Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 NETO1-202ENST00000397929 1849 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
RPA4Q13156 MIR412-201ENST00000362142 91 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
RPA4Q13156 RNA5SP68-201ENST00000363885 119 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
RPA4Q13156 RNY1P12-201ENST00000364251 105 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
RPA4Q13156 TSHB-202ENST00000369517 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
RPA4Q13156 DEFA7P-201ENST00000382676 285 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
RPA4Q13156 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
RPA4Q13156 RPS4XP7-201ENST00000406274 780 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
RPA4Q13156 RNU2-39P-201ENST00000410604 198 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
RPA4Q13156 RNU2-63P-201ENST00000410792 194 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
RPA4Q13156 RPL7P34-201ENST00000433316 712 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
RPA4Q13156 AC097662.1-205ENST00000433324 241 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
RPA4Q13156 AL353680.1-201ENST00000433788 337 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
RPA4Q13156 AL353706.1-201ENST00000436728 494 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
RPA4Q13156 AL117336.1-201ENST00000439198 380 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
RPA4Q13156 TAF9P1-201ENST00000445421 515 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
RPA4Q13156 SFTA1P-203ENST00000446372 693 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
RPA4Q13156 TAF9P2-201ENST00000454958 515 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
RPA4Q13156 AL583843.1-201ENST00000456070 346 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
RPA4Q13156 RPS3P1-201ENST00000456781 192 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
RPA4Q13156 MRPL42P6-201ENST00000486397 371 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
RPA4Q13156 SRIP1-201ENST00000489235 288 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
RPA4Q13156 AC008526.1-201ENST00000509149 338 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
RPA4Q13156 AC117522.1-201ENST00000509821 380 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
RPA4Q13156 AC108078.2-201ENST00000510750 236 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
RPA4Q13156 RNU4-29P-201ENST00000515943 174 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
RPA4Q13156 OR5AQ1P-201ENST00000527596 927 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
RPA4Q13156 AC127894.1-201ENST00000548266 851 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
RPA4Q13156 LINC01290-201ENST00000566787 502 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
RPA4Q13156 LINC02210-208ENST00000585118 546 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
RPA4Q13156 AL360219.1-201ENST00000610230 366 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
RPA4Q13156 AC012409.4-201ENST00000612923 249 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
RPA4Q13156 AC023490.1-201ENST00000614584 375 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
RPA4Q13156 AC245884.12-201ENST00000615364 59 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
RPA4Q13156 MIR6817-201ENST00000615588 66 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
RPA4Q13156 AC011718.1-201ENST00000622906 375 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
RPA4Q13156 OFD1P6Y-202ENST00000451061 2724 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
RPA4Q13156 ZBED5-201ENST00000413761 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
RPA4Q13156 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
RPA4Q13156 LIPJ-201ENST00000371939 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
RPA4Q13156 RNA5SP456-201ENST00000364002 114 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RPA4Q13156 RPS3AP36-201ENST00000398190 775 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RPA4Q13156 Y_RNA.623-201ENST00000411128 95 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RPA4Q13156 C5orf58-201ENST00000421269 406 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
RPA4Q13156 SLC44A3-AS1-205ENST00000424505 612 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RPA4Q13156 EIF4EP4-201ENST00000424916 578 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RPA4Q13156 AC018693.1-201ENST00000442829 550 ntTSL 4 BASIC2.47□□□□□ -2.01
RPA4Q13156 AL157882.1-201ENST00000447148 429 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
RPA4Q13156 AC112771.1-201ENST00000463581 102 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RPA4Q13156 AC109486.1-201ENST00000486833 374 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RPA4Q13156 AC093689.1-203ENST00000505967 299 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
RPA4Q13156 AC097478.1-204ENST00000509723 547 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
RPA4Q13156 AF213884.2-201ENST00000510417 903 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
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RPA4Q13156 RN7SKP24-201ENST00000515888 284 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
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RPA4Q13156 SNHG6-202ENST00000520619 479 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
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RPA4Q13156 AKIRIN1P1-201ENST00000547384 544 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
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RPA4Q13156 AC012065.4-201ENST00000602445 679 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RPA4Q13156 AC126118.1-201ENST00000607744 628 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RPA4Q13156 AC092142.2-201ENST00000614642 354 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
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RPA4Q13156 AC092656.1-203ENST00000624134 423 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RPA4Q13156 TMPRSS11A-201ENST00000334830 3054 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
RPA4Q13156 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
RPA4Q13156 ZNF271P-202ENST00000465539 1970 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
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RPA4Q13156 TEX9-207ENST00000560582 2005 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
RPA4Q13156 OR56A5-201ENST00000340110 738 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RPA4Q13156 RNU6-641P-201ENST00000384006 107 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RPA4Q13156 SNORA75B-201ENST00000384053 137 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RPA4Q13156 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RPA4Q13156 FTH1P15-201ENST00000406984 280 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RPA4Q13156 U3.37-201ENST00000408528 213 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RPA4Q13156 NPM1P11-201ENST00000417106 855 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RPA4Q13156 AL365338.1-201ENST00000422282 858 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RPA4Q13156 AL365203.2-201ENST00000423444 196 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RPA4Q13156 AL160275.3-201ENST00000423876 471 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RPA4Q13156 GAS5-221ENST00000450589 632 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
RPA4Q13156 AC011753.1-201ENST00000451001 220 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RPA4Q13156 KLF3P2-201ENST00000465138 268 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RPA4Q13156 AC117503.1-201ENST00000472241 394 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RPA4Q13156 LINC02046-202ENST00000481334 390 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
RPA4Q13156 LINC02174-201ENST00000508977 553 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
RPA4Q13156 LINC02290-203ENST00000556662 577 ntTSL 4 BASIC2.46□□□□□ -2.02
RPA4Q13156 AC007598.1-202ENST00000561528 435 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
RPA4Q13156 AC092325.1-201ENST00000566449 554 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RPA4Q13156 AL138963.2-201ENST00000605137 226 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RPA4Q13156 SNORD14A-201ENST00000606526 91 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RPA4Q13156 AC096772.1-201ENST00000609146 564 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RPA4Q13156 AC005696.2-201ENST00000610120 626 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
RPA4Q13156 AC108479.2-201ENST00000617314 601 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RPA4Q13156 U6.42-201ENST00000618440 107 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RPA4Q13156 MIR5739-201ENST00000619803 80 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RPA4Q13156 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC2.46□□□□□ -2.02
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