Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 AC011933.3-201ENST00000578226 372 ntTSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
NME3Q13232 AC005357.2-201ENST00000586473 583 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
NME3Q13232 AL356280.1-201ENST00000603614 379 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
NME3Q13232 AL049779.4-201ENST00000604500 156 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
NME3Q13232 AC135507.1-201ENST00000607214 561 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
NME3Q13232 AC008250.2-201ENST00000615261 205 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
NME3Q13232 AC025048.6-202ENST00000627667 438 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
NME3Q13232 CU459211.1-201ENST00000635667 749 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
NME3Q13232 HELLS-201ENST00000239026 2740 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
NME3Q13232 AGTPBP1-205ENST00000376083 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
NME3Q13232 RGS18-201ENST00000367460 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
NME3Q13232 CCDC66-201ENST00000326595 3027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
NME3Q13232 AC006020.1-201ENST00000420179 1854 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
NME3Q13232 AC073343.1-201ENST00000328239 651 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
NME3Q13232 Y_RNA.22-201ENST00000362492 102 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
NME3Q13232 RNU6-1083P-201ENST00000384022 107 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
NME3Q13232 RPS3AP36-201ENST00000398190 775 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
NME3Q13232 RPS4XP7-201ENST00000406274 780 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
NME3Q13232 RNU2-25P-201ENST00000411041 191 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
NME3Q13232 MTND2P18-201ENST00000419962 1030 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
NME3Q13232 AC009299.3-201ENST00000421122 1072 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
NME3Q13232 SLC44A3-AS1-205ENST00000424505 612 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
NME3Q13232 AL512656.1-201ENST00000427492 401 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
NME3Q13232 MYL8P-204ENST00000431574 518 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
NME3Q13232 RPS24P1-201ENST00000438550 371 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
NME3Q13232 LINC01069-201ENST00000452933 546 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
NME3Q13232 AC026801.1-201ENST00000497178 464 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
NME3Q13232 AC092608.1-201ENST00000503505 267 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
NME3Q13232 FAM92A1P2-202ENST00000504766 877 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
NME3Q13232 AC096736.1-201ENST00000512609 947 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
NME3Q13232 AC093206.1-201ENST00000515364 497 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
NME3Q13232 SMIM18-201ENST00000517349 905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
NME3Q13232 SKP1-203ENST00000517625 876 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
NME3Q13232 PRELID2P1-201ENST00000552837 301 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
NME3Q13232 LINC01491-201ENST00000558434 505 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
NME3Q13232 AC007610.2-201ENST00000566770 666 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
NME3Q13232 AC105137.2-201ENST00000569073 466 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
NME3Q13232 MIR3199-1-201ENST00000582434 88 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
NME3Q13232 AC174048.1-201ENST00000603389 144 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
NME3Q13232 AL158032.1-201ENST00000605401 106 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
NME3Q13232 CLECL1-204ENST00000621400 611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
NME3Q13232 FGF7-206ENST00000614567 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
NME3Q13232 EYS-211ENST00000503581 10589 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
NME3Q13232 RNU6-1072P-201ENST00000384703 107 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
NME3Q13232 RNU6-443P-201ENST00000384780 107 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
NME3Q13232 MIR558-201ENST00000384920 94 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
NME3Q13232 RNU6-220P-201ENST00000390919 107 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
NME3Q13232 SNORA40.3-201ENST00000390964 122 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
NME3Q13232 SNORA40C-201ENST00000391285 128 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
NME3Q13232 RNU6ATAC16P-201ENST00000408591 138 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
NME3Q13232 HMGN1P14-201ENST00000412459 517 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
NME3Q13232 AL590730.1-201ENST00000426283 398 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
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NME3Q13232 HTR2A-AS1-201ENST00000430913 429 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
NME3Q13232 AC004383.1-201ENST00000438135 289 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
NME3Q13232 MTND1P26-201ENST00000440488 538 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
NME3Q13232 SNRPGP9-201ENST00000456025 225 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
NME3Q13232 ANKRD62P1-PARP4P3-201ENST00000456726 1181 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
NME3Q13232 OARD1-209ENST00000471367 401 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
NME3Q13232 AC108078.2-201ENST00000510750 236 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
NME3Q13232 AC008413.1-201ENST00000511864 177 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
NME3Q13232 SCARNA24.1-201ENST00000516465 137 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
NME3Q13232 RPPH1-2P-201ENST00000516688 293 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
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NME3Q13232 AC113145.1-201ENST00000522408 412 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
NME3Q13232 MTCYBP20-201ENST00000524239 1129 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
NME3Q13232 AC108471.2-204ENST00000526807 784 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
NME3Q13232 NRBF2P1-201ENST00000587407 859 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
NME3Q13232 BX546450.2-201ENST00000602419 435 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
NME3Q13232 AC126118.1-201ENST00000607744 628 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
NME3Q13232 AL160408.5-201ENST00000607759 526 ntTSL 4 BASIC2.4□□□□□ -2.03
NME3Q13232 AL512625.3-207ENST00000609749 477 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
NME3Q13232 MIR6134-201ENST00000617606 109 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
NME3Q13232 CDC27P3-201ENST00000635418 1910 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
NME3Q13232 LIPJ-201ENST00000371939 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
NME3Q13232 TAS2R13-201ENST00000390677 1637 ntAPPRIS P1 BASIC2.39□□□□□ -2.03
NME3Q13232 AC135776.4-201ENST00000624300 1904 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
NME3Q13232 Y_RNA.33-201ENST00000362591 102 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
NME3Q13232 SNORA20.2-201ENST00000383922 131 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
NME3Q13232 RNU6-641P-201ENST00000384006 107 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
NME3Q13232 RNU6-166P-201ENST00000384371 107 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
NME3Q13232 SNORA24.1-201ENST00000384401 135 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
NME3Q13232 MIR218-1-201ENST00000384999 110 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
NME3Q13232 RNU2-39P-201ENST00000410604 198 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
NME3Q13232 RNU4-53P-201ENST00000410828 140 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
NME3Q13232 RNA5SP508-201ENST00000411327 119 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
NME3Q13232 AC127391.1-201ENST00000411737 98 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
NME3Q13232 AC013401.1-202ENST00000422017 626 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
NME3Q13232 PTGES3P4-201ENST00000426243 356 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
NME3Q13232 AL078601.1-201ENST00000444542 271 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
NME3Q13232 AP001324.2-201ENST00000461163 319 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
NME3Q13232 AC093292.1-201ENST00000505050 449 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
NME3Q13232 AKIRIN2P1-201ENST00000505898 352 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
NME3Q13232 LINC02064-202ENST00000507876 403 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
NME3Q13232 AC117522.2-201ENST00000510049 657 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
NME3Q13232 RPL23AP94-201ENST00000512518 302 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
NME3Q13232 AC118465.1-201ENST00000513820 1271 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
NME3Q13232 RNU6-123P-201ENST00000516163 102 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
NME3Q13232 AC239802.1-201ENST00000531288 406 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
NME3Q13232 MIR1273C-201ENST00000578669 77 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
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