP000755.2-201ENST00000526777 571 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
MTM1Q13496 RGS4-209ENST00000531057 544 ntTSL 4 BASIC3.68□□□□□ -1.82
MTM1Q13496 AC027288.1-203ENST00000552167 567 ntTSL 4 BASIC3.68□□□□□ -1.82
MTM1Q13496 AC099793.1-201ENST00000567538 285 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
MTM1Q13496 AC087463.1-201ENST00000568541 556 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
MTM1Q13496 AC022432.1-201ENST00000595739 310 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
MTM1Q13496 AC110741.2-201ENST00000605278 268 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
MTM1Q13496 PART1_1.1-201ENST00000611761 217 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
MTM1Q13496 UBE2Q2P6-201ENST00000612666 153 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
MTM1Q13496 PISRT1.1-201ENST00000616930 107 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
MTM1Q13496 AC098657.3-201ENST00000620434 263 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
MTM1Q13496 ARID2-206ENST00000457135 4356 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
MTM1Q13496 AC025164.2-202ENST00000499685 5699 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
MTM1Q13496 CEP170-202ENST00000366542 6828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
MTM1Q13496 SNORD62.1-201ENST00000362541 86 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
MTM1Q13496 RNU6-1329P-201ENST00000365664 107 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
MTM1Q13496 SNORA75B-201ENST00000384053 137 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
MTM1Q13496 RNU2-68P-201ENST00000410878 191 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
MTM1Q13496 RHEBP3-201ENST00000411920 351 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
MTM1Q13496 UBE2D3P2-201ENST00000424409 445 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
MTM1Q13496 TOMM20P4-201ENST00000427861 435 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
MTM1Q13496 ZFY-AS1-202ENST00000431145 419 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
MTM1Q13496 AC091286.1-201ENST00000431233 461 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
MTM1Q13496 MYL8P-204ENST00000431574 518 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
MTM1Q13496 AL358232.1-201ENST00000448030 501 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
MTM1Q13496 AL109763.1-201ENST00000455391 461 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
MTM1Q13496 SNORD105B-201ENST00000458770 79 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
MTM1Q13496 MTCYBP40-201ENST00000509390 1135 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
MTM1Q13496 AC104619.4-201ENST00000510773 249 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
MTM1Q13496 AC092436.3-201ENST00000511788 257 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
MTM1Q13496 RNU4ATAC7P-201ENST00000516280 125 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
MTM1Q13496 SNORA70.18-201ENST00000516696 98 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
MTM1Q13496 NDUFB9P3-201ENST00000521269 501 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
MTM1Q13496 IGKV2D-19-201ENST00000523346 262 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
MTM1Q13496 AP003174.2-201ENST00000544663 294 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
MTM1Q13496 AC127894.1-201ENST00000548266 851 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
MTM1Q13496 AC020661.2-201ENST00000560114 134 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
MTM1Q13496 ZNF192P1-203ENST00000565888 810 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
MTM1Q13496 AC019183.1-201ENST00000580524 505 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
MTM1Q13496 AC006077.1-201ENST00000604746 343 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
MTM1Q13496 AL080274.1-201ENST00000605565 220 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
MTM1Q13496 DAOA-AS1_2.1-201ENST00000614829 187 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
MTM1Q13496 AL713922.2-201ENST00000619384 716 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
MTM1Q13496 RMDN2-AS1-204ENST00000626669 448 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
MTM1Q13496 TEX41-300ENST00000631048 69 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
MTM1Q13496 AL669831.3-213ENST00000636676 183 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
MTM1Q13496 FOXP2-227ENST00000638397 240 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
MTM1Q13496 AC009093.8-201ENST00000641769 292 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
MTM1Q13496 TEX30-201ENST00000376019 1689 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
MTM1Q13496 RHOT1-204ENST00000394692 2960 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
MTM1Q13496 ABCD2-201ENST00000308666 6238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
MTM1Q13496 LINC00907-209ENST00000593234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
MTM1Q13496 FNDC3A-202ENST00000398316 5714 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
MTM1Q13496 NETO1-202ENST00000397929 1849 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
MTM1Q13496 MTND5P10-201ENST00000603719 1809 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
MTM1Q13496 KCNT2-202ENST00000367433 5883 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
MTM1Q13496 KPNA2P1-201ENST00000458289 1591 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
MTM1Q13496 CNTN6-201ENST00000350110 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
MTM1Q13496 HMGN5-201ENST00000358130 2126 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
MTM1Q13496 MTCO1P12-201ENST00000414273 1543 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
MTM1Q13496 IL36B-202ENST00000327407 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
MTM1Q13496 SNORA71.3-201ENST00000362582 128 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
MTM1Q13496 SNORD3E-201ENST00000362899 217 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
MTM1Q13496 Y_RNA.162-201ENST00000363683 102 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
MTM1Q13496 MIR325-201ENST00000385260 98 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
MTM1Q13496 LGALS16-201ENST00000392051 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
MTM1Q13496 DBIP2-201ENST00000419076 262 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
MTM1Q13496 AL691515.1-201ENST00000432976 733 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
MTM1Q13496 AL645568.3-201ENST00000433683 316 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
MTM1Q13496 AC012070.1-201ENST00000442062 427 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
MTM1Q13496 IGKV3D-7-201ENST00000443397 384 ntAPPRIS P1 BASIC3.66□□□□□ -1.82
MTM1Q13496 NDUFB1P2-201ENST00000449477 176 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
MTM1Q13496 ELOCP24-201ENST00000456370 334 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
MTM1Q13496 Y_RNA.631-201ENST00000459607 101 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
MTM1Q13496 AC106707.2-201ENST00000484182 374 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
MTM1Q13496 GYPA-208ENST00000512064 441 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
MTM1Q13496 AC097467.3-212ENST00000512269 568 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
MTM1Q13496 Y_RNA.708-201ENST00000516950 96 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
MTM1Q13496 AC025755.1-201ENST00000521306 278 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
MTM1Q13496 AL359237.1-201ENST00000554305 826 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
MTM1Q13496 ELOCP5-201ENST00000604924 333 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
MTM1Q13496 AC004805.2-201ENST00000605382 482 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
MTM1Q13496 LINC02112-205ENST00000606744 236 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
MTM1Q13496 CT45A5-202ENST00000617203 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
MTM1Q13496 HIKESHI-208ENST00000618164 499 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
MTM1Q13496 AL732372.2-225ENST00000642124 456 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
MTM1Q13496 ZNF99-201ENST00000397104 3114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
MTM1Q13496 ERMN-205ENST00000410096 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
MTM1Q13496 NUDT12-201ENST00000230792 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
MTM1Q13496 DMXL1-201ENST00000311085 11072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
MTM1Q13496 AC007823.1-201ENST00000569932 1566 ntBASIC3.65□□□□□ -1.82
MTM1Q13496 AC007685.1-201ENST00000329806 452 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
MTM1Q13496 RNA5SP119-201ENST00000362715 117 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
MTM1Q13496 Y_RNA.445-201ENST00000384168 102 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
MTM1Q13496 RNU6-692P-201ENST00000384496 107 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
MTM1Q13496 SNORA75.4-201ENST00000391278 119 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
MTM1Q13496 RPL5P18-201ENST00000406671 891 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
MTM1Q13496 Y_RNA.623-201ENST00000411128 95 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
MTM1Q13496 AC006150.1-201ENST00000412014 263 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.3 ms